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  1. Transcript 'KH2012:KH.L14.2.v1.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L14.2.v1.A.nonSL6-1

Possible name(s)

SLC28A1; SLC28A2; SLC28A3

Location

KhL14 [1,459 / 12,854]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 597

>KH.L14.2.v1.A.nonSL6-1
NMGEKEEPIELEECDLEKGEKVKLNEEVEPEVASQKNGRSCIGILLIPVLFLKSFYSERK
TVFKYIFLGLLLTGYMVYFIIAIARDPLAAKPLIILTLVILFLVLYELRFKKLFLLFFKQ
IKSKVHIKKETKNKITRFLPYVQILICVAFCIWLLVDMIIRNPSTLISVVGFIVILVVCI
CASTQPKCINWRPVIWGIGLQFILGLVVLRTSAGYTAIKFIGDQIATFMKYTDSGSTFVF
GYLPSDHIFAFKVLPMIVFFSMVTNMLFYVGLMQWFIAKLAYLTQITLGTSAIESAVAIA
NIFVGMTEAPLIVRPYLPELTKAEIHSVLTTGLASISFSVFGVYIGFGVDGVHLLTACVM
SAPAGLVVSRLLYPEVEKSKFMNTGSLALSAGTNRNIVEAAAAGASMSIKLVANIGANLI
AFLALLAFINATLHWFGAFVGIPQLSFEVICSYLFMPVAFLMGADWEDCFLVGQLFGMKT
FLNEFIAYEAMKPFINNRLNQNVVPKFINGTIQYMSERSEMVAIHALCGFCNVSSLGIII
GGLSVLMPNKKKDLAEMSVRALMGGMIACCMTASISGMLFVEPILASTSNMTATPSP

