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  1. Transcript 'KH2012:KH.S1552.1.v1...' > 
  2. Transcript 'KH2012:KH.C9.287.v2....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C9.287.v2.A.nonSL6-2

Possible name(s)

HERC3; HERC6; RCCD1

Gene model

KH2012:KH.C9.287

Location

KhC9 [4,989,034 / 4,992,465]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 233

>KH.C9.287.v2.A.nonSL6-2
EFACCEYRQILWKDSFTFKNLCSIDEKLLRRGLTNNLGRELTKENISSKCIQSILNFDNH
GYGILQDNGEFVLQFEPERSEIFTKRHVGSVAKDSNGFYLVADDVLLHCNNILESPIIMR
PMFSSHKVRNVSCGNCHSLLSTHNGNVFSWGIGSHGQLGHGDMETLKQPQLIDALGGVCI
KRVGAGGWHSAALAGILTFQMLYICCKLFSKQHFIYLHINNLCRSTLYIVLNI

Nucleotide sequence

Length: 1,726

>KH2012:KH.C9.287.v2.A.nonSL6-2
TTATAAGTGATAAGCATGTCATCTGGTGTAGCAATAGGAGTTTGCTTGCTGCGAGTACAG
ACAAATATTGTGGAAAGACAGTTTTACTTTTAAGAATCTTTGCAGCATAGATGAAAAACT
ATTGCGCCGTGGGCTTACTAACAATCTGGGTAGAGAGTTGACGAAGGAAAATATATCATC
CAAATGCATCCAATCGATTTTAAACTTCGATAATCATGGTTATGGAATACTACAGGATAA
TGGAGAATTTGTGCTGCAGTTCGAGCCTGAGAGAAGTGAAATATTTACAAAACGCCATGT
TGGATCTGTAGCAAAAGATTCAAATGGATTTTATTTAGTAGCAGATGATGTGCTACTACA
TTGCAATAACATCTTGGAGAGTCCTATTATTATGAGGCCAATGTTTTCAAGCCACAAAGT
AAGGAATGTTTCATGTGGTAATTGTCACAGCTTATTATCAACACATAACGGAAACGTCTT
CAGCTGGGGAATTGGCAGTCATGGACAACTTGGACATGGTGATATGGAAACATTAAAGCA
ACCACAGTTGATAGATGCCCTTGGTGGTGTTTGTATTAAGCGTGTAGGGGCTGGTGGGTG
GCACTCAGCTGCTCTGGCAGGTATATTAACTTTTCAGATGCTTTACATTTGTTGTAAATT
GTTCTCAAAACAGCATTTCATTTATTTGCATATTAACAACCTCTGCAGATCAACTTTATA
CATTGTTTTAAACATATAACACTTAGTTATCATCTTTGTATAATGCTTTGAAATGTGATT
CTAAACAATATTCCATATTTTTGTGATACTGGGTCAAAAATGTGCTTTTTACACATTAAA
TCAGTAATATACTTTTAAGAGTTTTAATTTATTTAATGTTTTACAAAATAAAAAACTTTG
GCAGACACTGATGATTTGTATGTCTGGGGTTGGAACCAGTCAGGTCAGACTGGATTTCAA
GCCCCAGTTGGTATTTGCACCAACTCCACTGAAGCACTTAAAATGGAAAATTCTACAAAA
GATTCCAATGCCATAGGTGTTGTTCTAAACCCAACATTGTTAGAACTTGAAATGTGTGCG
GATTCAAACAGCTTTGTTTCTATTATTGATGTATCCTGTGGTGTTAGGCACACTGCTGCA
GTTACTTCGTGTGGGACTTTAATCACATGGGGTTGGGCACGATATGGTCAAATATGTCAC
TCATGTTGTAAACCAGACACTGATATCCCAACAGACAGCGTACATTGTGAAGCGCATTTG
CCACAGACTGTGATGTGGTTTAAAACACATGGTTTATATGTAACTGGTGTAGTGTGTGGT
CCATGGAATACGTTTGTAACCACGAGTGATTATGGTTAATCATTATGTTAATACATTGAT
GCGGTTTCCAGTTCTATTACTTTATGAATTTAAAAATCTTTGCAAGCTGGTATGTCTTAT
CGCACGATTTTACAAAAGATAGTTGCAGAACTATGCAAACCAAACTGTGTTTGATTTAAT
CAAGCAGTTTGATAATTTAACCTTATTTTATTTACATGCAAGTAAAATATTTTTGTGCCA
CAAGATTAAAATTCCAGTGTCATACCAAAATTCGTATAGTGTTAAACTTAATCATGTTAG
GCATTTATTAGCGTACTTCGCACTTTAATTCATTATCGTAGCTGGTGACTTTTTAAAAAA
CAAAATGCATAAAAAAGTGGAACGGAATACAACTTTGCTCTCTTTT

InterProScan

Gene3D
RCC1/BLIP-II (IPR009091) - T[69-204] 2.2E-21
SUPERFAMILY
RCC1/BLIP-II (IPR009091) - T[74-193] 5.49E-21
Pfam
Reg_chr_condens (IPR000408) - T[144-193] 5.6E-11
ProSiteProfiles
Reg_chr_condens (IPR000408) - T[145-196] 15.187

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RCCD1_HUMAN 33.775 % 80.5 1.07E-17