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  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.620.v3....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.620.v3.A.SL1-3

Possible name(s)

DENND1A; DENND1B; DENND1C

Location

KhC1 [2,748,493 / 2,765,248]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 882

>KH.C1.620.v3.A.SL1-3
KWYNNRMAKEKHITETSLGSRLRDDATKIFDCFLIVERNAEENGPATELIFPSEFQDKEI
IQQSLLFCFPFDRSANESPLKKNSNHYTFILTDIEGKHRFGFCKLTNNATKCYCLLSFMP
WFEIFYKMLNFVCELRTQNQHDALMTMIQNLYNEPVPSSLQTFRINETLVFTAPDMTALS
SIPENRNLSEYYSNVNTGFMMDMFTSLMFERRVIFTSTNLSTLTSCVHGAEALLRPLHWQ
HIFIPVMPAHLVDYCLAPMPYLVGVHSSLMPKVRDMIAMDCDIIVADIDKEEIESVHEDM
ERMPSDVMSFLKSLLRKPTVMVGTNLSMAFLRAQARLIGGYRDGLKFRPGEAIVFDEDAF
IESYKTSSGREYARMLVQLQTFKQFVDGRLDMLNAGIGFRDVFENEVNIVDAAKGNSSET
YKEWVNAAKKGGNELFMQFKRKAKGNMKAFQNALKQPDKTIISPTKEQKTLEEAPKRIRP
SRPARLPHQTHLSTTRRYRPLDLDDESMSSPDDSAKTERSMSDAFEHVEVDLVSDMSLAM
DRITNNQTSTTEQPTQPDLLDFNQDVLEITNPAQSEINSTKPSPKPQRNPSLIRRSAHVI
ARPSLKIKPKLDDVYSSEDLTPSPSDTLDGGILIGEELTNQKPELIKLTNQKQEPSVVDF
NLGTTNEKLKAANTTSASADLFGLDLFSSNQPTPMNSNSNNWVQFHDGNPAVPQNTTASI
KPQKAAPSSITNSTSVDKLLDMHTAHAAPHKLSPEKLNPFLVSNPSIQQPLTSSNFQSPA
FQQNPFYANRFSQYSNMSTTQSVYNPNPINNSTTPFPTNVNPKPAFNWNRDRPVSKSLIQ
NRPAQNGNLQRASTVQPRRANKKGENELFADVLGAWKAREGL

