Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Region 'REG00000708'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C12.170.v2...'
  3. Transcript 'KH2012:KH.C14.148.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C14.148.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

ADGRD1; ADGRL2; ADGRL3

Location

KhC14 [3,465,743 / 3,477,647]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 843

>KH.C14.148.v1.A.ND1-1
TAIPDYIITEERAMTHFVLLLIVLLIRSSFGQNDEFRSLGDSDSSAAYADAEYSNEPASY
TAPPGEFERFRETFNVLFESPSVANEKVFNRLTDPLLMDYWTWDDIGHCIATKANERDTS
LSESQLVEVREAIELIEEKKVEAIRPGGNLFFESMNDSRSPLDCEIGHFVTNEYYTNITK
SVERAWNCYRYLPALWLSVIKANKKTCSLKDAMTSVVEVGQTADHPQEPNNPRIVERNSK
LLYTISKPENLNYIKKYLCPHHEVSTCTVVENVICKPGYSAVLQLTEQLQNASQNSPPSD
STEMFVLLDLQSTLGEISNEFNRTETKSASAAKDMLNFYMGIVDNTIGNKGVEVWKNVSV
YYDVTSNTWQSSGCYAKGADTDGITCTCNHTTNFAAFMSPFDADFTMSEEQATWLNAVEY
AGSALSVVCLVASFITFCLVRSSVRNDRLRAHINLVVALFFVHSIQVRLAENTYAKCLCV
TITLLTHYFLLAAFMWMFVEGVFLYLYVVQVFVHSRFESRWWMYALGWGTPLIIVAVSAG
YGIPNEYATCWLDVTSGMTWSFIAPALAVILFNIVILCKVVQYATCWLDVTSGMTWSFIA
PALAVILFNIVILCKVVQVLVKLSERTKGMKSFKATNAIGAQHHVKQGYQMKQKPSSQVP
TAKVTEFKTPPIRYGRSNSDDVSTQELHGNEVTGFPSRSSSQTYSQNFAVGRPRTATVSS
FDETNYLSDIKTAIKGAAVLLPVLGIPWICGMLGYKSFALTIGFVVLNSIQGVAIFLVYC
VFNDEVCRALKRLYQVHRMKHGVAGRGRTSSTSSLKSAFNRGLLRSWRRRSTAISTVSTS
NNV

