- Transcript 'KH2012:KH.C8.143.v1....'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C8.143.v1.A.SL3-2
Possible name(s)
PPARA; PPARD; PPARG
Gene model
Location
KhC8 [4,433,334 / 4,441,979]
Amino acid sequence
Length: 454
>KH.C8.143.v1.A.SL3-2
IVTLNSSLAVPLCALISYHRTETYTFFSFILIVAPEMTLSDHLKSFLNSTNRNKSNVSNN
GQSKPVMEPAPDIQSSELTSSSPTDQLNSRPSTSSTPSLSSQQHSFELKGILDFISMPPN
SSSQRDPFHGTMQNSTANGSLNKPSKCDDKLEKEPRLKETPTNASTAFQTMKNLSNIKTF
QSMYETICSPSGESFKLLLEQNPGFLEGMDPTKLVSPCDEMLTPDLKARLLFASQVFKKN
IGKDKPTIYKNVIGSKIVQILYSDFQARVVNGICELTEFAKRLPNFHDISLQDQVILLKY
GSYETMFVLFSRLIYGEGMILPKSNIYVTFNFVYQLGVAGDIMKSKFLFAKKMLALELTD
DEMALFVAMIILCPDRPEINDRKLVERIQEKVLFALEYQLSISHPHKPRLFAHLLLKMAE
LRELVSKHVVMVQKLADAKDFVPPLLCEIMQDMK
Nucleotide sequence
Length: 3,371
>KH2012:KH.C8.143.v1.A.SL3-2
TTTCATATATTATCATTAAGTATGTATTCGCCGGATATCGGTAGAAAACCTTGTTCAAGT
TGGTGTTGAGAAGTATAAAATTTATCATTGACCAAAGCGGATATTATTAGTTTATTACTA
CATATCTATTTTGTTAATATGAGTGAGGAAAAATGTGATAAGGTTGACGCCGATGTTTCT
CCCGATTGTGTTAAAACCGAATGCCCCAAAGTGCTTGCACCATTACGAAAAAAGCGACCT
TCTACAAAGCTATTGGTGAAGTCAACGGATTTGAATATACTATGCAAAGTTTGTGGAGAT
AAAGCGTCTGGATTTCACTATGGTGTCCATGCATGTGAAGGGTGCAAGGGATTTTTTCGA
CGGACCATTCGACTCAAAATTGAATACGAAACTTGTGTGCAGTCATGCAAAGTCGATCTT
AAAAGTCGGAACAAATGTCAATTCTGTCGATTTAAGAAATGTGTTGGACTTGGAATGTCG
CGTGATGCAATTAGATTTGGCCGAATGCCCAGACATGAGAAGCAACAAATTATTCAAGAA
ATAGAAAAAAAATCTAACAAGACTGGCTCCACCTCGGGAAATGTACTTGGCTATCAAAAG
CTAATCACAGAAATATCGGAATCGTTTTTGCAACATATTTCACTCACGCAAGAGCGAGTA
AATGCATGTTGGGAGTCGAGAAAAGCACTTGGAGATAAAGTAAGTTAAATTAATATAACC
AACAAGTTATCATTAGGCTGTTTTTAGGTGTAAAATTTGACTCTCAGCTTGTGTATACAG
TATCTGACCAAAAAATATTGATTTTTGCAACAGGCAAAAACATTACACACATTTCATGAC
ATTCCTGCGTGTTTCCCGAATTTGTCGACATATTATGCCCAGTTTAAATCATTTACCACG
CAAGATGACGGGAAACCCAGTAAGTTATAAAACAATGTAGATTGTTCTGAGGTACCTGTT
TGTGTAATTGTTAATCATTTCATATTAGTGATTTTATATCAAATGATGAAGTCTTATATT
CTTCTGAAGAGTGAAGATATAAGGTAACAGTAACGGTCACAGTCTTAAGTTAAAATGTTA
GCATTACGAAGTATTTTAATTTTGCACAATCAATCTCGCATTGTTGTCATCGATTAACAG
TTGTCTGTCCAGTGTCTATACAGATCTGCACAAACAATCTCGCATTCAAACAGTTAACTT
GCATAGCCCACTTAATTTATTGTAAATGCGTCAATTAGTCCAAATGATTTAATTATAATT
CCTTGATAATTAGTCTAATGCTTACTCAGTGGCGCAGCCAGAAAAACTAATGAAAGGGTT
AAAAAAATTGTTTTTGTAAGTTTTTTTTGGGGGGAGGTTTGTAAATTGTGACTCTGAATT
CTTCTCTGGCTGTGCCACTGTGCGCACTGATTAGTTACCACAGAACAGAAACCTATACAT
TCTTTTCATTCATACTTATAGTGGCTCCTGAAATGACTCTAAGTGACCATTTGAAAAGCT
TCTTAAATTCCACCAACCGAAATAAATCAAATGTTTCTAACAATGGCCAAAGCAAACCGG
TTATGGAACCAGCACCAGACATCCAATCATCTGAACTTACCAGTTCAAGTCCCACTGATC
