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  1. Transcript 'KH2012:KH.C9.287.v3....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C9.287.v3.A.SL5-2

Possible name(s)

HERC3; HERC6; RCCD1

Location

KhC9 [4,989,034 / 4,991,701]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 265

>KH.C9.287.v3.A.SL5-2
ESILMPSLYGFGYNGFGQISSDVERDCVTSPLCITSQTKRKVLTSSHTWSSSIYSYDEKL
LRRGLTNNLGRELTKENISSKCIQSILNFDNHGYGILQDNGEFVLQFEPERSEIFTKRHV
GSVAKDSNGFYLVADDVLLHCNNILESPIIMRPMFSSHKVRNVSCGNCHSLLSTHNGNVF
SWGIGSHGQLGHGDMETLKQPQLIDALGGVCIKRVGAGGWHSAALAGILTFQMLYICCKL
FSKQHFIYLHINNLCRSTLYIVLNI

Nucleotide sequence

Length: 1,791

>KH2012:KH.C9.287.v3.A.SL5-2
AATTAGGAATCCATCTTAATGCCTAGCCTGTACGGCTTTGGATATAATGGGTTTGGTCAG
ATAAGTTCTGATGTTGAAAGAGATTGTGTAACTTCCCCACTTTGCATTACAAGTCAAACA
AAACGTAAAGTTCTCACAAGTTCTCACACATGGAGTTCCAGCATTTATTCCTATGATGAA
AAACTATTGCGCCGTGGGCTTACTAACAATCTGGGTAGAGAGTTGACGAAGGAAAATATA
TCATCCAAATGCATCCAATCGATTTTAAACTTCGATAATCATGGTTATGGAATACTACAG
GATAATGGAGAATTTGTGCTGCAGTTCGAGCCTGAGAGAAGTGAAATATTTACAAAACGC
CATGTTGGATCTGTAGCAAAAGATTCAAATGGATTTTATTTAGTAGCAGATGATGTGCTA
CTACATTGCAATAACATCTTGGAGAGTCCTATTATTATGAGGCCAATGTTTTCAAGCCAC
AAAGTAAGGAATGTTTCATGTGGTAATTGTCACAGCTTATTATCAACACATAACGGAAAC
GTCTTCAGCTGGGGAATTGGCAGTCATGGACAACTTGGACATGGTGATATGGAAACATTA
AAGCAACCACAGTTGATAGATGCCCTTGGTGGTGTTTGTATTAAGCGTGTAGGGGCTGGT
GGGTGGCACTCAGCTGCTCTGGCAGGTATATTAACTTTTCAGATGCTTTACATTTGTTGT
AAATTGTTCTCAAAACAGCATTTCATTTATTTGCATATTAACAACCTCTGCAGATCAACT
TTATACATTGTTTTAAACATATAACACTTAGTTATCATCTTTGTATAATGCTTTGAAATG
TGATTCTAAACAATATTCCATATTTTTGTGATACTGGGTCAAAAATGTGCTTTTTACACA
TTAAATCAGTAATATACTTTTAAGAGTTTTAATTTATTTAATGTTTTACAAAATAAAAAA
CTTTGGCAGACACTGATGATTTGTATGTCTGGGGTTGGAACCAGTCAGGTCAGACTGGAT
TTCAAGCCCCAGTTGGTATTTGCACCAACTCCACTGAAGCACTTAAAATGGAAAATTCTA
CAAAAGATTCCAATGCCATAGGTGTTGTTCTAAACCCAACATTGTTAGAACTTGAAATGT
GTGCGGATTCAAACAGCTTTGTTTCTATTATTGATGTATCCTGTGGTGTTAGGCACACTG
CTGCAGTTACTTCGTGTGGGACTTTAATCACATGGGGTTGGGCACGATATGGTCAAATAT
GTCACTCATGTTGTAAACCAGACACTGATATCCCAACAGACAGCGTACATTGTGAAGCGC
ATTTGCCACAGACTGTGATGTGGTTTAAAACACATGGTTTATATGTAACTGGTGTAGTGT
GTGGTCCATGGAATACGTTTGTAACCACGAGTGATTATGGTTAATCATTATGTTAATACA
TTGATGCGGTTTCCAGTTCTATTACTTTATGAATTTAAAAATCTTTGCAAGCTGGTATGT
CTTATCGCACGATTTTACAAAAGATAGTTGCAGAACTATGCAAACCAAACTGTGTTTGAT
TTAATCAAGCAGTTTGATAATTTAACCTTATTTTATTTACATGCAAGTAAAATATTTTTG
TGCCACAAGATTAAAATTCCAGTGTCATACCAAAATTCGTATAGTGTTAAACTTAATCAT
GTTAGGCATTTATTAGCGTACTTCGCACTTTAATTCATTATCGTAGCTGGTGACTTTTTA
AAAAACAAAATGCATAAAAAAGTGGAACGGAATACAACTTTGCTCTCTTTT

InterProScan

SUPERFAMILY
RCC1/BLIP-II (IPR009091) - T[8-39] 1.15E-22 - T[160-225] 1.15E-22
Gene3D
RCC1/BLIP-II (IPR009091) - T[108-228] 8.4E-21
Pfam
Reg_chr_condens (IPR000408) - T[176-225] 6.9E-11
ProSiteProfiles
Reg_chr_condens (IPR000408) - T[177-228] 15.187

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RCCD1_HUMAN 33.775 % 81.3 1.33E-17