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  1. EST 'AHC0AAA20YP04_RM1'
  2. Transcript 'KH2012:KH.L154.11.v1...'
  3. Molecular Tool 'Cirobu.Bra>MRFbΔCH (Izzi 2013)'
  4. Transcript 'KH2012:KH.L116.4.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L116.4.v1.A.nonSL8-1

Possible name(s)

SPNS1; SPNS2; SPNS3

Location

KhL116 [614,930 / 632,594]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 627

>KH.L116.4.v1.A.nonSL8-1
MGTKNPQPNTLYPAGYEDNNSNSDESDGMVASHEALLPHSDTQHNTGLKNQPPKGPAVFP
KMPENEEKIEVVSDGISPMRKYASVFVLFLINLLNYMDRFTIAGVLMQIQEYFNISNGSA
GLLQTVFIISYMAVAPLFGFLGDRYNRKLVMLAGMIVWSGCTLFASFVNNQSHFLLFLVL
RGLVGIGEASYSTIAPTIIADLFVKEKRTNMLSVFYFAIPVGSGLGYIIGSAAAQAFGSW
HWALRITPGLGLITMALMMVVIPNPKRGASEANNTIETTGKLERETSYKEDLIYILKNVS
FVFGLITCVAGFIGVWAGAEWSKRWKARGQKNADALVCAIGLVIAAPLLLAGFQLATINL
PSAWTFIFLADLAQCLTWTLVGDMTLYVTMPSRRSTANAVQILTMHLFGDAGSPYLLGVL
SDAITANLPATYYSKYLGLQRAMYVALFASVLGGCGFLMASLFIVRDKKKVDDALAGLLP
VSCSPNSDSSGSVELEQISSDDNSSDPLIKPTPVIDNTNEYMEPSGQYMSGQLESFYTTK
DEETNEKKQNNHLNSKDSSPKVEQQGYISVGEPKQNFQEPKNKKYAAQTEEWYATDKPQS
GDKGLNVSESSSVTSNVCLLDAKESLI

