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  1. Transcript 'Harore.CG.MTP2014.S1...'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C11.30.v1....'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C11.30.v1.A.ND2-1

Possible name(s)

MTOR; SMG1

Location

KhC11 [281,753 / 297,133]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,218

>KH.C11.30.v1.A.ND2-1
EGGYAGAVYGGGGQQAPTKLDEDKLTKKDMEREITRSLFSSRVAEMKQGWFTNRDEMLKV
LPDLVEKLTDYKTHFKSNVDMNENIQNLLEVKSLVKCALSDTRHPFNTLPTRWHQQVQQQ
AKREATLTTLQDKILVCEENMKRFMKLNALLQSPELAALITEAATKLDLGPCAFEHATKF
LHSAGQATMVSQAQMTEKELVTVGDQHRHAMRSCLDALSQYAAVAAHFPPVAAIRNHRVA
VWSDRLEKMVNGLLDLNCSSIRSEIERCSSKEAILAQTRAAAVKDVSLQREATDLNGGLV
KLMDRRSRETVISGRMQEAERMVQTSQEHILKFVQDHGLEGLGSFTGVLTMLLCALDQRA
ITMETTAANSGHRLVDMTSQEGDWFLEELCGLFSNMVQLLRLADGLLNPSSTSDTPPSVT
REATRAVICADNIYRTLLELFKNFRNIIVPEAVKLLQCEEPSVVELVAAVSGIVHGVRID
DLTKQLMASLRNQGTQNGTSSAYEDALAEVQRLQPQYTQLLQDSRQKRSDEQRLTAGQML
LQAFDGLFRSARNDFNALLIARDGLLASGFVTKEWTFVDCLNEPMQLQKLKKLSATNEAL
QALLFAKQLQAMNDFFVLCHSNARAFVVDRSAPSGKNTTGGHHYMGSKNLYTEERLAKPV
KHFVSYFVQELLIGIPGEMLGCALCGYVELLGVELGTFMMSVSNNQVVKVEEICKAAVET
KYSQSLLAKPLMLVYQFNRTWKDLDRARRLDSNIVSVRASLHRAKLQVTRFQWLYEDLLE
AGGGSTLALPRRRDVINDLSKRMSALRHLVAVLEQVQDKASSQNTSIQQRLKWAAGANPS
LQTVLSSVEADGDNRMKLVKNEKILSMKILDVCENAVSFEQSRLLLSENNKDHDVEFLKL
LEACEGVCRAVGKSPVQLDAMEQTATDVLPPKHNSSPKDWLQKVSDKIQQSVTKCRQQRS
QVEGKMLLVKSSLRDLVTSVKQLLSSHGRLLSDVKTLLKTMAKEEDNEEDSGGVRRYMTR
YKELTSSLSDALMDVLHGCDASTIDPDPLILRITEIAGMVASVYEDLVSFANPYMENPPE
RIQPTFATALRTGTGLPTLGVRGSPGAKKAVILSTGGATGSQSVGTPSTPPMVGTDTGAS
TKTTSPKKKTRDPRTGKAIQERNFFAMSVWRRVKAKLDGRDIDGNKRMQVAEQVDHVISE
ATSLDNLALLYEGWTAWV

