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  1. Transcript 'KH2012:KH.C5.75.v2.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C5.75.v2.A.ND2-1

Possible name(s)

ITLN1; ITLN2; MFAP4

Location

KhC5 [1,581,573 / 1,588,260]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 606

>KH.C5.75.v2.A.ND2-1
FKMDVDYRNHNPVPNEGIYEQEVCYNPENYEPVTIQNKAVKADSGEIKDGKKLSQKFWKI
FTCLVLLLVFVVATVGIYYIAKNNASKSGESGSSSKLTTTSTSCLDLKNSGVSSDGYHFI
QPNGTDTSIKVYCDMTTSGGGWTLVASVHENDINGKCTTADMWFSNDLARYSIFSRNWEN
RNIFGNVKEATSADYKNIGYSVIKASNVMLRHVPNKTPVDKSKSLASLQYHTSNNFLNKY
GGNLFATYTKHYPMNPKTTVTYPPGINKLVDAIAALSTNITSGIPDFYKYTYGTETDRLR
DGGQNMFTLFGMQLYFYFFCGHYVVHGNEFKCSSSRSVTVSRKSHPFIVVTTIGNLVSSS
NLYYQVHAYRPRSDPVTSYNGKLTEGNFELQYRARCVYGRIVPSLCDVVFAVNNTKDWAS
STTFTWSESTSHQYNHYYYYVYMNTYPRRIMFCYTMLSRTGGRLVTKVQVESTLRKMLQP
FKTYTWSAEPCASNHLVVPVTYTIGESTLSNFVPPFMKLATTTGFLQIRAESHTGTYYAM
CPAVKLNNCDGQYVCIGGVKNGYSQTNDCNDLTDWNGLTYNPDYHASKNFAHSSKDIEST
IMIFYR

