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  1. Transcript 'KH2012:KH.C9.137.v2....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C9.137.v2.A.nonSL5-1

Possible name(s)

MARCH2; MARCH5; MARCH8

Location

KhC9 [5,681,981 / 5,691,604]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 577

>KH.C9.137.v2.A.nonSL5-1
ELTRSTYHCCFMTPEMLYLDHNRLMACDQNYNCSDRGNCENGICVCQVQFAGENCTQVNI
GYAAAFGSIFSVLALVSIAQLVICIYTEYRRLKHPTFRSVFRVTTQKLLHGLVIAACMTR
VLFFSLQGVIPEEWIPPMESAYHPFLITGLSLVVCYWSEAFFIETASMEASRRAQFLSKS
LAAFSVFNVSLYILLIGYFVATGIGCYSGHNHGVWIHGAFQASFAILLFAVYVIFLAIGV
EIFFKVKGAFTLSNNEGQSSSSDESVNHREVFKSRLALVFQALLTLLTVLCVVFDAVGNL
WKYKVNPSTRSAHEVIYRIAEVGAVLWFPCVLWNTATPEKLWFLNPRCLLQLRSDAAEQL
LSTPTTSQKSYNTFQQQEDITIPENKEKITGECWICYDPDNVNGGDFIRPCLCKGGMAVV
HHHCLRKWLLQHPNIEESCCKVCKHRYSIEQQRLRFFSLIMKSKRTSMIIPAIIVAVAAP
CVCVVLFLLSNPIQTYLKVLVLGSTILLELAAFKVVGLNFTKLYQVTRESALRILNYKTE
EISDVQFDYDVIDDTVMSQHESIVPSTTDTRVLVHVT

