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Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.L104.3.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

ATL1; ATL2; ATL3

Gene model

KH2012:KH.L104.3

Location

KhL104 [20,542 / 29,287]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 578

>KH.L104.3.v1.A.SL1-1
KMSNFFSSVASNLRAAKKRYWDADPGVNSEVKSESIVTMNGDKPQVKLEALGKILQKYED
QPVAIISVFGDFRGGKSFLLNLLCQYLMQKQPKDWIKKKEELVKVFNWRAGTKSHTTGID
ITNKPFMLENDKGEEIAVFLMDTQGSFDKKMSAGECSLIFALSILISSVQIYNLPSGLIR
ESDLQQLGRQALNPYPSIIFQPLMFLVRNYQMPDYDCGSKGGMEYLEEVMKADQDENKDV
RKKIKEGFPDVQCHLLPDPGNKVKNQKGSDTSQLRLTDIDEGFLVGVDDLAKCLFSQDSL
VVKQLNGKACTGKVLMQLAGGLDNMIKNDQTPKVHTLLKVNEIVEFYKKIGEFEKEYVAT
MNSMGEKYIDPKILKTFHDECFQKAMQQYEEHDVFEPDESLKQCEELKRRLNGSYAIIKQ
DNEARKVREQNKIMDKVGVAGNVYFKEMEKFAGGQHLEDVITAKAEAEEKAKICVFQNFK
EKYVEEDKLDKIHETNKQQALKAFDANRNNVSTEALKSFSENKNALERDIEDTFVYIKGV
NKENEVCCSCRSCPSSSSCCWYCCRRNYVNIYGYGGII

