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  1. Transcript 'KH2012:KH.C7.775.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C7.775.v1.R.ND1-1

Possible name(s)

SLC36A4; TMEM104

Location

KhC7 [5,607,263 / 5,615,672]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 499

>KH.C7.775.v1.R.ND1-1
KHRMYSPAVGVVYIFNLIVGTGALTLPKAMASAGWLVSLILLTLLGFVSYITTTFMVESL
SIANACIRRNKRENLSEDSVAASDTDSDTNRSINPPPPIDPTERSALLDSASSSYTSRRS
SINSNTTSMFSITRAVEMGQMADMFFNKIGRILFYVCIIVYLYGDLAIYAAAVPKSMRDI
VCGNMSCSTNDSNPPQDGDICWGTTITRNNVYQIFLALFTIVLGPFTYFSVQKTKYLQIF
TTVLRWLAFLSMITLAIIHISTTRGGEGHPPVANISGVPNLFGVSVYSFMCQHSLPSLVT
PIRNKRRLPYLLGADYILILLFYMLLGMTAIYCFQSDVIKDIYTLNFQDSCDVTNIIVLR
YFLGLFPVFTLSSNFPIIAVTLRNNLKALFKPSSSFWVNRILFPTIAIVPPIIVAFITNN
LTTLVGITGSYAGAGVQYVIPACLVLLARQEATQYHGSAVVRKNRHRSPFSRRLWVIMVL
AWAAVCLVFVTVNHILSLP

Nucleotide sequence

Length: 1,894

>KH2012:KH.C7.775.v1.R.ND1-1
CTTTACAGTGCGGTGGTCTTGATTAAGCAAATATTCAAAAAATATACGTAAAAGCACAGA
ATGTATTCTCCAGCGGTGGGTGTTGTTTACATCTTCAACCTCATAGTTGGAACGGGAGCT
CTAACTCTTCCCAAAGCCATGGCATCAGCTGGTTGGCTTGTCAGTTTAATATTACTTACT
CTATTAGGGTTTGTGAGTTACATCACAACTACATTTATGGTTGAGTCCTTGTCGATCGCC
AACGCTTGCATTCGAAGAAATAAAAGAGAAAATTTAAGTGAAGATTCTGTTGCTGCTTCT
GACACTGATTCCGACACCAATCGTTCCATAAACCCACCGCCTCCCATTGATCCAACGGAA
CGTAGCGCACTGCTGGATTCTGCTTCATCTTCCTACACCAGCAGAAGATCCTCCATAAAC
AGCAACACAACTTCAATGTTCTCGATCACAAGAGCTGTGGAGATGGGACAGATGGCTGAC
ATGTTCTTTAATAAAATTGGAAGGATTCTCTTCTACGTATGCATTATAGTGTATCTCTAT
GGTGACCTCGCTATATACGCTGCTGCTGTTCCAAAGTCAATGAGAGATATAGTATGTGGC
AACATGTCATGTTCAACGAACGATTCAAACCCGCCACAAGATGGCGACATATGTTGGGGA
ACCACCATAACCAGGAACAATGTTTACCAAATATTTCTGGCATTGTTCACGATTGTTCTC
GGACCATTCACCTACTTCAGTGTGCAGAAAACAAAATATTTGCAAATCTTTACAACTGTG
TTAAGATGGCTGGCTTTCCTCTCGATGATAACCCTCGCTATCATCCATATTTCCACCACT
AGGGGCGGTGAAGGGCATCCTCCAGTGGCCAATATATCCGGGGTTCCGAACCTTTTCGGG
GTCTCGGTTTATTCGTTTATGTGCCAGCACTCCCTCCCCTCCCTTGTGACTCCTATTCGC
AATAAACGACGACTCCCCTACCTACTGGGGGCCGATTATATACTCATTCTATTATTCTAT
ATGCTGCTTGGTATGACAGCTATATACTGCTTTCAAAGTGATGTAATAAAGGATATTTAT
ACCCTCAATTTCCAGGATTCATGTGATGTCACAAACATCATTGTTCTTCGATATTTCCTT
GGGTTGTTTCCAGTGTTCACTTTATCGAGTAACTTTCCCATAATTGCCGTCACATTGCGC
AATAACCTTAAGGCGTTATTCAAACCTTCTTCTTCATTCTGGGTGAACAGGATTCTCTTC
CCGACAATTGCAATTGTCCCTCCCATTATTGTGGCCTTTATTACAAACAATCTAACTACA
TTAGTGGGGATAACGGGGTCGTACGCTGGGGCGGGGGTCCAATACGTTATACCCGCGTGT
CTTGTTCTGTTAGCGAGACAAGAAGCAACGCAGTATCATGGCAGCGCTGTGGTTCGGAAA
AACCGCCACAGGTCTCCATTCTCACGTAGGTTATGGGTGATCATGGTGTTAGCATGGGCG
GCCGTATGCTTGGTATTCGTAACTGTGAACCATATTTTATCATTACCTTAAATTTTACTT
ATTAAGCTCATTAATGGCCTCACAGATTATTTTTCAATTTTCATTGAACAGTTGTTCTTG
TTGTTTATTGTATGATATTGACTGTGTTTTAAAAGTTGTCAATTTTAACTAAAAACTTAA
AATGACAACATCCACTTTTAGCAGTTTCAATTTGCCTTATTTTTGTTTGTTTATTTAAAG
TCTACAATGCAAAACTTTTTGGGGGAATTTTGTGTTTTCTCCTTTATAATAGTTGCCTAC
AGACTACATTTTAATTATTTTACATACAATGTTTAAATGTCTAATTCTTCAACTTTACCA
AATATAGATGGTGCAATCATGCTTCCCTTTAAAA

InterProScan

Pfam
AA_transpt_TM (IPR013057) - T[10-64] 1.1E-10 - T[139-452] 2.7E-14

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
TM104_HUMAN 55.689 % 505 1.54E-176