Nucleotide sequence

Length: 2,815

>KH2012:KH.C9.137.v2.A.nonSL5-1
GAGTTAACAAGATCAACTTATCATTGCTGTTTCATGACTCCAGAAATGCTTTACCTAGAC
CACAACAGATTAATGGCTTGCGATCAAAATTATAACTGCTCCGACAGAGGAAATTGTGAA
AATGGGATATGTGTATGCCAAGTGCAATTTGCAGGTGAAAACTGCACCCAAGTAAATATT
GGATATGCAGCTGCATTTGGAAGTATTTTCTCCGTTCTTGCGCTTGTCAGTATTGCGCAG
TTGGTTATATGCATCTACACAGAGTATAGAAGACTCAAACATCCAACTTTCAGATCTGTT
TTCCGCGTCACCACGCAAAAACTTCTTCATGGATTAGTAATTGCTGCATGCATGACAAGG
GTCCTGTTTTTCTCATTGCAGGGTGTGATTCCAGAAGAATGGATTCCACCCATGGAGAGT
GCTTACCACCCATTCCTAATTACTGGGCTGTCATTAGTGGTCTGCTACTGGAGTGAGGCT
TTTTTCATTGAAACTGCGAGCATGGAGGCGTCACGTCGCGCACAGTTTCTTTCTAAATCC
CTCGCGGCATTTTCGGTGTTTAATGTTTCACTTTACATTCTCCTTATCGGTTACTTCGTT
GCCACGGGCATTGGTTGTTACTCAGGACATAATCATGGTGTATGGATACATGGGGCCTTC
CAAGCTTCGTTTGCGATTCTTCTCTTTGCTGTGTATGTTATTTTCCTTGCTATAGGAGTG
GAAATATTTTTCAAGGTTAAAGGTGCCTTCACCCTCTCCAACAATGAAGGTCAATCGAGT
TCTTCAGATGAATCTGTCAATCACCGTGAAGTGTTCAAGTCACGCCTTGCATTAGTATTC
CAGGCTCTACTTACATTACTCACTGTATTGTGCGTTGTATTTGATGCAGTTGGTAACTTA
TGGAAATATAAAGTGAATCCAAGCACCCGTAGTGCACATGAAGTGATTTACAGAATTGCG
GAGGTGGGAGCTGTGTTATGGTTTCCATGTGTGTTATGGAACACAGCGACCCCTGAGAAA
TTGTGGTTCCTTAACCCAAGGTGCTTGCTTCAGTTACGCAGTGATGCCGCTGAACAACTC
CTATCAACCCCAACCACAAGCCAGAAATCTTACAACACTTTCCAGCAGCAAGAGGACATC
ACAATACCAGAAAACAAGGAAAAAATCACAGGTGAATGTTGGATTTGCTATGATCCAGAC
AATGTGAATGGTGGAGATTTTATTCGACCTTGTTTATGTAAAGGTGGAATGGCTGTAGTT
CACCATCATTGTTTGCGCAAGTGGTTACTTCAACATCCTAACATTGAAGAATCTTGCTGC
AAAGTTTGCAAACACAGATACTCAATTGAACAACAGAGACTCCGTTTCTTCTCACTGATT
ATGAAATCAAAACGCACCTCAATGATTATCCCAGCTATCATAGTCGCTGTGGCCGCACCA
TGCGTATGCGTTGTTCTATTCCTACTTTCCAACCCCATCCAAACTTACTTGAAAGTTCTG
GTTCTTGGTTCTACTATTCTGCTGGAGCTTGCAGCATTCAAGGTGGTGGGCCTGAATTTT
ACCAAGCTTTACCAAGTAACTCGAGAATCTGCTCTTCGTATTCTTAACTACAAGACTGAA
GAAATCTCCGATGTGCAATTTGACTATGATGTCATAGACGATACTGTGATGTCCCAACAT
GAATCAATTGTGCCAAGCACCACTGATACTCGAGTGTTAGTACATGTAACATAGAAGAAC
TGATGTGCATGGTGTTATATACATATGTTTTTATTATTTGTTACATAAATCATTCTAAAG
TTAAATCAAAGCAGTGTTTTCAGCAAAAATTGTGTTTTTAGCTCTGCTTAGTTTGTTTTG
TATACTCCTTTTGATCAGACAATAAGTTGTGTAGCATTTGGGTGTCTTTTTCTGTTACTT
AGTTTGTTATGTAGTGAACACTCCAATATTTTTCTGCTTAATATCCATGGCAAAATGTTA
GTTTGGTTTTGTTTTTGCCGCCAATGCCCATTCTATTCTATCTGTTCCTAGCAAACTGCA
TATTCATTGATAAATTTGAACACTCGCTTTATGTGTTTGGTTTCATGATTTTTCCTTGTT
TAAAAACAACTCTGCATTGTAACAAATTTAGAGCAGGGTTTGCCTACTATATACTTTTAA
ATTTGATTAGCTGTTTAATGAAGTTTATAGTCCAAAAACTTATTCTTAGAGTTTTACTAT
TTTTAGTAGTTTATTCTTAGTATGCACAACAAAATGTTTTCATACATCTCCCATTGCGAT
TGTCTTACAAATGTAAATTTAACTCATGTTATCTCTCTTTTTGTGTTGCCCAAACAGATT
TTGGTAAATATGCTTTACATTGAACCTATATGAATATATGGTAGATTTACCAGCACTGCT
TTTTCTGTACCAACATATCATACAACGGATCATATATATCTTATGCACTCACTAACAGTA
TTTGATTTTGTTTTTCTACTATGTCAGAATTCTATACCATATGATACCTCAACCTTATAT
GTCCTGTATATTGAACGCCGTGTCTGTAAATTGGTCAAACTGTTATGTTTCATTATTAGC
TGTCATGTTACAATAGTAACAACAGCATTTGTGAACAACTACACTTTATTCTGTATTTAC
TCGAACTGTTGTTTTTGTGTGGATTGAAACTTTGCTTGTAAAGCGAATTATGTTATTTTT
TTTCTAATCTGACAATGTAATGTCGTTCCCATTCTAATCTGCCGCTTTCAATGCAAAAAC
ATGTTAACTGTAATTATCATGAATAAATAAATAAATAACAATTACAATTGCGGTA

InterProScan

Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[376-456] 1.0E-14
ProSiteProfiles
Znf_RING-CH (IPR011016) - T[385-450] 20.762
SMART
Znf_RING-CH (IPR011016) - T[392-444] 9.0E-10
Pfam
Znf_RING-CH (IPR011016) - T[393-443] 1.6E-10

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value