Nucleotide sequence

Length: 4,258

>KH2012:KH.L14.2.v1.A.nonSL6-1
GTAGCTGTCGTACCAGTTTGGTGTGTATGTGGTTACTGTACGGTTAATGTTTTGCGAGTA
TTGTGGAGCAGAAAAGTATAAGCACGGAAAAAACAATAAAACATGGGAGAAAAGGAAGAA
CCAATCGAACTTGAAGAATGCGATTTAGAGAAAGGGGAAAAAGTTAAATTGAATGAAGAA
GTTGAACCTGAGGTGGCTTCGCAGAAAAATGGGAGAAGTTGTATAGGGATTCTTTTGATC
CCCGTCCTATTTCTAAAATCATTTTACTCTGAAAGGAAAACTGTCTTCAAATATATTTTC
CTTGGCTTGTTGCTTACAGGTTACATGGTGTATTTCATCATAGCCATAGCTAGAGACCCC
CTCGCTGCTAAACCTCTCATCATACTAACACTGGTTATTCTGTTTCTTGTTTTGTACGAG
TTGAGGTTCAAGAAGTTATTCTTGTTATTCTTTAAACAAATCAAATCAAAGGTTCATATT
AAAAAGGAAACCAAGAACAAGATCACACGGTTTCTGCCATATGTTCAGATCTTGATATGT
GTTGCTTTCTGTATATGGTTGTTGGTTGATATGATTATAAGGAATCCAAGCACTCTCATA
TCAGTTGTTGGGTTCATTGTAATACTGGTGGTTTGTATATGTGCTTCTACGCAACCAAAA
TGTATCAACTGGCGACCAGTTATTTGGGGGATTGGTCTTCAATTTATCCTTGGGCTCGTA
GTTCTACGCACCAGTGCTGGGTACACTGCTATTAAGTTCATTGGGGACCAGATTGCTACT
TTCATGAAATACACTGATAGTGGATCGACGTTTGTGTTCGGATATCTACCAAGCGATCAT
ATCTTCGCTTTCAAGGTTCTTCCCATGATCGTGTTCTTTAGCATGGTAACCAACATGTTG
TTCTACGTTGGTTTAATGCAATGGTTCATCGCAAAACTTGCGTATCTCACCCAAATCACA
TTGGGAACATCTGCCATTGAATCTGCAGTGGCGATCGCAAATATATTTGTGGGAATGACA
GAAGCGCCCTTGATAGTACGTCCGTACCTTCCTGAGTTAACCAAAGCTGAGATCCACTCC
GTTCTCACCACTGGGCTCGCTTCAATCTCATTCTCCGTGTTTGGGGTCTACATTGGGTTC
GGGGTCGATGGCGTCCATCTGCTCACAGCATGTGTAATGTCGGCACCAGCAGGATTAGTA
GTATCTAGGTTGTTGTATCCTGAGGTGGAGAAATCTAAGTTCATGAACACGGGATCCCTT
GCTCTGTCTGCGGGAACAAACCGCAACATAGTGGAAGCAGCAGCAGCTGGAGCTTCCATG
TCAATCAAACTCGTCGCAAATATCGGAGCAAATTTGATCGCTTTCCTTGCGTTGCTTGCT
TTTATTAACGCAACGTTGCACTGGTTTGGGGCGTTTGTTGGAATCCCTCAGCTGTCTTTT
GAGGTAATCTGCAGCTACCTTTTCATGCCCGTGGCTTTCCTGATGGGAGCTGATTGGGAA
GATTGTTTCCTCGTTGGTCAGTTATTTGGCATGAAGACTTTCCTTAATGAGTTTATCGCA
TACGAAGCGATGAAACCATTTATCAACAACAGATTGAACCAAAATGTTGTCCCCAAGTTT
ATCAATGGAACCATACAGTATATGTCGGAGAGATCGGAAATGGTGGCCATTCATGCATTG
TGTGGTTTCTGTAATGTCAGTTCACTTGGTATTATTATTGGTGGTTTAAGTGTTCTGATG
CCAAACAAAAAGAAAGATTTAGCCGAGATGTCGGTGCGAGCCCTTATGGGTGGGATGATT
GCTTGTTGTATGACGGCTTCTATATCAGGAATGTTATTTGTTGAACCCATCTTGGCATCT
ACTTCCAATATGACAGCCACCCCTTCACCATGAAGTTACAAACATATTTTTACCTTCCCT
GCTTAGTGGTTTCCACTCCTTCTACACTCCATCATACACAACTTTTTATACTTTCCTACT
TTGCTTGAAGCATTGTGTACATAAGTCCACTGCCATTATTTCAATCATGTAGCATCTGAT
ACACAAGTGCCTTAGATATCAAGACAACTCCTTTGAGTATTCTTTGTTTTCTACAAAATG
GGACAACAAAAAAAATTCAAAACATGGACCATCTTACCCCAACCTACTGTATTGCACCAG
ATAGTATTTGCAATGTATTGAAACAACAACTGCTGGCTTCATTTGGAAAATCTTTAACTT
CTAATTCTTCTACATTCCTTACCTTGTTACTCAATGAAGCATCCGTGGTTTGTTACGAAT
ATATATATAAATAGTATGCCTCCTGAAATAAACCTACAACGAGGAAATTAATGCCTATGT
