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  1. Transcript 'KH2012:KH.C11.596.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C11.596.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

SLC13A2; SLC13A3; SLC13A5

Location

KhC11 [876,675 / 884,007]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 638

>KH.C11.596.v1.A.ND1-1
SKYSTVMAVPMVLRQIWAFRNTLYIIIPPILLLPIPIIINSTEASCGYAILLMAIYWITE
AIPLAATAFLPLIIFPLSGVMTASAVSAAYFTDTAWLFVGGLIIAVSVEVTGLHKRIALR
VLLFVGAKPRCLMFGFMMTTYFLSMWISNTATTAMMLPIVEAVFRELKAGEEKRANEILD
KLKTQRSHDTNAEVDSGKASTSFCNRSFEDNDQNENKNEKESQIADFNDVIFIPDDIETE
EQRNKRMDNLIKGITLCVPYAASIGGTATVTGTGPNLVLSGQFATLFPDATMKLSFGSWI
AYALPGSVCMLILAYIWLSLYFLGFNLREIVGCFRGSDVTEGERNARNVIVTEYKKLGDI
TWKEVTVLSLFTTTALLWFFRDPGFMPGWSILFEEDYVDDGTVAMTMAFLLFVLPSERPS
FLRKSSGLDEDDKSEDSVSTMESDELLRPVAPILDWKTVHHKFPWAVMLLITGGFAMAKG
ATESGFSEWLGDQLIFLGGIETWAICLIVTIVVCLFTECSSNVATASIFVPILAQLAQSL
EVHPLYLMLPPVLAASLAFMLPVATPPNALAFSYGHLKVMDLIKAGWMLNVLGVLVISVF
INTYGVSYFGLNEFPAWAALPKTSGTTAAPTFNMTSTV

Nucleotide sequence

Length: 2,381

>KH2012:KH.C11.596.v1.A.ND1-1
AATACTACTTTACATCTCTTTAAAGCTATAGGAAGATTTACGTTAATCGAAATATTCCAC
TGTAATGGCCGTGCCGATGGTTTTGCGGCAGATATGGGCATTTCGGAACACCCTCTATAT
TATTATACCACCAATATTGTTGTTGCCAATCCCTATCATCATCAACAGCACCGAAGCGTC
ATGTGGATATGCAATTCTATTAATGGCAATTTATTGGATCACTGAAGCTATACCGTTGGC
TGCGACGGCTTTCTTGCCGTTAATTATTTTCCCATTGAGTGGGGTAATGACAGCATCTGC
AGTAAGCGCTGCATATTTCACTGATACAGCTTGGTTGTTCGTGGGTGGGCTTATTATTGC
TGTGTCTGTGGAAGTCACTGGCTTGCATAAACGAATTGCTCTCAGGGTTCTGCTGTTTGT
GGGAGCAAAACCAAGATGTTTAATGTTCGGGTTTATGATGACGACATACTTCTTGTCGAT
GTGGATAAGCAACACAGCCACAACAGCTATGATGCTTCCCATTGTTGAAGCTGTGTTCCG
TGAACTGAAGGCGGGTGAGGAAAAGAGAGCAAATGAGATCTTGGATAAGTTGAAAACACA
AAGGAGTCACGACACCAACGCTGAGGTTGATAGTGGCAAAGCATCGACGTCATTTTGTAA
CAGAAGTTTCGAAGACAACGATCAGAATGAGAATAAAAATGAAAAAGAAAGTCAAATCGC
CGACTTTAATGACGTAATATTTATACCGGATGATATTGAGACGGAAGAACAAAGAAACAA
ACGAATGGACAATCTTATAAAGGGGATCACACTTTGCGTGCCATATGCTGCTAGCATTGG
TGGAACAGCTACTGTAACAGGGACAGGCCCAAACCTTGTATTGTCCGGACAGTTTGCCAC
GTTGTTTCCTGACGCAACGATGAAGTTGTCGTTTGGAAGTTGGATCGCATACGCACTGCC
AGGCTCTGTATGTATGTTGATACTTGCGTACATTTGGCTCAGTCTGTATTTTCTCGGATT
CAACCTTCGCGAAATTGTCGGTTGTTTTCGAGGTTCTGACGTCACAGAGGGCGAACGAAA
CGCAAGAAACGTGATTGTTACGGAATACAAGAAACTTGGAGATATAACGTGGAAAGAAGT
GACTGTATTATCTCTCTTCACCACTACCGCCCTCTTATGGTTCTTCCGTGATCCTGGTTT
CATGCCAGGTTGGTCAATTCTGTTTGAGGAGGATTATGTTGATGACGGCACTGTTGCCAT
GACGATGGCCTTTCTTTTGTTTGTTCTTCCCTCCGAGAGACCTTCGTTTTTACGTAAATC
GAGCGGTTTAGACGAAGACGACAAGTCAGAGGACTCAGTATCCACGATGGAATCAGACGA
ACTCCTTCGACCAGTTGCCCCAATACTGGATTGGAAGACAGTTCACCACAAGTTTCCATG
GGCAGTAATGCTTCTTATAACTGGAGGCTTTGCTATGGCGAAAGGGGCAACGGAATCTGG
TTTCTCCGAATGGCTGGGAGATCAACTGATATTTCTTGGTGGAATCGAAACTTGGGCGAT
CTGTCTCATTGTTACAATTGTCGTATGCTTGTTCACCGAATGCTCAAGCAATGTGGCGAC
CGCTTCAATATTCGTACCAATACTGGCACAATTGGCTCAATCACTTGAAGTTCATCCCTT
GTATCTCATGTTGCCTCCAGTATTGGCCGCCTCCCTAGCTTTCATGCTACCAGTTGCAAC
TCCACCAAACGCACTGGCGTTTTCATATGGTCACCTTAAAGTCATGGACTTGATTAAAGC
TGGTTGGATGCTGAACGTTCTTGGAGTTTTAGTGATCTCAGTGTTTATCAACACATACGG
TGTCTCATACTTCGGATTAAATGAGTTCCCAGCATGGGCAGCACTGCCTAAAACATCAGG
AACAACTGCAGCTCCAACTTTCAATATGACAAGCACCGTCTAACACTGTTAAACTTTAAC
GTAATTACTTTGCATTTCATATCTTCTCCTGTTTAGCTGTTTTAGAAGGATGGAACATCT
TTAGCACATAATGTCCAAATATCCTGATTATGTTTTAAACAATTAACAACCGTCTATGGG
GGTCGTAATGATGTGGTTTTATAGTTTTTTCAATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGGAAC
GAGAAAATAGAAAGATGTCTAATCTTCCGCTACCCTACAATATATTCTCTTCAACCAAAT
ATGCCTACATTCTATTAAATATAGGTCATTCGTAAGGACTGCTGCGGGAACTAACAAATA
TCAAAGACTACACGCGTTTCCGTCTATATTTATAACGTTAGCGTCATGGGCTGATAAATT
ATGGTCCGCGAAGCCTATTTATATAAATCGATAATTCATTA

InterProScan

Pfam
SLC13A/DASS (IPR001898) - T[17-607] 4.0E-106

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S13A2_HUMAN 44.795 % 471 1.08E-159
S13A3_HUMAN 39.257 % 452 2.46E-152
S13A5_HUMAN 45.848 % 468 3.86E-159