Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'KH2012:KH.C12.677.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C12.677.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

MRC2

Location

KhC12 [757,505 / 762,094]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 364

>KH.C12.677.v1.A.ND1-1
LNMTNNKHQGDNCYASIDGGLGKLYYHKQMLSFQEAQNHCRRVDHSQLAIMKDNATLFDV
VASVERYRAHSTTNTCFEHYFWVGLSKDGYKYKWLDGNELDESMKIEFTEDPGKTCVSML
LSGGTPPRWIAQDCLTQLAYLCYTPYTPVTTTLPPSPTQRMLTSSTQRMTTSSTQPMVTS
PTQRMTTNSRPWMRDNSTILAESTPTPPSPQSVSPVIIGAISAGIFALLLALILAVCLYT
RRKKSKREQNLAQNPEVNMGVNHNPVYEESAQEQINTIYNMDMESPLQPDYALITLQPQA
SGSNDVTAPNDDVTAPNDDVTPGPNIDAGPSQKNVASSPPNAIYAAVNKNKQANDVYSVV
NKKK

Nucleotide sequence

Length: 4,192

>KH2012:KH.C12.677.v1.A.ND1-1
AAATGCATCAGGATTGAACGAAAAACCGCGAAATTTAAACTTATACAAAAGAATATAAGA
ACAGATCTGTACACCCTAAAACATGGAATTCGTGACAGACAACAATGAAAGGGGTATGAA
ACACCAACACCCGTGGTATATCGACTGTCGTTTTCCGTCCACGGAGGAAAAGGCAAGTTA
CATTTAAGATGAAAAGACAGATGTTATAACACTGGTGTTATTACTCATGTTTTTATACAC
GTCATGCCCACTTACGAGTTACCATGTTTGTAACTTTGTGAATGTTTTTTTTTGTATAAC
CAACTGATTTTGGACAACCCATTAGTTACCACTGGGTTAGAGCAATGTTCGTTAAAATTT
TGAATCAAGGAAACATAGGCCATAACAGTAGCAGCATCAAGCATTGAACCTGGTATCTTC
TAGTTAGGCTCTACTTCTGTATTATACCGCTGGCTCTATACAAATTCAATTAACCGGCGC
CGTGGCATAGTGGTTAGCGCGCCTGCCTGTAACCCATAGGTATGGGGTTCACTCGTCGCT
GCAACCATTGTGGGCATATGTGTCCTTGGGCAAGACACTTAACGGCAATTGCTTCAACCC
AGTGGTCACTAATGGATTGTCCAAATTACCAGTCATACATAAAAAAAATAAATAAAAATA
TCCCACCAAAAAATAATCACCCACAAAGTAATATACATGGTAACTCGTAAGCTGGCACGA
GGTGTTAAACCCGTGTGATAACGACTGTCATTTTCCGGCCACGCGAGGATAAAGTAAGTT
ACATTCATTCGTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAATGCAGTTCTGATTACA
ATACTCAGTTGTTGCACAATTTAATATTATGACCCACTGTTTATAACAATATATTTATAT
ATTGTATATATTGCAAACATAGGCGCCTAACATGGGTGTGCAGTGCTGGAATAGGATATG
ATGCCTTGTCTGTATATTGTAGGTCTATCTAGTAACAAATCAGTGATGTTGCAATAATTA
AACCGGTAACATTCAATACGGCCTAAACAGCAACATGGTATTCTAAAAGACTCGGTCCTA
TGAATGCAAATTCCCCTTAAATTTCCTGGTCATTGTTTAAACAATAGCCCACTATGCTTG
TGGAGATGCAGTAAATGTGATGATGGTGCAAGTTTTGTTGTTTCCTGGATTGATGGGCGA
CTAGTCAACTGGTAATTTAGTTAAAGAAAAGTGTATACGTAGATTATAGGAAAGGGGGTG
TAGTTGTTATAGTGTATCAGATATATATTACTTTACCTATTGTATATCTGTTTTGTTAGG
GTACAATACAGTTCTCTTTTATTATTACATATTATTTCAGTGCTTGCACAACATAAATGC
CTACGGAAGTTCATAGCAAAAAAAATTATATGTACATGTGTTACACATGATGTGTAGATG
CAACTATTTAAAAAATTAAAGACCTGCTAAGACTTTAATACGATACAGTTTAGACTTTAG
AATTGCGCTACAGTTGAAATTGACCCAAATCAGCAGCTTGTATAAGACAGTAATATGTAA
TAAATTGGTTAGGCTGCACTGTTATTGTACCATACACTATTATTTGTATCTTTCAGTGTT
TTTAGTTCACAGTTTAAGGAAGTTTAAGCGCTCTTCAGTAACTTAACATGACAAATAATA
AACATCAAGGAGATAATTGTTATGCAAGCATTGATGGAGGTTTGGGTAAACTTTATTATC
ACAAGCAAATGTTAAGTTTTCAAGAAGCACAGAATCACTGTAGGAGAGTGGATCATTCAC
AACTGGCAATCATGAAGGACAATGCTACATTATTTGACGTGGTTGCTTCTGTGGAAAGAT
ATAGAGCACATAGTACTACAAATACGTGTTTTGAACATTACTTCTGGGTTGGTTTGAGCA
