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  1. Transcript 'KH2012:KH.C8.273.v1....'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C1.379.v2....'
  3. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R49....'
  4. Transcript 'KH2012:KH.C5.377.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C5.377.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

LMBRD2

Location

KhC5 [3,794,773 / 3,803,107]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 752

>KH.C5.377.v1.A.SL2-1
SIKMSAGPLVFELIVVFCVAVFLLHHYGRITKQHPAVTVATLVAWYFSMIIVFILPLDVS
STFYRECLQSSRVIENVTDSSDVIADNVTTWTVAAVTTITTSAYQHTTTDNTSTLLPNST
TYQNLNNSEFRQRHSLNNDSNKIIYVANTCEKPWSYVKKDTLPAMWHIVYWTSQFLTWLV
LPFMQSYVCAGDFSTLGKMKRAVIENAVYYGSYLFIFGCLLIYVAAAPDLSLDLKQLKVI
LITASNTWGLFLLVLLLGYGLVEVPRGLWHAADNAISMAQTYFKLSKLSTEKQEALEDLE
DVLEEVKKVSSIVRYNHPVRKYVSEIILKCPEDLRSQMSQGMDDYEDYENSGRSRNEVPS
ENSLVKLHRKLIRAVHTKKRTAVQWRILMERGLHLENIAKNEISIDRYWREEFPTTEPRN
AVSKFMCTPGTKWWWYCKIQPLARRILAVCLILLSIMVVWSECTFFNEKPVLSLFAIFIN
LAKKNYDYYYIELASCLTISYLCVCAYYTVFRLKVFNFYYIAGHHQTDETSLLFVGISLC
RLTAPLCLNFLGMIHLDTHITADTGVETAYTQIMGHLDVISFISDGFNIYFPILVCVLCV
GTYFNIGQRCLSVLGFQRFVGGNDDLTSDLIEEGRQLVNREKRKMKLKFKSLERSERSRA
YGHDTDMNTRQWHGKRMQNVENESDDASAIGRNNKRKNDKLELLNDVEPIDYSSTSNSRV
RASPPMSESRWGSSSQPNYVANQPPKNIFDDV