Nucleotide sequence

Length: 3,180

>KH2012:KH.L104.3.v1.A.SL1-1
CGTGTAGTCTTGTTAATCCTGCTAAGCTTCATTAAATAGAAAATGTCGAATTTTTTTTCA
TCAGTAGCAAGTAATCTACGAGCAGCAAAGAAACGGTATTGGGATGCAGATCCCGGTGTA
AATTCAGAGGTTAAAAGCGAGTCCATTGTTACTATGAATGGAGATAAACCACAAGTTAAA
TTAGAAGCGCTTGGGAAAATACTGCAAAAATATGAAGACCAACCCGTTGCCATTATCAGC
GTATTTGGCGATTTTCGCGGTGGAAAGTCATTTCTGTTGAACCTATTGTGTCAATATCTA
ATGCAAAAACAACCGAAAGACTGGATTAAAAAGAAAGAAGAATTGGTTAAAGTATTCAAC
TGGAGAGCGGGAACCAAAAGTCATACCACAGGAATTGATATCACTAACAAACCTTTCATG
TTGGAGAATGATAAAGGAGAGGAAATAGCTGTGTTCTTGATGGACACTCAAGGATCTTTT
GATAAAAAAATGAGTGCAGGAGAATGTTCATTAATATTTGCATTGAGCATTTTGATAAGT
TCGGTCCAAATCTACAACTTGCCATCAGGATTAATAAGAGAGAGTGATTTACAACAATTA
GGGCGACAAGCCTTGAACCCATACCCTTCCATAATTTTCCAGCCTCTTATGTTTCTGGTT
CGGAACTATCAGATGCCAGATTATGATTGTGGCAGCAAAGGTGGGATGGAATATTTAGAA
GAAGTCATGAAAGCGGATCAAGATGAAAACAAAGATGTTCGGAAGAAGATAAAGGAAGGT
TTCCCTGATGTTCAATGCCATTTGCTGCCGGATCCTGGGAATAAAGTTAAAAACCAAAAG
GGTAGTGACACTTCTCAACTTAGACTTACAGATATAGATGAAGGCTTTCTTGTTGGAGTG
GATGATTTGGCCAAGTGTTTATTTTCTCAAGATAGTTTGGTTGTAAAGCAACTTAATGGT
AAAGCTTGCACTGGTAAAGTTCTTATGCAGCTTGCGGGGGGACTTGATAACATGATTAAA
AATGATCAAACACCCAAAGTTCACACATTATTAAAGGTCAATGAAATTGTTGAATTTTAT
AAGAAAATTGGTGAATTTGAAAAGGAATATGTTGCAACAATGAATTCCATGGGGGAAAAG
TACATTGACCCAAAGATATTGAAAACATTCCACGACGAATGTTTCCAGAAAGCAATGCAG
CAATACGAGGAACATGATGTGTTTGAACCAGATGAGAGTTTAAAGCAATGTGAAGAATTA
AAGAGAAGATTGAATGGTAGTTATGCGATTATAAAACAGGATAACGAAGCACGTAAGGTA
CGGGAACAAAACAAAATAATGGATAAAGTTGGTGTTGCTGGGAATGTTTATTTTAAGGAA
ATGGAAAAGTTTGCAGGGGGACAACATTTGGAAGATGTTATTACAGCAAAGGCAGAAGCT
GAAGAAAAAGCAAAAATTTGTGTGTTTCAGAACTTTAAAGAAAAATATGTAGAAGAAGAT
AAACTTGACAAAATCCACGAGACAAACAAACAACAAGCATTGAAAGCATTTGATGCAAAT
AGAAATAACGTTTCAACTGAAGCTTTAAAAAGTTTTTCAGAAAATAAAAATGCACTTGAA
AGAGATATTGAAGATACTTTTGTTTATATAAAAGGAGTAAACAAAGAAAATGAGGTATGT
TGTTCTTGCCGCTCCTGTCCTTCTTCTTCTTCTTGCTGTTGGTATTGTTGTCGCCGCAAC
TACGTCAATATATACGGTTATGGAGGAATTATTTAATCTTCTAAAAATAAATGTTGTGCT
TTTGCCATCTTTATCTCTCCTGGATGATCTCAATTCTCTGTTATATTAAGATGTTGACAT
TTTTTACTGCAGTTTTCATCCTTACTGATTGATAATGTTTACTGTAGTTATATTTTCCAA
CGCGTTAAACTAAATCATCTGGCATTTGGCAACACTATTAGTTATTGAGCGACGCGTAGG
CCTACACTTAAACTCGCGTCATTAACATTCCTGTGTTTTTGAACACGTTATTGAACACGT
TAGTGGTCATATAGATCCTTTTTCGTCGAACAGTTGTTCTTGGCTTTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGCTGATAGGGTGATTATTTTCCGCACTTATCCTAATTCTTAATTCTAGCATT
TTTTCTTTAATCTCTTGATTGAAATCAAATCGTAATATATATTTATAATTTTTAGACTGA
ATTTTCAGATTTAAAACCGCACGATGAGCGATTAATTAACGATTACTTTCCTCATGCACT
TTACATAGCGGAAACACTGTCTGGCAGTTTGGCGGGAAACGACGGCAAGCGTGTTGTATC
TACACAACGATTCACGACTGAATCAAACTATTAGCATTTAAGTGGGGACGCATTAAATGC
ACTACTCTTATACCGTATTATCATTAATCGTAATTGAAACATTATTTTTAATTCAACATC
ATATGATTAATATTAACTTCTAACATTACCTAATTACTGCGTGATTACGGTTTGTCAAAA
TTTATGAAAACAAACGTTTTTAAGCGACGACAACGTTATTCTTTACTAATCACTCAATCC
TCATACGTCATAAGTTTCATTGGTTATAATACATGTATAAATACATTTTGCCTACTGCTC
TACAGTCACCAATGGCGACTAGAACCCGTTTTGTTGGTTACTTCAGATTTGTTTTTGATC
GAGCCCAGTCGACAGTGTAGTAAAAGGGTTAACTAATATAGCAGGGTGGGGGTAGATGGG
ACACCTTTTCATTTTGTTTTCTCTTTACATTTGGTAGTAAACAAAGAACATTTAATGAAT
TATAAAACCGTATCTTCACGACTTCCACAGACCGTTTTTAATTGTTTAAAACACGATCAG
GCTATTTGGATATTATGTGTTAAAGGTGTCCCATCTTCCCCGACTCTACTATCTTATGTT
AATTAGTTTAAAACGTGTTCATTCATTAGATCTGTGATCTCTTGTCTTGCATAATCTTCC
TACCCATGTAAGTCCTACTATTGTTTTTTATTGAAGCGTTCATTTTAAGTTGAATAAAGC
CTATTATCAGTTCTGCTCGTCAGATAGGTTTCCGACATACAGTATGTGTTTTTTTGTATA
GATTTTTTGCTATGTGTTATTTGTAGCGTTTTTTGTCTAATAAACTGAATTATTTGCAAA

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[37-297] 1.07E-22
Pfam
Guanylate-bd_N (IPR015894) - T[46-302] 5.0E-45
ProSiteProfiles
G_GB1_RHD3_dom (IPR030386) - T[60-310] 40.248

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ATLA2_HUMAN 31.899 % 196 1.59E-55
ATLA1_HUMAN 32.849 % 186 8.37E-52
ATLA3_HUMAN 34.043 % 182 1.43E-50