Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C8.466.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

SLC43A1; SLC43A2; SLC43A3

Gene model

KH2012:KH.C8.466

Location

KhC8 [4,336,572 / 4,338,393]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 485

>KH.C8.466.v1.A.ND1-1
MTMERKQVLSVIAAVFDTLLFGGIIFGWPSLDFVLKREGYFSSKCEIETGDLKNDTAEDS
SEKILNCPSQDIALNLVYTLSAAIGGVSTFPLGYLFDRFGTWKFRSCSISTAILACVAIA
CSNKETSWLLYIALPTVAVCNFAILVSNTPIGYFCVAAQATVISIIYGAFDSSAAVMVVM
KSAYELGATVAEIFTVYGALLLLSLVYTFVLMPRMHVPFNVPDGYQYGATECCCSNNPIS
SPQNTNTPNQSRRKRSGVSESTPLLANQGEEQKTFSSSLKDFSYWLNVLYLSILQLRLNM
FYVTLNQWISTLTSNREQQSKYITAFGFIQLTGILIAPFSGVMTDMMTKYYRKSVTCSEE
VVRKRGVCFTIGCTCLTATIFSALVLIPVLEIQYITFFVQNVARTFLFAGNGAFLATTFS
SEHFGKLNGLTIGIASVVSLLTYPINILVLRVFGGSFVVVDSVFLGLSVLTFVHPVVLFF
RTRHN

Nucleotide sequence

Length: 1,821

>KH2012:KH.C8.466.v1.A.ND1-1
ATGACGATGGAACGAAAGCAAGTTTTGTCAGTGATTGCTGCTGTGTTTGACACTTTATTA
TTTGGTGGAATAATATTCGGTTGGCCTTCCCTGGATTTCGTGCTGAAGCGGGAGGGTTAT
TTTTCTTCTAAATGTGAAATAGAAACTGGTGATTTAAAGAACGACACAGCTGAAGATTCC
TCCGAGAAAATCTTGAATTGTCCAAGTCAAGATATCGCACTTAACCTGGTCTACACGTTG
TCTGCTGCCATTGGCGGTGTATCTACTTTCCCACTCGGTTATCTGTTTGATCGTTTCGGG
ACTTGGAAATTTCGATCATGCAGTATCTCAACTGCGATTCTCGCATGCGTTGCTATTGCG
TGCTCGAATAAGGAAACCTCTTGGTTGCTATACATAGCATTGCCAACTGTGGCTGTGTGT
AATTTTGCCATTCTCGTTTCGAACACTCCAATCGGATACTTTTGCGTAGCAGCGCAAGCA
ACAGTAATTTCTATCATCTATGGTGCGTTTGATTCTTCAGCAGCGGTGATGGTAGTAATG
AAGTCAGCTTATGAATTGGGAGCAACCGTAGCTGAAATATTTACTGTCTATGGCGCTTTG
TTACTCCTCTCACTTGTTTACACATTCGTGCTGATGCCAAGAATGCATGTCCCATTCAAC
GTACCAGATGGTTACCAGTACGGTGCCACAGAATGTTGTTGTTCTAACAACCCAATCTCT
TCACCACAAAACACCAACACGCCAAATCAAAGCAGAAGAAAAAGATCGGGAGTTTCAGAA
TCAACTCCTCTCTTAGCTAACCAAGGCGAGGAACAGAAAACGTTTTCTTCGTCCCTGAAA
GACTTTTCCTATTGGCTCAACGTGTTGTACTTGTCTATCCTACAACTTCGGTTGAATATG
TTTTATGTCACGTTAAATCAATGGATATCTACGCTTACAAGTAACCGTGAACAACAGAGC
AAATATATCACAGCGTTTGGATTCATACAACTCACCGGGATCTTAATTGCGCCCTTTAGC
GGCGTGATGACTGACATGATGACGAAGTATTATCGAAAGTCTGTCACATGTTCTGAAGAA
GTTGTTCGGAAACGAGGTGTTTGCTTCACGATTGGTTGCACGTGTTTAACGGCTACTATC
TTTTCTGCGCTTGTTCTGATTCCAGTATTAGAAATCCAGTACATTACATTTTTCGTGCAG
AACGTTGCCCGCACTTTTCTCTTTGCTGGCAATGGCGCTTTCCTCGCCACTACATTTTCA
AGCGAACATTTCGGAAAACTTAATGGTCTTACCATTGGAATTGCCTCTGTCGTGTCGTTA
CTTACATACCCCATTAATATTCTTGTTTTAAGAGTTTTTGGCGGTAGCTTTGTTGTTGTG
GATTCCGTGTTCTTAGGCTTGTCTGTTTTGACGTTTGTGCATCCAGTGGTTTTGTTTTTT
CGTACAAGGCATAACTGAAATATTAGTTGCGCAGCCAGTTAGGTAGGAGAAATTTAACTA
CTTCCTTTAACCTATAAATCCTCGCATGTTGTTGTTTGGAAGTTATTTCGTGGTCATTAG
TAAAACATTGTCCTGGAAATATATAATACGGAGATCGAGGCCTGATGCTACTTTTTGTTC
CAACCCAGCGGTTATACTGATGGGTTGTCCACATATAACAGCGGATTGCACCTCGCTGAG
TTACCTTTATGCATTTATACCTCGTACAGTATAGCTTCTATTTAAAATGGTTTGTTAATG
TATGCCCTTTGTTTTGTATATACCTATGTTCGCGTCGTTTCAACAATAACATGTCGAGGT
TTTCTTACTGGCAAACAGGAT

InterProScan

PANTHER	SLC43A3 (IPR027197) - T[3-484] 8.8E-186
Pfam	MFS (IPR011701) - T[73-356] 6.6E-12
SUPERFAMILY	MFS_trans_sf (IPR036259) - T[73-227] 2.75E-19 - T[270-483] 2.75E-19

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
LAT4_HUMAN	23.735 %	114	6.05E-27
LAT3_HUMAN	23.889 %	117	4.21E-28
S43A3_HUMAN	31.959 %	258	1.56E-80