Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C9.287.v6.A.SL1-2

Possible name(s)

HERC3; HERC6; RCCD1

Gene model

KH2012:KH.C9.287

Location

KhC9 [4,989,034 / 4,991,390]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 208

>KH.C9.287.v6.A.SL1-2
EKLLRRGLTNNLGRELTKENISSKCIQSILNFDNHGYGILQDNGEFVLQFEPERSEIFTK
RHVGSVAKDSNGFYLVADDVLLHCNNILESPIIMRPMFSSHKVRNVSCGNCHSLLSTHNG
NVFSWGIGSHGQLGHGDMETLKQPQLIDALGGVCIKRVGAGGWHSAALAGILTFQMLYIC
CKLFSKQHFIYLHINNLCRSTLYIVLNI

Nucleotide sequence

Length: 1,616

>KH2012:KH.C9.287.v6.A.SL1-2
ATGAAAAACTATTGCGCCGTGGGCTTACTAACAATCTGGGTAGAGAGTTGACGAAGGAAA
ATATATCATCCAAATGCATCCAATCGATTTTAAACTTCGATAATCATGGTTATGGAATAC
TACAGGATAATGGAGAATTTGTGCTGCAGTTCGAGCCTGAGAGAAGTGAAATATTTACAA
AACGCCATGTTGGATCTGTAGCAAAAGATTCAAATGGATTTTATTTAGTAGCAGATGATG
TGCTACTACATTGCAATAACATCTTGGAGAGTCCTATTATTATGAGGCCAATGTTTTCAA
GCCACAAAGTAAGGAATGTTTCATGTGGTAATTGTCACAGCTTATTATCAACACATAACG
GAAACGTCTTCAGCTGGGGAATTGGCAGTCATGGACAACTTGGACATGGTGATATGGAAA
CATTAAAGCAACCACAGTTGATAGATGCCCTTGGTGGTGTTTGTATTAAGCGTGTAGGGG
CTGGTGGGTGGCACTCAGCTGCTCTGGCAGGTATATTAACTTTTCAGATGCTTTACATTT
GTTGTAAATTGTTCTCAAAACAGCATTTCATTTATTTGCATATTAACAACCTCTGCAGAT
CAACTTTATACATTGTTTTAAACATATAACACTTAGTTATCATCTTTGTATAATGCTTTG
AAATGTGATTCTAAACAATATTCCATATTTTTGTGATACTGGGTCAAAAATGTGCTTTTT
ACACATTAAATCAGTAATATACTTTTAAGAGTTTTAATTTATTTAATGTTTTACAAAATA
AAAAACTTTGGCAGACACTGATGATTTGTATGTCTGGGGTTGGAACCAGTCAGGTCAGAC
TGGATTTCAAGCCCCAGTTGGTATTTGCACCAACTCCACTGAAGCACTTAAAATGGAAAA
TTCTACAAAAGATTCCAATGCCATAGGTGTTGTTCTAAACCCAACATTGTTAGAACTTGA
AATGTGTGCGGATTCAAACAGCTTTGTTTCTATTATTGATGTATCCTGTGGTGTTAGGCA
CACTGCTGCAGTTACTTCGTGTGGGACTTTAATCACATGGGGTTGGGCACGATATGGTCA
AATATGTCACTCATGTTGTAAACCAGACACTGATATCCCAACAGACAGCGTACATTGTGA
AGCGCATTTGCCACAGACTGTGATGTGGTTTAAAACACATGGTTTATATGTAACTGGTGT
AGTGTGTGGTCCATGGAATACGTTTGTAACCACGAGTGATTATGGTTAATCATTATGTTA
ATACATTGATGCGGTTTCCAGTTCTATTACTTTATGAATTTAAAAATCTTTGCAAGCTGG
TATGTCTTATCGCACGATTTTACAAAAGATAGTTGCAGAACTATGCAAACCAAACTGTGT
TTGATTTAATCAAGCAGTTTGATAATTTAACCTTATTTTATTTACATGCAAGTAAAATAT
TTTTGTGCCACAAGATTAAAATTCCAGTGTCATACCAAAATTCGTATAGTGTTAAACTTA
ATCATGTTAGGCATTTATTAGCGTACTTCGCACTTTAATTCATTATCGTAGCTGGTGACT
TTTTAAAAAACAAAATGCATAAAAAAGTGGAACGGAATACAACTTTGCTCTCTTTT

InterProScan

Gene3D	RCC1/BLIP-II (IPR009091) - T[42-179] 1.7E-21
SUPERFAMILY	RCC1/BLIP-II (IPR009091) - T[49-168] 4.19E-21
Pfam	Reg_chr_condens (IPR000408) - T[119-168] 4.6E-11
ProSiteProfiles	Reg_chr_condens (IPR000408) - T[120-171] 15.187

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
RCCD1_HUMAN	33.775 %	80.1	8.99E-18