Nucleotide sequence

Length: 3,848

>KH2012:KH.C14.148.v1.A.ND1-1
AATTCTTTAAATTTTGATTTAAAATATAAACTGCGATACCTGATTACATCATAACGGAAG
AACGGGCCATGACTCACTTCGTACTATTGTTGATTGTTCTACTTATAAGATCTTCCTTTG
GCCAAAATGACGAGTTCCGTTCACTTGGTGATTCAGATAGTTCTGCCGCATATGCTGATG
CTGAATACTCGAACGAGCCAGCTTCATACACAGCACCGCCTGGAGAGTTTGAACGATTTC
GGGAAACTTTCAATGTCCTGTTCGAATCTCCAAGCGTAGCAAATGAAAAAGTGTTTAATC
GCTTAACCGATCCTTTATTGATGGACTATTGGACATGGGATGATATAGGGCATTGCATTG
CAACAAAAGCAAATGAAAGAGATACAAGCTTGAGCGAATCACAGTTGGTTGAAGTGAGAG
AGGCAATAGAACTAATAGAGGAGAAAAAAGTAGAGGCGATTCGGCCAGGGGGGAATCTTT
TCTTCGAAAGTATGAACGATTCCAGATCTCCTTTAGATTGTGAAATCGGGCATTTCGTCA
CTAACGAATATTACACAAACATTACTAAATCGGTGGAGAGGGCTTGGAACTGTTACCGTT
ATCTTCCAGCATTATGGCTCTCTGTAATAAAGGCTAATAAAAAAACATGCAGTTTGAAAG
ATGCGATGACATCTGTTGTTGAAGTTGGACAGACAGCGGATCATCCACAAGAGCCAAATA
ACCCCAGAATCGTCGAACGTAATTCCAAGTTACTTTACACGATTTCCAAACCTGAGAATC
TGAATTACATAAAAAAGTATCTTTGTCCCCATCATGAAGTATCAACGTGCACGGTGGTTG
AGAACGTGATCTGTAAACCAGGGTACTCTGCTGTTTTGCAACTTACGGAACAGCTTCAAA
ATGCTTCCCAAAACAGCCCTCCTTCAGATTCTACAGAGATGTTCGTTTTGTTGGACTTAC
AATCCACACTGGGAGAAATCAGCAACGAGTTTAACAGAACTGAAACTAAAAGTGCATCAG
CTGCGAAAGACATGCTGAATTTCTACATGGGAATTGTGGATAATACGATTGGAAATAAAG
GCGTCGAAGTTTGGAAAAATGTAAGTGTCTATTATGACGTCACAAGTAACACGTGGCAGT
CTTCCGGTTGCTACGCTAAGGGTGCTGACACGGATGGTATAACATGCACCTGCAACCACA
CAACAAATTTTGCAGCATTTATGTCGCCTTTTGATGCTGACTTCACCATGTCGGAAGAGC
AAGCGACGTGGTTGAACGCTGTTGAATATGCTGGTTCCGCACTTTCTGTGGTTTGTCTTG
TTGCGTCCTTCATCACGTTTTGCTTGGTGCGTTCATCAGTTCGAAACGATCGCTTACGAG
CTCATATTAACTTGGTAGTTGCGTTGTTCTTTGTACATTCAATACAGGTAAGACTGGCAG
AAAACACATATGCCAAATGCCTGTGTGTGACAATCACATTGCTGACACATTACTTTCTAC
TTGCTGCTTTCATGTGGATGTTCGTTGAAGGAGTTTTCCTTTATCTTTATGTAGTGCAGG
TGTTCGTGCACTCCAGGTTCGAAAGCCGATGGTGGATGTACGCGCTTGGTTGGGGAACTC
CTTTGATTATTGTTGCAGTTTCTGCAGGCTATGGGATTCCAAACGAATACGCTACCTGCT
GGCTCGACGTCACATCCGGTATGACGTGGAGTTTCATTGCACCCGCTCTTGCTGTCATCT
TGTTTAACATTGTTATCCTATGTAAAGTGGTTCAGTACGCTACCTGCTGGCTTGACGTCA
CATCCGGTATGACGTGGAGTTTCATTGCACCCGCTCTTGCTGTCATCTTGTTTAACATTG
TTATCCTATGTAAAGTGGTTCAGGTGCTGGTCAAATTATCGGAACGAACAAAAGGAATGA
AATCATTTAAGGCAACAAACGCCATTGGAGCTCAACATCATGTTAAACAAGGCTACCAGA
TGAAGCAAAAGCCTTCCAGTCAAGTACCAACCGCCAAAGTTACCGAGTTCAAAACTCCGC
CCATAAGATACGGAAGAAGTAACAGTGATGACGTATCCACACAGGAACTGCATGGAAACG
AGGTCACAGGATTTCCTTCCAGATCGTCATCCCAGACTTATTCACAAAACTTTGCCGTCG
GTAGACCAAGGACAGCCACCGTATCAAGCTTTGATGAAACAAATTATCTTTCAGATATAA