TTGAAGCCGACCCTACGATGCCTCTCAAGATTTAGTTCTTACTTTGCGAAAACGTTCTGT
GTGTTTGAATGAAACTACAATGTACATTGAAAGAGTATCAACCCAAGCTGAAGTATTTAT
CTTGTCATCCCTGGAAGCCAAACCTGCTATACACCTCCCTGTTGCTTGAAACTTTTCCAC
ATCTGGTCAAAACCGCTGTTATTCTGCTGCTCATTCCGTTCACATTCATCTACAGTTCCC
CTTTTTATAATTTATTGTGTGCTTCTCTTTCATACAAGCAACACTAGGATGTCCCCCCCA
CTCCTACTGGCCCTGTTACATATTAAACCATTAACCAGCTGAACCATCCATTCCTTCAAC
ATGAAGCCCCATACGTGTCCTTTGATCTTACGTTCCATTTACATTCAACTACAACCCACT
TCGCCCCCTCATTTTAATTTTACCGCGTGCTTCTCTCCCAGACAAGTCTTGCAAGATATC
TCCTTCTCTTACTGGTAGTTTCACATAATGAACCATCCAGCAATTCCTCAAGTCCCATTT
TTTAACCCTTTGTCTGTCACCATGTTCCTCCCCTACTAATGTTGTGTTTGTGGATGTGCG
GAGTCTTTTGTTTTTTCCGCTGCTAGTCCCTGCATGTTTTAATGCGACGACAAATCTCCA
TTTTTGCTTTATACCAGCTCTGGTTTTCCTTTCAGACTCTTAGACCAACACAACGATATA
TTTCCACTTTCCCCTTTTACATATTAAACCATTAACCAGCTAAAACCACCCAGAAATTCA
GCATGAAGTCAAATACATTGCCCTTTGGTCGGTACCATGTTAATCCAGAAAGCCAAACTA
CTCTGCCTGTCAGGACTCTTACTGCTCATTTTGTTAACTGTTCTGTTTATACCACTGCTG
TTAAGTTCATTCATGAAGCATCTTAGAAAAGTTACTTGAATGTAACTACCACCACTCCAA
CCTATGAGAAGATTCTCTAACAGTATGTTGGAAACCAAACTACACAATGCCTCTGGAAAT
TTCTTTAAAAAAAATTGTTGTTCTGTTTATAACTCTGCTATATATTGAAGCATCTTGTAC
ACAAGTTCCGTGAAGATAAAAGCTTTTAGTGTTACTGTAACTGTTAAGCAGACCATGTAA
TGGAAAGATACATTTCTTAGTAGTTTATTCACGTTAAGCCTGATTAATCCTTGAATCTTC
CAAGAATTCACCATGGACTTCATAAGACATGAACCTACCACATCATTAGAACCCTGTGGG
CTCTCACCCATGTAAATTGTTCTGTAGTTCTTACTTTCTTATCCCTGGATTTCAAACTAC
AGTTGCTGTAATGCTCGTGAAAGGGCCCTTTAATCTGCCTGTGAAAGGGCCCTTTTAATC
TCTACCTATGTTCAGGAAAATTATCCGAAACCACTTTAAAAGGCCCTGTTGTATGAAGCC
TTTCGTTTTTTTGCTTGTTCCGTTTGTTCTAGTGTGTTGGTTCGTAGCTTTGCTTTGCCA
GGATTGCTTTACTCGTTCAATATGTTCCATAATTGAATGTATAAAGAGACAAAACAACTT
TGAATGAATGGATTGTATCTGATTGTTGCTTTGGTATGTTAGTCTTATTTATCTGCAAGT
ATTGCATCAGTTATCCCATCGACGGTAGGTTACAACAGAATTTGATACATTACTGCGTTG
TAGGATGGATACCATTGATTAGACAATGATATTCCATATTTTTTAATCCTGTTTTAATAA
TTAGCAAAAACGACATGGGAGGATTCAGTTTTACATATTCTTTTTTTTTGCAACCAAATT
GGGATGATAAAATAGAATTAAACATTAGGCTTTCCAACCAACGAAATATTATTTTATCCC
GGAGGTATTTGTTTATTCACTTAATAGCAGACTGGTGTTAGTAACCAGGGTAGCGAGA

InterProScan

PANTHER
C_nuclsd_transpt (IPR008276) - T[42-584] 5.8E-184
PANTHER
CNT3 (IPR030211) - T[42-584] 5.8E-184
TIGRFAM
C_nuclsd_transpt_met_bac (IPR018270) - T[166-579] 1.7E-134
Pfam
CNT_N_dom (IPR002668) - T[170-243] 3.5E-24
Pfam
CNT_C_dom (IPR011657) - T[353-579] 7.6E-70

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S28A1_HUMAN 41.667 % 446 5.36E-150
S28A2_HUMAN 39.825 % 417 1.44E-138
S28A3_HUMAN 44.463 % 483 1.42E-163