Nucleotide sequence

Length: 2,974

>KH2012:KH.C5.75.v2.A.ND2-1
ATTGTCTATGATCCTGGTCCTCAAGCATCTTCGGTGAAAGATCAAAAGGTTTTGATTCAA
GATGGATGTTGATTATCGAAATCACAACCCAGTTCCAAATGAAGGAATTTATGAACAGGA
AGTTTGCTATAACCCAGAAAATTATGAACCAGTAACAATACAAAACAAAGCAGTGAAAGC
AGATTCCGGAGAGATAAAGGATGGTAAAAAACTATCACAAAAGTTTTGGAAAATCTTTAC
ATGTCTTGTTCTTCTGTTGGTTTTTGTTGTGGCTACAGTTGGAATTTACTACATTGCTAA
GAACAATGCATCCAAGTCCGGAGAGTCTGGCTCATCGTCCAAACTTACTACCACCTCCAC
ATCCTGTTTGGATTTGAAAAACTCTGGAGTCTCCAGTGATGGTTATCACTTTATTCAACC
AAATGGAACTGACACTTCAATTAAGGTATATTGTGACATGACAACATCTGGTGGTGGTTG
GACGTTAGTAGCATCTGTTCATGAGAATGATATCAATGGAAAATGCACAACTGCAGATAT
GTGGTTTAGTAATGACCTAGCACGATATTCGATATTTTCAAGAAACTGGGAAAACAGAAA
CATATTTGGAAATGTAAAAGAAGCAACTTCAGCTGATTATAAAAACATTGGATATTCTGT
GATTAAGGCATCTAACGTGATGTTACGTCATGTACCAAACAAAACTCCTGTGGACAAATC
AAAATCTTTAGCAAGCTTGCAATACCACACAAGTAACAACTTCCTGAACAAATATGGTGG
GAATTTATTCGCAACCTACACAAAGCATTACCCAATGAATCCCAAAACAACAGTTACCTA
TCCACCCGGCATAAACAAGTTGGTTGATGCTATAGCAGCTCTCTCTACAAACATAACTTC
AGGTATTCCAGACTTTTACAAATATACATATGGCACTGAAACCGATCGTTTACGAGATGG
TGGTCAAAATATGTTTACCCTTTTTGGAATGCAGCTTTATTTTTATTTTTTCTGTGGCCA
CTACGTTGTGCATGGAAACGAATTCAAATGTTCATCAAGTAGAAGTGTAACAGTAAGCAG
AAAATCTCATCCATTTATTGTTGTAACTACTATTGGAAATCTAGTTTCATCTTCTAATCT
GTATTATCAGGTTCACGCCTACAGACCAAGATCCGACCCAGTCACCTCATACAATGGTAA
ACTAACAGAGGGCAACTTTGAGCTTCAATACAGAGCTAGATGCGTTTATGGAAGAATTGT
TCCAAGTCTTTGTGATGTTGTGTTTGCAGTTAACAATACAAAGGATTGGGCTTCATCTAC
CACATTTACTTGGTCAGAATCTACAAGCCATCAGTACAACCATTACTATTACTATGTATA
TATGAATACCTACCCAAGAAGAATAATGTTTTGTTACACCATGCTGTCAAGAACTGGTGG
GCGACTTGTTACCAAAGTTCAAGTTGAATCAACTCTTAGGAAAATGTTACAACCTTTTAA
AACGTACACCTGGTCAGCAGAACCATGTGCATCCAACCATCTAGTAGTACCAGTTACATA
CACAATTGGTGAATCTACTTTGAGCAACTTTGTTCCTCCTTTCATGAAATTAGCAACTAC
AACTGGATTCTTACAGATTCGTGCTGAATCACATACTGGAACTTACTATGCTATGTGTCC
TGCTGTTAAATTGAATAATTGCGATGGACAATACGTTTGCATTGGTGGTGTAAAAAATGG
ATATTCACAGACAAACGACTGCAATGATTTAACTGATTGGAATGGATTAACATACAATCC
AGATTACCACGCCAGTAAGAATTTCGCGCATTCGAGTAAAGACATTGAATCCACCATCAT
GATTTTTTATCGCTGAAAGCGTTTTTTCTCTGATTAAGTTTCTAAGCTTTTATAACCTAT
ACTTTCTTACATTTTGTATAAAAATAATATAATGTAAACCAATGTCTATAACATAAGGGA
TTTCTAGGGTGGCTTGTCACCTCCACTTTTTAGATTGAAAATTTTAGTTTAATTGCAAAG
TACTTTTCTAACTGATAAAAAAGTTTAAGTGTATGAAACACATTTTGTTCAATATATGTC
TCATCACATATATTTTTTACGGCTGTATTTTTTTTATTCTTCTTGGGTGGGGTCTTGTCA
AGGACCTGGGATTTAAGCCACATTTGGCCCATTACCGCAACAGCCAGAAAGCCCTTTTTA
AGTTTTATACGCGACCGGTGCCCAACATCGCAGCCAGACACCTATTTTTCGCACCATTTT
TATTCTCCTGTGCTTCTGAGTTACCACACTTTTTAACTTTGTGTATGACTTTTGCCCTGA
TATAGCTTATGATTTGGACAACCTATTAGTGACAGCTGGGTTGGAGTAATATCCGTCAAG
TGTCTTGCCCTAGGACACATATGCTAATCAGTATAAGTATCGCTGTCGAGCAACAAACTG
GTGACACTTCGGTTACGATGCAGACGCCTAAACCACTGAGCCATGGCGCCAGATTTTTTA
GTTGTGTTAGTAATACCTTTTATTCAATAAATTGTATACTACTGTTTCAAGCGCAAGCGT
GTTAATGCATGTTATTTTACTGTTACTTTTCGTTTTTGTGTATTACTAAAAGCTTAATTA
ATGTAAACAAAAAATAGATTAATAAAGGTTATGTTGTATAATAATACACATTGTTAATCA
TCTTTATTTCTATTAAATTAAAGATTAGATTACTGAAATAATTGATTTATTCTTTTTTTT
TGGAGTGATCTAATACTGAATTGTTCAAAGCAAAATTGGCACATTGAATAGGAGGTAGGA
AGTCGCTACAACATATTTAATCGACTCTGCTTTTGTAATTCTTTTGTGTATAAATTTCAT
TTTTTTGTGTGTTTTATTATATAAGTTTTATCTCTTTTTCTTTATTATGTTTCCTGGTGT
AATTACCAATAATGACATTTTGTAAATATTCAAT

InterProScan

Gene3D
Fibrinogen_a/b/g_C_1 (IPR014716) - T[78-201] 1.4E-11
ProSiteProfiles
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[95-155] 13.573
SUPERFAMILY
Fibrinogen-like_C (IPR036056) - T[100-254] 2.09E-24
Pfam
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[103-149] 3.0E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ITLN2_HUMAN 42.365 % 136 1.45E-35
ITLN1_HUMAN 40.816 % 132 1.9E-34