AGTTAAATTCAAGACCAAGCACTTCTTCAACCCCCAGCCTAAGCTCACAGCAACATAGTT
TTGAACTAAAAGGAATTTTGGATTTTATCTCCATGCCTCCAAATAGTAGTTCACAGCGAG
ATCCTTTCCACGGTACAATGCAAAATTCAACAGCCAATGGGTCTTTAAACAAGCCAAGCA
AATGCGACGACAAATTGGAAAAGGAACCCAGATTAAAAGAAACTCCAACTAATGCATCAA
CTGCCTTTCAAACTATGAAGAATTTAAGCAACATCAAAACTTTTCAATCTATGTATGAAA
CAATATGTTCCCCCTCTGGTGAGTCGTTCAAATTATTACTTGAACAAAATCCTGGGTTTT
TGGAAGGCATGGACCCGACCAAACTGGTTTCTCCATGTGATGAAATGCTCACTCCTGATC
TTAAAGCGAGACTCCTGTTTGCATCACAAGTTTTTAAAAAAAATATTGGAAAAGATAAGC
CAACGATCTATAAAAATGTTATTGGAAGCAAAATAGTGCAGATTCTTTACAGTGATTTTC
AAGCAAGGGTTGTCAATGGAATATGCGAGCTTACTGAGTTTGCCAAGCGCCTTCCAAATT
TCCATGATATATCTCTTCAAGATCAGGTAATTCTATTAAAGTATGGAAGCTATGAGACCA
TGTTTGTACTCTTCAGTCGATTAATTTATGGAGAAGGCATGATTTTACCCAAGTCCAACA
TATACGTCACATTCAACTTTGTGTATCAACTTGGTGTTGCTGGAGACATAATGAAATCGA
AATTCTTATTTGCCAAGAAGATGTTGGCACTAGAACTAACAGACGATGAAATGGCTCTCT
TTGTTGCTATGATTATTCTCTGTCCAGATCGACCCGAAATCAACGACCGCAAATTGGTAG
AGCGAATACAGGAAAAAGTTTTATTTGCATTGGAATATCAGCTCTCTATATCTCACCCTC
ACAAACCAAGGTTGTTCGCCCACTTACTTTTAAAGATGGCGGAACTCCGGGAGCTGGTAT
CGAAGCATGTTGTCATGGTGCAGAAATTGGCGGACGCTAAGGATTTCGTCCCACCTCTGC
TTTGTGAGATCATGCAGGACATGAAATAACGATTTTTGCGCACGTATAACGTGGTTTTGG
CTACTCTATGCATATTAAAGCTCAAGCTGAGATTGTGGGGACAGCTTGTTCTAATGTGAT
GGGTATTTATTATTTCCTTCATGCAACCAACATTGTACATGAGATTTTTTTTTAATTTCA
AGAAAGAATTGTAATTAACAATGCTTTTCAAAGTTACATACATTTAACTCCCAATCTAGT
TTATATTTTTTGTAACGTGTTTCCAGTGTGTGTTGTAAAGTGGTGATGTATTGTGCAACT
TTTTTGTTCCTCCGGCGCAAGTGAATATTTGTTTTGAACCTGCCACTGTGATGTTAATTG
TTTTGTAATTTATCTTTTATCGCATTGGTACTATGGGTGCTTTTTTTTGTGCTTTTCCAG
GTTAAGACAAGCTTTGTGTTCTAAGTTTTCGGTAAATTAGAGCTTGAAATTGAACAAAGA
TTCCATTTATTGTATAAGCGATATTTCTGTACTCCGTGCAAAAAATGCCATGTTTTATAA
TTTATTGCTCTCAAGAAATCGAAAATATTTAAGCGACTTTGTCGATGCCGCTATCGGTCG
TGGATAAATAGGGTTGAATTTCCGAGAAAGTATAATGACGATTAAGTTAATGAAAATAAA
AATAATTATTT
| SUPERFAMILY |
NHR_like_dom_sf (IPR035500) - T[251-450] 2.75E-55 |
| PRINTS |
ThyrH_rcpt (IPR001728) - T[265-286] 1.1E-6 - T[291-310] 1.1E-6 - T[356-378] 1.1E-6 |
| SMART |
Nucl_hrmn_rcpt_lig-bd (IPR000536) - T[267-425] 3.9E-22 |
| PRINTS |
Nuclear_hrmn_rcpt (IPR001723) - T[268-289] 2.1E-16 - T[289-305] 2.1E-16 - T[356-371] 2.1E-16 - T[413-430] 2.1E-16 |
| Pfam |
Nucl_hrmn_rcpt_lig-bd (IPR000536) - T[275-430] 1.0E-12 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| PPARG_HUMAN | 40.887 % | 143 | 8.66E-38 |
| PPARD_HUMAN | 42.211 % | 147 | 1.03E-39 |
| PPARA_HUMAN | 41.063 % | 144 | 2.5E-38 |