Nucleotide sequence

Length: 3,226

>KH2012:KH.C5.377.v1.A.SL2-1
GTAGCTTATAGTCGATTAAAATGAGCGCTGGACCTTTGGTGTTTGAACTAATAGTCGTTT
TCTGCGTTGCCGTCTTTCTGCTTCACCACTATGGTCGAATTACAAAGCAACATCCAGCAG
TGACTGTTGCAACACTTGTGGCATGGTATTTCAGCATGATTATTGTGTTCATTTTACCCC
TTGATGTTTCATCGACATTCTACAGAGAATGTTTACAGTCATCCAGAGTTATCGAAAATG
TCACAGATTCCTCTGACGTGATAGCTGACAATGTTACAACATGGACTGTGGCAGCGGTTA
CCACCATAACAACGTCTGCTTACCAACACACAACAACTGACAATACCTCCACCCTATTAC
CCAACTCCACCACTTACCAAAACCTAAACAACAGCGAGTTTAGACAACGGCACAGCTTAA
ATAATGATTCAAACAAAATCATCTATGTTGCAAACACTTGCGAAAAGCCTTGGAGTTATG
TGAAAAAAGACACTCTGCCTGCTATGTGGCATATTGTTTACTGGACTTCCCAATTTTTGA
CATGGTTGGTTTTGCCATTCATGCAATCCTATGTTTGTGCTGGAGATTTCTCTACACTGG
GTAAGATGAAGAGAGCTGTGATAGAAAATGCTGTTTATTATGGATCCTATTTATTCATAT
TTGGTTGCTTGCTTATCTACGTTGCTGCTGCTCCAGATTTAAGTTTGGACTTGAAGCAAT
TAAAAGTTATTCTTATCACGGCGTCAAATACTTGGGGGTTGTTCCTTCTTGTGCTTCTGC
TTGGCTATGGCTTGGTGGAGGTGCCACGCGGCTTGTGGCATGCCGCAGATAATGCCATAT
CCATGGCACAGACCTATTTCAAACTTTCAAAGTTGAGCACGGAGAAACAGGAGGCACTAG
AAGACCTGGAAGATGTTTTAGAGGAAGTGAAAAAGGTTTCAAGCATTGTCCGTTACAATC
ATCCAGTGAGAAAATATGTTAGTGAGATCATCTTAAAATGTCCGGAGGACTTACGATCCC
AAATGAGCCAAGGAATGGATGATTATGAGGATTATGAGAACAGTGGAAGATCAAGGAACG
AAGTACCAAGTGAAAACTCACTTGTCAAGTTACACAGGAAACTTATCCGTGCGGTCCATA
CCAAAAAACGTACAGCAGTTCAGTGGAGAATTTTAATGGAACGGGGTTTGCATCTGGAAA
ATATCGCCAAAAATGAAATAAGCATTGACAGGTATTGGAGAGAGGAATTCCCAACCACAG
AACCCAGGAATGCAGTTTCAAAGTTCATGTGCACACCTGGCACAAAGTGGTGGTGGTATT
GCAAAATACAACCTTTAGCTCGAAGAATTCTTGCCGTTTGTCTAATCTTGCTCTCTATCA
TGGTCGTGTGGTCAGAATGTACGTTCTTCAACGAGAAACCTGTTCTTTCACTTTTTGCAA
TTTTTATAAACCTTGCGAAAAAGAATTACGACTACTATTATATTGAGCTGGCTTCTTGTT
TAACCATCTCCTACTTATGTGTATGTGCGTACTACACTGTGTTCAGGCTTAAGGTTTTCA
ACTTTTACTACATAGCTGGCCATCACCAGACTGATGAAACTAGTTTGCTATTTGTAGGAA
TATCCCTGTGTCGACTTACAGCCCCTCTTTGTCTTAACTTTCTTGGTATGATTCACCTTG
ACACTCATATAACTGCAGACACAGGTGTAGAAACAGCATACACACAGATCATGGGTCACT
TGGATGTTATTTCGTTCATATCTGATGGCTTTAACATTTACTTTCCAATCCTGGTGTGTG
TTCTGTGTGTGGGGACTTACTTTAATATCGGACAAAGATGTCTCTCAGTCCTTGGATTTC
AGAGGTTTGTTGGTGGAAATGATGATTTGACTTCTGATCTTATTGAAGAAGGAAGGCAGC
TTGTTAATAGAGAAAAAAGGAAAATGAAACTCAAGTTTAAATCATTGGAAAGATCGGAAA
GAAGTCGTGCTTATGGTCACGATACGGACATGAACACAAGGCAGTGGCATGGAAAACGTA
TGCAGAATGTGGAGAATGAAAGTGATGATGCATCTGCTATTGGTCGTAATAACAAGCGCA
AAAACGACAAACTTGAACTTCTGAATGATGTTGAACCAATTGACTATAGTTCTACTTCCA
ACAGTAGAGTTAGGGCAAGTCCACCCATGTCTGAATCTAGATGGGGATCATCTAGTCAAC
CAAACTATGTTGCCAACCAACCCCCAAAGAATATATTCGATGATGTATGAAACTTGTGTA
CTGAAGTAATTGGTATAAAACTTATGGGAAAATGTAGCATACATGTTAGTACATATCTGA
ACTGTAACAAATTTATGTGAAGTCCTATGTTGTTATTATTGTTTTATCTTTTTTTATGTT
TTAAATGGTCTGCTTTGCCACGCATAAATTTATTTTATTTGGACCCCAACAAAAAATAAC
CAGGTCTATAACCATATGTTTTAACCTAGAAAATATATTTAATTGTCTTGTTTTTAGTTG
GTTTTCTGTTATTTATTTATTATTTATTCTCTCTCTCTCTATATATATAGCTAACTCATA
CAGTAGTATGCGTTTATTGCCTATGTCATTGCTTCGAAAAAACACACACAAAAGCGTTTT
AAACTTTAGTATGATATTTGATATACATTTAAAAAGCTGTCCCTGGCCTTGTAAAATATA
TGTCTGATAATTTTAATGTTATAGCTGGTGTATAAGTATACCAGAAGAGAAAAGAATCCT
GCCTCTGTGTTGTGCAATTCGAAGCTATCTTTTGGACAGATTTTTTTCATCCATATTTTG
CACAGTATGGAATATAGGCTCATTGCACTTCAATTTGTTCTTGTTGTATAATGTACATTC
CCCGCTTTAAATTGTATTGATAATTTAAAAACAACAAGTATTTATCTAAATATCATTTGT
TTCCATTGGCCAGTGCAATTTAATTAAAAATTGCTTTTTTTGAGTTTACATGTATAATAT
AGAAATAGGGTACCTAAACCTGTGTTAAAAAACCCAAACTTTCTCTTAACATTTACACCA
TTCCAATGCAAAAGTGTAAGTCCATTTACCATTACGTTATGCTTATGCAGATATAATGTT
ACAGATATACCATAGTGGCATAGTACATATGTGTGTAGTGCAATGGTGGTTAATATGTTG
TGCTTGCTATTCCTATTGTAATAAACTTTATCTACTGTGTCGCATA

InterProScan

Pfam
LMBR1-like_membr_prot (IPR006876) - T[4-606] 2.7E-178

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
LMBD2_HUMAN 45.238 % 621 0