Nucleotide sequence

Length: 3,549

>KH2012:KH.C1.620.v3.A.SL1-3
ACAAAAATGATGTTTGCTTTTATAAGGTGGTCACATCCACCTAGCTGATTTAATTTTCAT
ATATTTATTGGTGCTAATTAGAAGTGGTACAACAACAGAATGGCAAAAGAAAAGCATATC
ACTGAAACTTCACTTGGATCACGACTTAGAGATGACGCCACAAAGATATTTGATTGCTTC
TTAATCGTTGAACGAAATGCTGAAGAAAATGGCCCTGCAACTGAACTTATTTTTCCTAGT
GAATTTCAAGATAAAGAAATAATTCAACAGTCTTTGTTATTTTGCTTTCCTTTTGACCGA
TCAGCCAATGAAAGTCCGCTTAAAAAGAACTCGAACCATTACACCTTTATCCTCACTGAC
ATAGAAGGAAAACATAGATTCGGTTTTTGTAAACTCACCAACAATGCTACAAAGTGCTAC
TGCTTATTGAGCTTTATGCCATGGTTTGAAATCTTCTATAAAATGTTGAATTTTGTATGT
GAGTTACGGACACAAAATCAACATGATGCTCTCATGACTATGATACAGAACCTTTATAAT
GAACCAGTTCCTTCTTCATTGCAAACCTTCAGAATAAATGAAACTTTGGTTTTCACAGCT
CCTGACATGACAGCTTTATCTTCAATCCCAGAAAACCGAAACCTTTCGGAATACTATTCA
AATGTTAACACTGGTTTTATGATGGATATGTTCACCAGTTTAATGTTTGAACGAAGAGTT
ATATTTACTTCAACCAATCTAAGCACTCTGACATCTTGTGTACATGGTGCAGAAGCTCTG
TTACGTCCCCTACACTGGCAACATATATTTATCCCTGTTATGCCGGCCCATCTGGTTGAC
TATTGCCTAGCCCCAATGCCATATTTGGTCGGTGTCCACTCTTCTTTGATGCCCAAGGTC
CGAGATATGATAGCGATGGATTGTGACATCATAGTGGCGGATATAGACAAGGAAGAAATC
GAAAGCGTTCACGAGGATATGGAACGCATGCCTAGTGATGTAATGTCGTTTTTAAAATCG
TTGCTAAGAAAACCAACAGTGATGGTCGGCACCAACCTATCGATGGCGTTTCTGCGGGCA
CAAGCGAGACTTATTGGAGGGTATCGTGATGGTTTAAAGTTTCGACCTGGTGAAGCAATT
GTGTTTGACGAGGATGCATTCATAGAGTCGTACAAAACCTCTTCTGGTCGTGAGTACGCA
CGTATGCTGGTCCAACTTCAAACTTTCAAGCAGTTTGTGGATGGTAGACTTGATATGCTG
AATGCGGGCATTGGTTTTCGGGACGTGTTTGAAAACGAAGTCAATATTGTGGATGCTGCA
AAAGGAAACAGCAGTGAAACTTACAAGGAATGGGTTAATGCAGCAAAGAAAGGAGGAAAT
GAGCTTTTTATGCAGTTTAAGCGCAAAGCTAAAGGGAACATGAAAGCTTTTCAAAATGCT
CTTAAACAACCTGACAAAACAATAATAAGCCCAACCAAAGAACAAAAAACTCTGGAAGAA
GCACCCAAAAGGATACGACCGTCGAGACCTGCTCGACTCCCCCACCAGACCCATCTAAGC
ACCACCCGTCGATACAGACCACTTGACCTCGATGACGAATCGATGTCTTCTCCGGACGAC
TCAGCAAAAACTGAGCGTTCGATGTCGGATGCATTCGAGCATGTAGAAGTAGACTTGGTG
TCGGATATGAGCCTCGCGATGGATCGAATCACAAACAATCAGACTTCAACTACAGAACAA
CCAACACAGCCAGACTTGCTGGACTTTAACCAAGATGTGTTAGAAATCACCAATCCAGCG
CAAAGTGAAATCAACTCAACCAAACCAAGTCCAAAACCGCAGAGAAATCCATCTTTAATC
CGGAGGTCCGCTCATGTTATTGCCCGTCCATCACTGAAGATCAAACCAAAACTTGATGAT
GTTTATTCTTCCGAGGACCTTACCCCTTCACCCTCTGACACATTGGATGGTGGTATTTTA
ATTGGAGAAGAATTGACCAATCAGAAGCCAGAGTTGATTAAATTGACCAATCAGAAGCAA
GAACCCTCAGTTGTGGATTTTAACTTAGGAACAACCAATGAAAAATTAAAAGCAGCTAAC
ACCACGTCTGCATCTGCTGATCTTTTTGGTTTAGATTTATTTTCTTCAAACCAACCGACC
CCTATGAACTCAAACAGCAATAACTGGGTTCAATTCCATGACGGCAACCCAGCTGTGCCA
CAGAACACAACAGCTTCTATTAAGCCACAAAAAGCTGCACCCTCTTCCATAACAAACAGT
ACATCTGTGGACAAGTTGCTCGACATGCACACGGCGCACGCCGCTCCCCACAAACTAAGC
CCAGAGAAATTAAACCCTTTTCTCGTTAGCAACCCTAGTATTCAGCAACCCCTAACCTCA
AGTAACTTTCAATCCCCAGCGTTTCAACAAAACCCGTTTTACGCAAATAGATTCTCACAG
TATAGTAATATGTCCACTACACAGTCAGTATATAACCCTAACCCTATTAATAACTCTACC
ACACCATTCCCCACAAATGTGAACCCAAAACCCGCTTTTAACTGGAACAGGGATCGGCCA
GTTAGCAAATCCTTGATTCAGAACAGGCCTGCCCAAAATGGGAACCTTCAGAGGGCAAGT
ACAGTACAGCCAAGAAGGGCGAACAAAAAAGGAGAAAATGAGTTGTTTGCTGACGTGTTA
GGAGCTTGGAAAGCTAGAGAAGGATTATAAACAGTGTGGGACATCTATGGAAAAGCAAGC
GCAGTAATATCTCGCTAAAATCAATAAATTAGTTTTTCAAAATATTTTGGTGGGGAAATA
TGGGACACCGTTTCATTCTATTTTCTCATATCATTTTGTTGTATGCAAAGAACATTCAAA
GATTTCTCACGACTTTCATAAACGGTTGTTAATTGTTTAAAACATGACCAGGATATTTGG
ATATTATGTGCTAATAGTGTCCCATCTTCCCCCACCCAACTATATATAATTTACAAACGC
CAAAATATTAAGACGGTAAATTACCCCTAAAAATTTTAGATTTTTTATCGCTGGATAAAA
ATTATCCCTAAAATCCTTACTCAACATTCCAAAATGTTAAGTGCATTTTACCTTTCTATA
TTCTCCTTATAACCAGCAATTGATAGCACAAGTTGCTATGCTTAATTCTAAATGACATTT
ACTCATTTCTTTCTTTCTCTATTATTCTTTTTACATTTTAATTTATTTTTTTCATCGTAT
TAACTGAAAAATTGAAATTACATGCATTTATGTATCTCGTTCAAATGTGTGCAATGTAGA
AGATTAAAACACTAAAGTATAGGGTGACTAACCTAAAACTAAGTTTTTCAATTTGTAGCA
GTGCAATTAATCGTATTTACATAAAAAACAGCACATATTTGTGAGTTCATTGTGCTATAA
AACACACAAAACATTTTCTGCACTTTTTGAGAAGTTTCTTTTTCTCATTGTCATTCAAAG
AAGAAAAACTATCATCTGCACTTGGGTTGTTAACTTGTGAAAAACACAATAAATGCAAAC
ATCGTTTTA

InterProScan

SMART
uDENN_dom (IPR005113) - T[26-107] 7.1E-9
ProSiteProfiles
Tripartite_DENN (IPR037516) - T[31-396] 48.724
Pfam
uDENN_dom (IPR005113) - T[61-103] 5.5E-7
SMART
cDENN_dom (IPR001194) - T[108-291] 6.9E-61
Pfam
cDENN_dom (IPR001194) - T[110-290] 1.6E-45
SMART
dDENN_dom (IPR005112) - T[322-389] 5.6E-12
Pfam
dDENN_dom (IPR005112) - T[355-404] 2.8E-7

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
DEN1A_HUMAN 37.795 % 405 2.23E-126
DEN1B_HUMAN 42.431 % 387 6.63E-122
DEN1C_HUMAN 36.59 % 349 1.54E-107