AAGATGGTTACAAATACAAATGGTTAGATGGTAATGAGTTGGATGAATCTATGAAGATTG
AATTTACTGAAGACCCTGGAAAGACCTGCGTTTCAATGTTGTTGAGTGGGGGAACACCAC
CACGCTGGATAGCACAAGATTGTTTAACTCAGTTAGCTTACTTGTGCTACACACCTTACA
CACCAGTGACCACCACCTTGCCCCCCAGCCCGACACAGCGCATGCTCACCAGCTCCACAC
AGCGCATGACCACCAGCTCCACACAGCCAATGGTCACCAGCCCGACACAGCGCATGACCA
CCAATTCGAGACCATGGATGCGAGACAACTCAACCATTTTAGCCGAATCAACACCTACAC
CTCCCTCACCCCAATCTGTTTCGCCAGTGATAATCGGTGCAATCTCGGCAGGAATATTCG
CATTATTGCTCGCACTTATCCTGGCGGTGTGTTTATACACGAGGCGCAAGAAGAGCAAAC
GGGAGCAAAATCTCGCCCAAAATCCTGAGGTAAACATGGGTGTTAACCACAATCCAGTGT
ATGAAGAATCTGCGCAAGAACAAATCAATACTATATACAACATGGACATGGAGTCACCCC
TGCAGCCCGATTATGCTTTAATCACCTTGCAACCTCAAGCATCTGGTTCTAATGATGTCA
CCGCTCCAAACGATGATGTCACTGCTCCAAACGATGATGTCACCCCTGGTCCAAATATTG
ATGCGGGCCCGTCTCAAAAAAATGTTGCCTCGTCTCCTCCAAACGCAATATACGCTGCTG
TGAACAAAAACAAACAAGCAAACGATGTTTACAGCGTCGTCAACAAAAAGAAATAACTAA
CTGTTCCTTTATATTAATGGTTAGCTCAGTGATTTTACAGCATAGCTGGCAGTATGAGCA
TCAAACTTTTATAAATACAGACGTGGCAGTAAAATCTATACCAACAACTCCATGAACAAA
TTTTGCGGCATCGGGTTTAAAGTTTATTGAATATTTAAATAAATCACTAGAGAAAATTCC
AGGGTTGGCGTACCTACCTTGCCACCCCAGGTTTGGTGCCTATGGGTGGCGGTTCTAAAG
CAGGCAGCCTTTTCACTTAGTATTAGTGGTTCGCAAATCTCTTGACTCTAAAAATTGTTT
TTTTCAGTAATTTGTGTAAAACCCTAGTTTTAAAATATGGTCACCAAGTTTTATTACAGC
TTAATATATTATATTGGGTGTTGTCAAAACAGAATGAATTAAACTTTATGTTAATCTAAA
TCAACGCCCTAATTTTAGTTTGAATATAAAGGCAAAGCTTAAATTTCCCTTCAAACAATA
TTTTTACATAGTTATTTGTTGTAAGTGAAACTAAATTTATAGCATTATCAGGAACAAACA
ATGGCACCTAACACTTCCTTGTATATATTATGAGTTTAGCATGATGTAACACTGTATTGT
TAACTTTGTAAAATAACCCAAGTTCCTTTTGCTTTCCCGTCAGGAATGCTGGTGAAAGCC
GCAACTTACAAGCTCAAGCTGGTCCTCACTATATCAACATTGTAGCACAGCCTCACGAAT
ATGATGCAATTGACTAATTACTAAACCACCTGAACAAAAAAAAATACAGTTAACAATACA
TACCAAGGCTATGGATAGTAATGCTGGTGTTAATAAACCTAACAATTTGTGTTGCTAAAG
AAAAAAAAAATGTTGTTTGTAAATTGTAATGAAGACTAACCATGCCATATTTCTTATATT
ATACAACTTCTTGGACTTGATTTTTGTCATATCTCTTATATTATACAACTTCTTGGACTT
GATTTTTGCCATATCTCTTATATTATACAACTTCTTGGATTTGATTTTTGTATGCATTTT
GTAGCACCAGATCCTAAATTGTAATGAATGAGACTTAATATTTAAACATCATATTTGTAC
ATAGGTATTTGTTGTAAGTGAAACTAAATTTGTAGCATTATCAGGAACAAACAATGGCGC
TAATACTTCTTGTATATATTATGAGTTTAGCATGATGTAACACTGTATTGTTAACTTAAA
ATAACTTGTTTTACAATTACTTCATGTGTTCTTTTCCTCCAATTACAACATTACTCTTGC
ATTGATTAAATAACTGCTTGTTAGTTATAATCGTCGCCCCTTTTATCAAATATTTTTAAT
AAAGTATTATATTCATTGTATCATAACGTCTGATGTTTTACTGTTACTTCTTGTCTTTGT
ATATTATTTGCACCTTTGTTACTTTAACCAGTAGATAAAATGAGTCGAATTT

InterProScan

Gene3D
C-type_lectin-like/link_sf (IPR016186) - T[7-145] 1.1E-12
SMART
C-type_lectin-like (IPR001304) - T[13-143] 9.1E-7
SUPERFAMILY
CTDL_fold (IPR016187) - T[24-155] 9.62E-17
ProSiteProfiles
C-type_lectin-like (IPR001304) - T[25-143] 11.648
Pfam
C-type_lectin-like (IPR001304) - T[31-143] 1.0E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value