Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C13.126.v1.C.SL1-1

Possible name(s)

AC004223.3; RFFL; RNF34

Gene model

KH2012:KH.C13.126

Location

KhC13 [1,460,429 / 1,462,492]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 364

>KH.C13.126.v1.C.SL1-1
EKRHYTKYLLTILTIACKSRRSMPCACCSAQFSILKWKSRCSNCFQLFCSDCSIGRECRP
CCYVNRCKSSKTSLMQIKVKDLQGYLKNFKIEHRTCKEKHELVKLIQNQFGITSSENIQP
PSSYTTHDNRANEDQRRDDNSDQNQSENSSTDDPAVHLPTPPTYQRTQESFPTAEQFNVS
SSGNDSSIATPIVIEDTEESTSTHNNANTVENNEVTEETSTSYAFSSPAVERTAKKTKIG
LSEIKSVQEIESYSIKQLKTLLQENLVNYKGVLERTELVNRVKNLYEDHVSNESNISDDI
TEENSSSYVTNKDELFCKICWERPRDCVLLECAHMSTCITCGKQLRECPICRQHIVRAVR
VFKS

Nucleotide sequence

Length: 2,063

>KH2012:KH.C13.126.v1.C.SL1-1
TTAATATTGTGTTAGGCAAAAACATTTGATTTAGATGTTTTAAAAACGGTCGGAAAAGTG
TAAAAAATTAAGACAATGTTGGATGCATTTTGAAGTTCATTTATAAAGTATTTTGTACCT
GAGAAAAAAGACATTATACGAAATATTTATTAACAATTTTAACCATTGCGTGTAAATCGC
GCCGCAGTATGCCTTGTGCGTGCTGTTCTGCACAATTCTCCATTTTAAAGTGGAAGTCAA
GATGCTCAAACTGTTTTCAACTATTTTGCTCTGACTGTAGCATCGGCAGAGAATGCAGGC
CGTGTTGCTATGTCAACAGGTGTAAATCCTCAAAGACAAGCTTGATGCAAATCAAGGTGA
AAGACCTACAGGGGTATCTTAAGAACTTTAAAATTGAGCACAGAACATGCAAAGAGAAGC
ACGAGTTGGTTAAACTGATACAGAATCAATTCGGCATCACATCAAGTGAGAATATCCAAC
CACCAAGTTCATATACTACCCATGACAATAGGGCCAATGAAGATCAAAGAAGAGATGACA
ATTCTGACCAGAATCAAAGTGAAAACTCAAGCACCGACGACCCAGCTGTGCATCTGCCAA
CTCCCCCCACATACCAAAGGACACAGGAGTCTTTTCCTACAGCAGAACAATTCAATGTGT
CAAGTTCAGGCAATGATAGTTCAATAGCCACACCGATAGTGATTGAGGACACTGAAGAAT
CAACGTCAACACATAATAACGCAAATACAGTAGAAAATAATGAAGTAACTGAAGAAACAA
GCACCTCTTATGCATTCTCATCACCAGCAGTTGAAAGAACAGCAAAAAAGACTAAAATCG
GGCTTTCTGAGATTAAATCTGTTCAAGAAATTGAGTCTTACTCAATTAAACAGCTTAAAA
CCTTGCTTCAAGAAAACTTAGTTAATTATAAAGGGGTCTTGGAGCGCACAGAGTTGGTGA
ACAGGGTAAAAAACTTGTATGAAGACCATGTGTCTAATGAGAGCAATATCAGTGATGATA
TTACTGAGGAAAACAGCTCATCATATGTTACAAATAAAGATGAATTATTCTGTAAAATAT
GCTGGGAAAGACCTAGAGACTGTGTACTCCTGGAGTGTGCACATATGAGCACTTGTATTA
CTTGTGGAAAGCAATTAAGAGAATGTCCAATTTGTAGACAACATATAGTACGCGCAGTAC
GGGTGTTCAAATCTTAACTTCAAATACGAGGGGTTTTTAATTAAGATTAATTTCGATTTT
TTTTTCGATTGAAAATTAAGCTTTCAAGTCTTGAACTGAGTTAAGAATTGAACTATCTAT
GCAGAATAAATGACACTAGCTACTAACTAGTTGCATTGTAGTAGATCACGCAATCTTGTT
GTTGTAGCTTGTAGGGGTACTAATGGGGTTCTAAATCCCAGTTTCCATGACGTGCCTCAC
TGTATAACCTCACCCATATAGAATAGAATGTGCATATACGCTGTTGGGGTAATGGGTCAA
CTCTGGCTTAAATCCAGGTCCCATGGCATGCCTCACTGTAGGACCTCACCCATATAGAAT
AGAATGTAATACCAAACGCCACCTAGGTTCAATTTATGGAGTGTATTTTAAATAATTTTC
TTCACTACTAAATGCAAAAGTTACAAATATGTTAAAATATATTATATTTTAAAAGTAATT
CTACTAAAAATACCTTTTACTTTTTCCTGCAGCTGCAATTATTCAATTTCCGTTTCATTT
AAAACTGATTTTTCGCTGATAGATTTTAGATATGTAAAACATATTCTATCTATGCTATTA
TAGCTTTAATTTTAGCAAAAATATATAAACATATGCTCACCCATTTTTATTGAACAGCTG
AAGTTCCAATTCTCTAATAACAGCTTTTAAATGGAAAAAATTACTTTATTTAAATTGGTG
CTTTTAACGATGTCAACATTTTCTAAACCTTACATTTCTATTTAATTGCTGACAATTTTT
CGCAGTTTTATTGCAAATGCCAAACCTTGGATGATTTGTGTTTCAACTTTTCAATGTAAT
AAAATAACTTTTACCCTTCGAAA

InterProScan

SUPERFAMILY	SAP_dom_sf (IPR036361) - T[71-109] 2.75E-7
Gene3D	Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[290-364] 3.2E-16
ProSiteProfiles	Znf_RING (IPR001841) - T[317-352] 10.793

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
RFFL_HUMAN	32.665 %	162	6.55E-47
RNF34_HUMAN	30.814 %	145	2.0E-40