Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L131.10.v1.R.ND1-1

Possible name(s)

MFSD6; MFSD6L; MFSD9

Gene model

KH2012:KH.L131.10

Location

KhL131 [17,691 / 20,789]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 518

>KH.L131.10.v1.R.ND1-1
VVADSGLVVKVNAAVMKVEYDLLVVKLVNFLFYAGMACFMPYKAIYQKSIGLTPSQNGLI
QALEKLITLFSPPIVGAISDKFSFHKSSMIICILLSVGFTFPMYFVPKVNNGLNHNVDCY
VTNTTIVCSNSLNFTEGCNIIENVDAAYLLKCWDDYNNSATVTCEEPTVVNNQTEDAIQL
KCKDETTEQDTYGLTFMWVVVLTVFYAFFTNPVQPLIDASTMNMLGENRMQDYGKQRLWG
SVGFGSVALLVGFVTDVFTKSKSTEEKDYLFSFIGALVFGVLTSIVCYKLKVPKHNPPSI
LSGLTTLVKDPRIIAFLCIVMVGGYNLGVKYAFVFWYAESLPGCNQTIIGLAILTGCLTE
VPMFFVSGWIAGKIGYNAILVFGLIFASLRCFLYTILTSAWQLLLVEALHGLSFALPMAA
MCSYAATLAPEGMTATLIGLTQGVYWGLGNMLGALLGGVLYRLYSPIVMFRITALIGVVA
AMFYSISMVCLINYNSGLKVEEGSEGEREACNIKTDEA

Nucleotide sequence

Length: 1,832

>KH2012:KH.L131.10.v1.R.ND1-1
CGTTGTTGCTGATTCAGGTTTAGTCGTTAAAGTGAATGCTGCAGTCATGAAGGTTGAATA
TGATTTGTTGGTCGTTAAACTTGTCAATTTCTTGTTTTACGCTGGCATGGCATGCTTTAT
GCCGTACAAAGCAATTTACCAGAAGAGCATCGGACTGACCCCCTCACAGAACGGGTTGAT
TCAAGCGCTGGAGAAGTTGATAACTTTGTTCTCTCCTCCAATTGTTGGAGCGATTTCCGA
TAAATTCTCGTTCCATAAATCTTCAATGATTATTTGTATTCTGCTCTCTGTTGGCTTCAC
CTTCCCAATGTACTTTGTACCAAAAGTCAACAATGGGTTGAATCATAATGTCGATTGTTA
CGTCACAAACACAACAATTGTTTGCAGTAACTCTTTAAATTTTACTGAAGGTTGCAACAT
TATTGAAAATGTTGACGCTGCTTATTTATTAAAATGTTGGGACGATTATAATAATTCTGC
CACAGTTACATGCGAAGAACCCACTGTAGTTAACAACCAAACTGAAGATGCAATTCAACT
TAAATGCAAAGATGAAACAACAGAACAGGACACATATGGTTTGACCTTTATGTGGGTTGT
TGTATTGACCGTATTTTACGCATTTTTCACCAACCCTGTCCAACCTTTGATTGACGCAAG
CACAATGAACATGTTGGGTGAAAATAGAATGCAGGATTATGGGAAGCAACGCTTATGGGG
GTCGGTTGGGTTCGGCTCCGTTGCTTTGCTCGTTGGGTTCGTAACCGATGTTTTCACAAA
GTCAAAATCAACCGAAGAAAAAGATTATTTATTTTCATTCATCGGAGCGTTAGTGTTTGG
TGTCTTAACTTCAATTGTGTGTTATAAGTTAAAGGTTCCAAAACATAACCCACCATCTAT
ATTATCGGGACTTACAACACTTGTAAAGGATCCACGTATAATAGCATTCCTATGCATTGT
TATGGTGGGCGGGTACAACCTCGGCGTGAAATATGCGTTTGTGTTCTGGTACGCTGAAAG
CTTGCCTGGTTGCAACCAGACCATCATCGGACTCGCCATTCTAACCGGATGTTTAACCGA
GGTTCCGATGTTCTTTGTGTCCGGATGGATAGCTGGAAAGATTGGGTATAACGCGATCCT
CGTGTTTGGGTTGATATTTGCCTCATTACGCTGCTTTCTTTACACGATCCTCACATCGGC
ATGGCAACTTCTGCTCGTTGAAGCGTTACACGGCTTGTCATTCGCGTTACCAATGGCCGC
CATGTGTTCGTACGCGGCTACTTTGGCTCCAGAAGGAATGACGGCGACACTGATCGGACT
CACCCAAGGTGTATACTGGGGGTTAGGAAACATGCTCGGTGCGTTGTTGGGCGGTGTTTT
ATATCGTCTTTATTCCCCGATAGTGATGTTCCGTATCACCGCACTTATCGGAGTTGTTGC
CGCAATGTTTTATTCTATTTCTATGGTTTGCTTAATAAACTACAACTCGGGACTTAAAGT
GGAGGAAGGTTCTGAGGGAGAAAGAGAAGCTTGCAATATAAAGACTGACGAAGCATAGAA
ACATCATTAATAATGAGTAGAAACAAATTTTTTTATAGCAAAAATTGATTAAATTTTTAG
CCTGTTAAAAGCGATAAAAATTTGTTGCTTTAACAAATGCCCTAATAGCTGCTTCTAAAT
AACAATATACTTGTCAGCAATAGTTAGTTTATATCTTTCTTCATTGTGAATATTGCCTTG
CAGTGTTTTAATTGAATATACGATTCCTTTGCCTACATTTCATGTTTAAAAGATGTTTTC
ATAAGTTTAATACAAAACACAGAGAGATTTGG

InterProScan

SUPERFAMILY	MFS_trans_sf (IPR036259) - T[22-107] 3.27E-48 - T[191-487] 3.27E-48
Pfam	MFS_assoc_dom (IPR024989) - T[23-472] 9.7E-82
ProSiteProfiles	MFS_dom (IPR020846) - T[268-518] 13.44
CDD	MFS_dom (IPR020846) - T[315-484] 6.75976E-13

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
MFSD6_HUMAN	23.993 %	140	1.92E-35