Nucleotide sequence

Length: 4,471

>KH2012:KH.C11.30.v1.A.ND2-1
GAAGGAGGGTATGCAGGGGCTGTATATGGGGGTGGGGGGCAACAAGCACCCACTAAACTA
GATGAGGATAAGCTAACAAAGAAAGACATGGAACGCGAGATCACGAGGAGTTTGTTTTCG
TCAAGAGTGGCGGAGATGAAACAGGGCTGGTTCACAAATCGCGACGAAATGTTAAAAGTT
CTTCCAGATCTTGTTGAAAAACTCACCGATTACAAAACTCATTTTAAAAGCAATGTTGAT
ATGAATGAGAATATACAGAATCTGCTTGAAGTGAAATCCCTGGTAAAATGCGCGTTGTCG
GACACTCGACATCCATTTAACACTCTTCCCACTAGATGGCACCAACAAGTTCAACAACAA
GCCAAGCGTGAAGCTACTTTGACCACACTGCAGGACAAGATCCTTGTATGTGAGGAAAAC
ATGAAGAGGTTCATGAAGTTAAACGCTCTTCTACAAAGTCCTGAGTTAGCAGCGTTAATC
ACTGAGGCTGCAACTAAGTTAGATCTTGGTCCTTGTGCGTTTGAACATGCAACCAAGTTC
CTACATAGCGCAGGACAAGCTACCATGGTTTCACAAGCACAGATGACAGAGAAAGAGTTG
GTGACGGTCGGTGACCAACATCGACACGCCATGCGATCGTGTCTCGATGCGCTCAGCCAA
TACGCCGCTGTTGCTGCTCATTTCCCTCCAGTGGCAGCTATACGCAACCACCGTGTGGCA
GTATGGAGCGATAGATTGGAGAAAATGGTTAACGGGTTGTTGGACTTGAATTGTTCGTCG
ATAAGAAGTGAAATCGAACGTTGCAGCTCAAAGGAAGCAATTCTTGCTCAGACTCGAGCA
GCCGCTGTTAAAGACGTTTCCCTTCAACGTGAAGCAACCGATCTTAACGGGGGGTTGGTT
AAGTTGATGGATAGGAGAAGTAGGGAGACGGTTATATCAGGGAGGATGCAGGAAGCGGAG
AGGATGGTGCAAACGTCGCAGGAACATATCCTTAAGTTTGTTCAAGACCATGGATTGGAA
GGACTTGGTTCGTTCACGGGCGTCCTCACCATGCTGTTATGTGCGTTGGATCAACGTGCT
ATCACCATGGAAACCACTGCTGCTAATTCTGGTCACCGATTGGTTGATATGACGTCCCAG
GAAGGTGATTGGTTCCTGGAGGAGTTGTGCGGACTTTTCTCAAACATGGTTCAGCTTCTG
CGATTGGCCGATGGATTGCTCAACCCTTCGTCGACCTCTGATACGCCACCTAGTGTTACA
AGGGAGGCAACGAGAGCCGTGATATGTGCAGATAATATTTACCGAACGTTACTTGAATTG
TTTAAAAACTTCCGCAACATAATCGTACCTGAAGCCGTGAAGTTGTTGCAATGTGAGGAA
CCATCTGTAGTGGAACTCGTTGCTGCTGTTAGTGGAATCGTGCACGGTGTAAGGATAGAT
GATCTGACTAAGCAGTTAATGGCAAGCTTACGCAACCAAGGAACACAGAATGGAACGAGT
TCAGCGTACGAGGATGCGTTGGCTGAAGTACAACGACTACAACCACAATATACGCAGCTG
CTGCAGGATTCTAGACAGAAACGATCAGACGAACAACGCCTCACAGCAGGCCAGATGTTG
CTACAAGCATTTGACGGATTATTCAGATCGGCACGGAACGATTTCAACGCGTTGCTCATC
GCACGAGATGGTTTGTTGGCATCTGGGTTCGTCACCAAGGAATGGACGTTTGTGGATTGT
TTGAATGAACCAATGCAACTGCAGAAGCTGAAGAAGCTGTCAGCCACCAACGAAGCACTC
CAAGCTTTATTATTCGCGAAACAACTACAAGCGATGAACGATTTCTTCGTTCTTTGTCAT
TCCAACGCTCGTGCGTTCGTGGTGGATAGATCAGCACCTAGTGGCAAGAATACAACTGGA
GGCCACCATTACATGGGGAGTAAGAACTTGTACACTGAAGAAAGGTTGGCGAAACCTGTG
AAACATTTTGTGTCGTATTTTGTGCAAGAGTTGTTGATTGGAATTCCTGGAGAGATGTTA
GGATGTGCGTTATGTGGATACGTTGAACTACTCGGTGTTGAGCTCGGTACCTTCATGATG
