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Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C9.99.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

TMC4; TMC7

Location

KhC9 [1,408,451 / 1,420,330]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 838

>KH.C9.99.v1.A.SL1-1
LLHVVRLYLLSCIMSWSPSPYDFDNYFEDDEGITDNIDKPKKSKKAKAKLSLASQLPSAQ
AYNSAAGISLTRRAMSKSRKSANKTNNEEVINMQTYDTFEDDAAPYPSAGGTLQLTTSAI
MTNNLLEELTYKDMESLKEMKCCMAEKKRIRKELMSQQEGKTKSGTSSTNNVKWKRFKED
SADMLRHVQLWRTSIHEVEGRFGNGIRSYFAFLRWLFILNIYIFLLMFVFVCVPTVAFES
LVHSGVNISSNSLNGNNVSAECAYNPYDPNAVNSFSQYVIWFFTGQGFMEKTLLFYGYYS
NSATTIFSDGFLFYYDIPLAYLMVAFFYFLLTLVLLVRRAGAGLKESLLSNEDRFYTYCN
KVFCGWDFCITDDHSAELKHSSLKYELQTDLEEERIRLRQSSRTSKEKWILYTKRFFINL
VVVGILVASLVAIFYAAQYALGNGDTFNNNFMLDLIVTYLTSIVITVANFIAPLIFGFLI
IYEDYSPAFTIKFTLIRTVFLRLASVVFLYVVVYLQINCSKYDIVSTEIRPNCTFCEGVE
CWETYLGQEMYKLTIMDFFIVLAVTLFVEFPRKLIVENCSCGLAKWWGQQEFSIPENVLD
IVYAQTIGWIGAFYAPLLPVIVVVKFFIFFYLKKLSLTYNCRPATRPYRASRSGTFFYII
LLVGFVVAAFPVVVSVAILEPSKDCGPFRGWTTMFYAITASIQTQPGWLQSILWFVGSPG
FAIIIGVLLCLALYYFVALRTAHKKMISLLRDQLTLEGKDKQFLLSRVTKLTKELQDAGI
EPNLNGKLKNGGVRRRKSGHSNGRLNEGYEPNMSSNVDGPDNIPGQPDVDELRDRDIP

