Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C4.95.v1.A.nonSL8-1

Possible name(s)

TMEM136; TMEM56

Gene model

KH2012:KH.C4.95

Location

KhC4 [3,620,407 / 3,622,424]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 286

>KH.C4.95.v1.A.nonSL8-1
NNMDLIVQRVTGWVILWFTLYRTCKIVFNKKQPEYNCRIVTLLHAICITLTSCYLTFFQG
SNPYTVLGFPNTSAQVTCLTISLGYFLYDFMWCLYYQTEGPVMIMHHIVSITFMAVCLYL
GVSGTETVATIFGSEVTSIFLNIRWFLKSHEMYNNAIVGYTVDFIFVLLFLIVRIGVGGT
LMYSVWASDRPPSMVKAGGTMFYFINCIFLVQIISFSRYRLKNWSNSSAMKNGINQPNST
NMLKHIGTAENISINGHKLNGAAKLLHQDHVLLKPCVFDNTKLLTK

Nucleotide sequence

Length: 1,411

>KH2012:KH.C4.95.v1.A.nonSL8-1
CTGGTGGTTTAGAAGTACGACGCGATGAAGACCTATATATTTTGTGCCTGTATACAGTGT
TTGATTAGTGAGGAGAATTGAACTCGCCGGTTATAGCACACAAGCTATAGTTAATCATTA
GGAAGTTTATAATCATTGTGAACCTATTCAAACAAGAATGGAGTGTTTATAAAACTAGAT
AGTTTATCCTGAAGAAGCGTTCCCCTTAAAAAATTGTACTCTGTGTCCCTTATTGTTTCC
CTCTTGGTTCTGTACTTCTGTATGTTGTGTGGCTATAAAACAATATGGACTTAATCGTTC
AACGAGTTACAGGATGGGTCATATTGTGGTTTACACTGTATCGTACTTGTAAAATTGTCT
TCAATAAGAAACAACCAGAATACAATTGTCGAATTGTAACACTTCTTCATGCGATATGTA
TTACTCTGACATCCTGTTATTTGACATTCTTTCAGGGATCAAATCCATACACAGTGTTGG
GTTTTCCGAATACAAGTGCACAAGTTACTTGTCTGACAATTTCATTGGGTTACTTTCTTT
ATGACTTCATGTGGTGTCTTTATTATCAAACTGAAGGGCCTGTTATGATCATGCATCATA
TTGTAAGCATTACATTCATGGCAGTTTGTTTATATCTTGGTGTATCTGGGACAGAAACAG
TAGCAACAATATTTGGAAGTGAGGTTACTTCAATATTTTTAAATATTCGTTGGTTTTTGA
AATCTCATGAAATGTACAACAACGCGATTGTTGGATATACTGTTGACTTCATATTTGTTT
TGCTTTTCCTAATTGTACGCATTGGTGTTGGTGGTACCTTGATGTACAGTGTATGGGCTT
CAGACCGACCACCTTCAATGGTGAAAGCTGGTGGTACAATGTTCTATTTCATCAATTGCA
TTTTTCTTGTTCAAATCATATCATTTTCAAGGTACCGTTTAAAGAATTGGAGTAATTCAA
GTGCAATGAAAAATGGAATCAATCAACCTAACTCCACTAATATGTTGAAACACATTGGCA
CAGCTGAGAACATCTCGATAAACGGACATAAATTGAATGGCGCTGCTAAACTCTTACACC
AAGATCATGTGCTTTTAAAACCATGTGTCTTTGATAATACAAAGTTGTTGACCAAATGAT
ATTTATTATATATGTATTAAGTATATTTTATATGTTTGTACTATTGTGCCTTTTATTATA
CAGAATACCCATTGCTACTTTTTGTTCCTTTTTACATGCTTTGTTTTATTCCCATGTGCA
CTCGATTAATGTATAACGATTATATTGCGTCAATGTCCTAAAAACAGTATGTTTTGAAGC
ACAATATTAATTTGCTAATACAAGTCTTTACCACAAGCGCAATGATAGAGTACTTCATAA
ATTCCCAAAGATGTCTCTTTTAATAAAGATC

InterProScan

ProSiteProfiles	TLC-dom (IPR006634) - T[30-222] 19.341
SMART	TLC-dom (IPR006634) - T[30-222] 5.5E-17
Pfam	TLC-dom (IPR006634) - T[38-213] 4.7E-16

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
TM136_HUMAN	38.428 %	159	1.22E-47