Nucleotide sequence

Length: 2,389

>KH2012:KH.L116.4.v1.A.nonSL8-1
TATTAAATATACGAGTTACAGCCCTTTTAAATGGGAACTAAAAACCCTCAACCCAATACA
TTGTATCCTGCTGGATATGAAGATAATAATAGCAACAGTGATGAAAGTGATGGGATGGTA
GCAAGTCATGAAGCACTTCTCCCTCATAGCGACACACAACACAACACTGGCTTGAAGAAC
CAACCACCTAAAGGGCCAGCTGTTTTTCCAAAAATGCCGGAAAACGAAGAGAAAATTGAG
GTCGTTAGCGACGGAATTTCCCCAATGAGGAAATATGCGTCGGTGTTCGTACTATTTCTA
ATCAATCTTTTGAACTACATGGATCGTTTTACTATTGCAGGTGTCCTTATGCAGATCCAA
GAATACTTTAACATCAGTAATGGATCCGCTGGTCTTTTGCAAACCGTATTTATCATCAGC
TACATGGCTGTTGCACCCCTCTTCGGTTTCCTAGGCGACAGATACAATAGAAAACTCGTG
ATGTTGGCTGGTATGATCGTGTGGTCGGGATGCACGCTCTTTGCATCTTTTGTGAATAAT
CAGTCGCATTTCTTGTTGTTCCTTGTACTACGTGGATTAGTCGGCATCGGGGAGGCTTCA
TATTCAACCATAGCACCAACCATCATTGCCGATCTGTTCGTCAAAGAAAAGCGAACTAAC
ATGCTCTCCGTGTTTTATTTTGCTATACCAGTGGGCAGTGGTCTCGGTTACATCATTGGC
TCTGCAGCTGCACAAGCATTTGGATCATGGCACTGGGCACTAAGGATCACTCCTGGCCTT
GGATTGATCACCATGGCTCTCATGATGGTGGTAATACCTAATCCAAAGAGAGGAGCATCA
GAAGCCAACAACACTATAGAAACAACCGGTAAATTGGAACGAGAAACTTCTTATAAAGAA
GACCTCATTTACATTTTAAAAAATGTGTCGTTTGTTTTTGGATTGATCACATGTGTGGCG
GGATTTATCGGAGTGTGGGCAGGAGCGGAGTGGTCGAAGAGATGGAAAGCAAGAGGACAG
AAGAATGCTGATGCTCTTGTGTGTGCTATTGGTTTGGTTATTGCAGCTCCATTATTATTG
GCTGGATTTCAACTTGCAACTATCAATCTTCCTTCTGCATGGACTTTTATTTTCTTGGCT
GATCTTGCTCAATGTTTGACATGGACACTAGTTGGTGATATGACGCTGTATGTGACAATG
CCAAGTAGAAGATCAACAGCAAACGCAGTTCAAATACTTACAATGCATTTATTTGGAGAT
GCTGGTTCTCCTTATCTACTTGGAGTGCTCTCGGATGCAATAACAGCAAATCTCCCAGCA
ACTTATTACAGCAAATACCTTGGTTTACAACGAGCAATGTACGTTGCATTGTTTGCATCA
GTGCTTGGTGGATGTGGATTCCTGATGGCTTCGTTATTCATTGTGCGTGACAAGAAAAAA
GTGGACGATGCATTAGCAGGTTTGTTGCCAGTGAGTTGTTCACCAAACTCGGACAGCAGT
GGTTCTGTTGAACTAGAGCAGATCTCAAGTGATGATAATAGTTCAGACCCATTAATCAAA
CCCACACCAGTAATAGACAATACTAATGAATACATGGAACCATCTGGACAGTATATGTCT
GGTCAATTAGAATCATTCTACACCACTAAAGATGAAGAAACAAATGAAAAGAAACAAAAT
AATCATCTAAATTCTAAAGACAGTTCACCCAAAGTGGAACAACAAGGTTACATTTCAGTC
GGTGAACCTAAACAAAATTTTCAGGAACCTAAGAATAAAAAATATGCTGCTCAAACTGAG
GAGTGGTATGCAACTGACAAGCCACAAAGTGGTGATAAAGGTTTAAATGTATCGGAGTCA
AGTTCAGTTACATCCAATGTATGTTTGCTTGACGCTAAAGAAAGCTTAATTTAATATCTA
AAAATGCAAACTTCTTTAACTAACCACGATATGCACAAAACATTGTTTACTTGTATTAGC
CCATATTATAAATCACAGTAAATCTGTTTTAAAACTAGTTAAAAAAGTTAGCATTATTTT
ATTAGTGCAAACGCATTATTTTTCAGTACAATGAACTAATTTATTCATCAGCACTGCGCA
AACCAATCTTATACAGCTTACAGTAACCTTGTGATAAATGAATTTATGAAAATTCTATTT
ATTAATTGATATGAGTTTCATATCAGTAAAAGTTATGTTTATCCAATGTTGTACACCTGT
AAGCTTTTGTTTTGTACCGAGTTAAAGGGTTGTTTTTGATTTTATTTTGCCATGGTAGCT
TTGTTAGTTGTGCTGTAGTCAGAACCTACCATACACATCTTTTTTTACATCACTGTTCTT
TAATATTCATGTTGCTCATTTAATAAAACTATATAGTAGTAGTGGAAAA

InterProScan

SUPERFAMILY
MFS_trans_sf (IPR036259) - T[71-461] 2.88E-48
ProSiteProfiles
MFS_dom (IPR020846) - T[84-627] 22.203
CDD
MFS_dom (IPR020846) - T[85-459] 1.14519E-46
Pfam
MFS (IPR011701) - T[88-316] 2.3E-34

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SPNS1_HUMAN 43.83 % 365 7.94E-120
SPNS3_HUMAN 38.4 % 315 1.77E-100
SPNS2_HUMAN 41.591 % 335 1.53E-107