Nucleotide sequence

Length: 3,425

>KH2012:KH.C9.99.v1.A.SL1-1
GTAATTATAGTTAAGTGCATCAAGGTACTGATACTTTTTTGTTGTTTTACCTCACCTGGG
ACTTATCTAACCTGGGACTAATCCAAACACCACAAACACAGACAAACTTTATTCTACTTA
TCATTGAAAGCCTTAATTTCTGTGATGTCAACAGTTTAGCTGTTGCATGTGGTACGTTTA
TATCTCTTATCCTGTATAATGTCTTGGAGTCCAAGTCCTTATGATTTTGACAACTACTTT
GAAGATGATGAAGGAATTACAGATAATATTGATAAACCAAAAAAGTCTAAAAAGGCGAAG
GCTAAGCTGTCACTTGCCTCTCAGTTACCAAGTGCACAAGCATACAACAGTGCAGCAGGA
ATAAGTTTAACAAGGAGAGCCATGAGTAAAAGTAGAAAATCAGCAAATAAAACAAATAAT
GAAGAAGTTATCAACATGCAGACATATGACACATTTGAGGATGATGCAGCACCTTACCCT
TCAGCTGGCGGTACATTACAACTTACAACCTCAGCCATAATGACCAATAATTTACTTGAA
GAATTAACATATAAAGATATGGAAAGCTTAAAAGAAATGAAATGTTGCATGGCAGAAAAG
AAAAGGATACGGAAGGAACTAATGAGCCAACAAGAAGGAAAAACAAAATCTGGCACTTCA
TCTACCAATAATGTGAAATGGAAAAGATTTAAAGAAGATTCAGCTGACATGTTACGACAC
GTACAACTATGGAGAACTTCAATACATGAGGTGGAAGGTCGATTTGGAAACGGGATCCGA
TCTTACTTTGCGTTCCTCCGATGGTTGTTCATCCTTAATATTTACATTTTCCTCCTCATG
TTCGTGTTTGTGTGCGTTCCTACTGTTGCATTTGAGAGTCTCGTTCATTCTGGTGTCAAC
ATATCATCGAATTCACTGAATGGAAACAATGTATCAGCGGAGTGTGCATACAACCCGTAC
GATCCAAATGCTGTCAATTCATTCTCACAATACGTCATATGGTTTTTCACTGGCCAGGGC
TTTATGGAGAAAACTCTTCTATTTTACGGCTACTATTCCAACTCAGCCACAACAATATTC
TCGGATGGTTTTCTCTTTTACTACGATATCCCACTTGCCTACTTGATGGTTGCTTTCTTT
TACTTCTTGCTCACTTTAGTCCTTTTAGTTAGAAGAGCAGGAGCAGGGTTAAAGGAGTCT
TTACTGAGTAATGAAGATAGGTTTTACACATATTGTAATAAAGTATTCTGTGGATGGGAC
TTCTGTATAACTGATGATCACTCAGCAGAACTTAAACATAGCAGTTTAAAGTATGAGCTA
CAGACTGATTTGGAAGAGGAGAGAATACGCTTGCGTCAATCAAGTCGGACGAGTAAGGAG
AAATGGATTCTTTACACGAAAAGATTCTTCATCAACCTTGTAGTGGTTGGAATATTAGTG
GCTTCACTTGTGGCAATCTTCTATGCAGCGCAGTATGCACTTGGGAACGGAGATACATTC
AACAACAATTTCATGTTAGATCTCATAGTTACTTACCTGACGTCAATTGTTATAACGGTT
GCTAACTTCATTGCTCCACTCATATTTGGGTTCCTTATTATATATGAAGATTATTCACCA
GCTTTCACCATTAAGTTCACACTCATAAGAACCGTTTTCCTACGTTTGGCATCTGTTGTG
TTTCTCTATGTGGTGGTTTACCTTCAGATCAACTGCAGTAAATATGACATCGTATCAACA
GAAATACGACCGAACTGCACCTTCTGTGAGGGGGTTGAGTGCTGGGAAACTTACCTTGGG
CAAGAGATGTATAAGTTGACCATCATGGACTTTTTCATTGTCCTTGCTGTTACTTTGTTT
GTGGAGTTTCCAAGAAAGTTAATTGTAGAAAACTGTAGCTGTGGCCTTGCTAAATGGTGG
GGCCAGCAAGAGTTCTCAATCCCTGAGAACGTTCTTGACATTGTGTATGCCCAAACTATT
GGGTGGATCGGTGCTTTTTACGCTCCATTGCTTCCAGTCATAGTTGTCGTAAAATTCTTC
ATTTTCTTTTATTTGAAGAAGTTATCGTTAACGTACAACTGCAGACCTGCCACAAGACCA
TACAGAGCATCTCGTTCCGGGACTTTCTTCTACATAATATTGTTAGTTGGTTTTGTTGTC
GCGGCTTTTCCTGTGGTTGTCAGTGTGGCAATTTTGGAACCAAGTAAAGATTGCGGTCCA
TTCCGTGGTTGGACGACCATGTTTTACGCCATCACAGCTTCAATACAAACACAACCTGGA
TGGTTGCAATCCATCTTATGGTTCGTTGGTTCACCTGGGTTTGCTATCATTATTGGTGTC
TTGTTATGCCTTGCTCTCTATTACTTTGTGGCATTGAGAACCGCACATAAAAAGATGATT
TCTTTACTAAGAGACCAACTTACACTGGAAGGAAAAGACAAACAGTTTCTGCTATCCAGG
GTAACTAAGTTGACAAAGGAGTTACAAGATGCTGGGATTGAACCTAATTTAAACGGGAAG
CTCAAAAATGGCGGTGTTCGGCGGCGAAAATCTGGTCACAGTAATGGCCGATTGAACGAA
GGGTATGAACCAAACATGTCGTCCAATGTTGATGGACCAGATAATATACCTGGCCAACCA
GATGTGGACGAACTAAGAGACCGAGACATCCCATAATGACAACACACATCCATGACTGTA
TTATATGATTTGAACCTCAACAAAGCTATTAGCTACCCATGGCACCTTATGAAACATCAT
CATAGCGATATATTGCATGACATTAATCTGCACATAACCTGACACCGGTACTTACAACAA
AACAAGGTACTATTATCAAAATTTGAGTTTAAGAAAATTATAAAAGTGAATACTCCACAC
ATCGGCATCGAATGAATGTTTATGTCACTGTCAACTGTTGCACAAAACTTGTGAAAAATG
ACTTGGTTTAACCGAATGATAATTCACTTAGATTTAGTTGTACATTGCAATACTATATTA
CTATCTTCATTTTAATGCTTATATGAGCTGTAATTTTTACTCATTTTCTTTTTTAAATTT
ATGAACTGTTTTAATTCTTAACCTTTTTATAACATGCCACTTATAAGGCCTTATAATATT
TTAAAGTACTGAACCACTAAGAATAATACATACGTAAAATTTCTTAGCTAAACTGGCTGA
GAACCATTGCTCTAAAAGATATTATCTCATTGTTAGTTCACCGTATAAGTGCTCCTAATT
TCCTGTATATTAACCACTGTACTATTTTAGCAAACCCCATTTATCTAAACAAACCAAAAT
ACCAAACCTTGTACGATACGATTAGGAGATTTGTAAATATTTGGTATTCGCGCACTTCAA
TCTTGGCTCATATTATTTTAGTTCGTTGTTATTTCAATAAAAGTTGTTAAACAATTTTGC
GGTAA

InterProScan

Pfam
TMC (IPR012496) - T[541-651] 8.9E-47

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TMC5_HUMAN 28.507 % 265 1.25E-75
TMC7_HUMAN 42.243 % 517 2.44E-173
TMC4_HUMAN 33.538 % 306 1.15E-92