AAACAGCAATTAAAGGAGCTGCCGTCTTGCTACCGGTCCTCGGAATCCCATGGATTTGCG
GAATGCTGGGTTACAAGAGTTTTGCTCTTACTATAGGATTCGTTGTACTTAACTCCATAC
AAGGTGTTGCTATCTTTCTTGTGTATTGTGTCTTCAATGACGAGGTTTGTCGTGCCCTAA
AACGGCTGTACCAAGTCCACCGTATGAAACATGGCGTTGCCGGTAGAGGGCGCACAAGTA
GCACCAGCAGTCTCAAGTCCGCTTTCAACCGGGGACTACTACGATCTTGGCGTCGTAGAA
GTACTGCTATCAGTACCGTCTCCACAAGTAATAATGTTTAGCATTGTAAACCAGGTATTG
CTTTTGTTATAAGCGAAATCTTATTATTATGTACAGGATCATACGTGTTATAGTTCAATG
CCATTGTACAAAGTAAATAAAGAAGTTTTGTTTATATTTGAAAATTTTTATTTTGATTCA
CGTTCAGCACTATAGATGCTTTAAGACCGTTCTGCCATAGCTTGTGGCAAACCTAACGCT
AAAGTTTACTTGCTCGCGTATTAACCCTGTATGTAGTGATTGCTTTTTTTATAACGGATA
CAGCAGCGTCCTTATTTAACCTTCACTTGCATTTATATTAGTTTTATGCATTTAAATCTT
TCTAATCAGTTCCACGCTTAGAATTATAGTAGGATGGGGGAAGACGGGACACCTTAAGCA
CATAATATCCAAACACGGGAGTCGTGAGGATACGATTGATAATTTTTTGAATGTTCTTTC
TTTACTACCAAATGGGAGGAGAAAATAGAATGAAAAGGTATCCCATCTTTCCACACCCTG
GTATACATGCATCACCATTTCCGAACAGTATTATTGTAAACGTTTCGCTGTATCTAACAA
AACAAGATAAACGTGCCATCGAAGAATATTATTAACATTATATCAACATTCGAGTTTATC
CAAACACGCCTCAATATTTGATGTACTGTACACTGTTTACACGTTACACGTTTAGAAAGT
TTTTTTTTTCATTTTAGTTCCAATATTTTTTACACAGTTTCATGATTATCGTATGTTATA
ACATTAATTACTTTTCAAAATCGATGTAGCTTATTTATGTGAAAAAACTAACTTATAGGG
CAAACGTTAATATATAGTAGGGTGGGAGAAGTTGGGACACCTTTAGCACGTAATATCCCA
ATATCCTGATCGTGTTTTAAACAATTAACAACAATATGGTTAGTCGCGAGGTTACGGTTT
TATAATTCTTTAAATATTCTTTGTTTACTACCAAATGAGACGAGAGAATAGAATGAAACA
CTATCCCATCTACCCCACCCTACTATAATAACTTTTTTATGTGCAACGTTTATTGAAAGC
GGTTCTATTACACGGAAAACTTTTCCACAATAGTAAATTGCTTGCTAATGCTCTGTTGTG
TTTTCGTGTTTAATAATAATGACCATATACGCTAAGGCGAAAGACGCTGTGGGGTAATTA
GAAATTCTTCCGCACAGAATTTTTTTTTGCATTGGTAGTAGACAGTGCTTTATTGTGTTA
AAGTTGTTCTGTTTATGTTGCTTGTTAAATTGCGCGTGTGTATACATTCAAGCTGCATTA
ATGCCGAA

InterProScan

SMART
GPS (IPR000203) - T[355-403] 0.01
ProSiteProfiles
GPS (IPR000203) - T[356-403] 10.762
Pfam
GPS (IPR000203) - T[360-395] 3.6E-7
Pfam
GPCR_2_secretin-like (IPR000832) - T[415-582] 6.6E-32 - T[583-775] 4.5E-10
ProSiteProfiles
GPCR_2-like (IPR017981) - T[415-783] 25.676
PRINTS
GPCR_2_secretin-like (IPR000832) - T[417-441] 9.0E-15 - T[481-504] 9.0E-15 - T[520-545] 9.0E-15 - T[560-585] 9.0E-15
ProSitePatterns
GPCR_2_secretin-like_CS (IPR017983) - T[771-786] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
AGRL3_HUMAN 36.321 % 140 8.26E-34
AGRL2_HUMAN 34.234 % 127 6.24E-30
AGRD1_HUMAN 32.567 % 135 1.59E-32