TCAGTGTCCAACAACCAAGTTGTTAAAGTCGAGGAAATTTGCAAAGCTGCGGTCGAAACT
AAATATTCGCAGAGTTTACTCGCGAAACCTCTGATGTTGGTTTACCAATTCAATCGAACG
TGGAAAGATTTAGATCGTGCTCGAAGACTCGATTCAAACATCGTGTCCGTTCGTGCAAGT
TTACATCGGGCTAAACTACAGGTGACGAGGTTCCAGTGGTTATACGAAGATCTTCTTGAA
GCAGGTGGGGGAAGTACCTTGGCGTTACCACGACGACGTGATGTCATCAACGACCTCAGT
AAACGGATGTCCGCGCTTCGTCACTTGGTGGCAGTGTTGGAGCAAGTTCAGGATAAGGCT
TCGTCACAAAACACGTCGATACAACAGCGCCTCAAGTGGGCAGCAGGTGCGAACCCGAGT
TTACAAACGGTGTTGAGCTCGGTGGAGGCCGACGGTGACAACCGGATGAAACTTGTTAAG
AATGAAAAGATTTTGAGTATGAAGATATTGGATGTTTGTGAAAATGCCGTCAGTTTCGAA
CAAAGTCGATTGTTACTCAGCGAAAACAACAAGGATCATGACGTGGAGTTTTTGAAACTG
TTGGAGGCGTGTGAGGGGGTGTGTCGTGCTGTGGGGAAGTCCCCTGTACAACTGGATGCC
ATGGAACAAACAGCAACTGATGTTTTGCCCCCGAAACACAACTCGTCACCCAAGGATTGG
CTGCAAAAAGTTTCCGATAAGATCCAACAGAGCGTGACCAAATGTCGACAACAGCGCAGC
CAAGTGGAGGGAAAGATGCTTCTCGTTAAATCGAGTCTTCGTGACCTTGTGACCTCCGTT
AAACAATTGTTATCGAGTCACGGTCGATTGCTTTCCGATGTTAAGACACTGCTTAAGACA
ATGGCGAAGGAGGAAGACAATGAAGAGGACAGCGGAGGAGTCCGTCGATACATGACGCGA
TACAAGGAGTTAACATCCTCGTTAAGCGACGCGCTGATGGACGTACTTCATGGATGCGAT
GCATCAACCATCGACCCTGATCCTTTAATTCTACGCATCACTGAGATAGCTGGCATGGTG
GCAAGTGTTTACGAAGATCTTGTATCGTTCGCGAACCCATACATGGAAAACCCACCGGAG
CGTATCCAACCCACTTTTGCTACTGCTTTACGAACTGGAACGGGGTTACCCACCCTGGGT
GTGAGGGGAAGTCCCGGGGCCAAGAAAGCTGTCATTTTATCGACAGGTGGGGCAACGGGG
TCTCAGTCAGTTGGAACCCCCAGCACCCCACCCATGGTTGGCACGGATACGGGGGCTTCC
ACTAAAACTACAAGTCCGAAGAAAAAAACTCGAGACCCGAGGACCGGGAAAGCGATCCAG
GAACGAAACTTTTTTGCGATGAGCGTTTGGCGTCGAGTGAAAGCGAAGTTGGATGGGAGA
GATATCGACGGGAATAAACGAATGCAAGTTGCTGAGCAGGTTGATCATGTGATAAGTGAG
GCGACGTCATTGGATAACTTGGCGCTTCTGTACGAGGGGTGGACGGCATGGGTGTAAGGC
CCCACTTTGTATAAGCCCCTTGAGGCTTTGTTAATTCATTCACCAGCAATTCTATGAGTT
GCCACTTTTTGAGGCCGTCTATAAAGAAAGAGAATAAGAAGAGGAATGAGTAGGAGCGCT
TTGAGAAAAGTGAGAGATCTTTTTCAGCTCTTGTCCAGAAATCGCAGAAAATTTTCAAGA
AAGTTATGCGTTGTTGTTAAATTGGCCGGCATTGAAACAAAATTAGATCCCACCATTTGA
AGTTTCTCTAAATTATTTAAATTGTTTCAAAGTCATGTTTTTAAATTGCCCAGTTAGAAT
TTTTGCCGCGTTTTTTTTTCGAATTGGTGTTGAGGTTATGTGGTGAAACATAGATATCTT
AAATGCAGCTTTAAATAGAAATAACATAATTATAATTCTGACGTTTTTCCGCTATGTTAA
AAATGTTTGAACTACGGTGTTCCCTATAACGTTGAGAGGGGAAATGTAAATAGAGTTTCG
TTGCTGTTGTGTTGCGGTTTTATTTCATTTAACAATCAATATGTTACTCTTAGTTGTTAA
GTCTTATATAAACATATTGATTTTATTAAAGGAAAACTGCATGCTTGCATGTTCAAGGTT
TAAGTTAAGCATATAGTAGTAATGTGTTGGGTTTTTATTTGTTTAAAACAATCAATTAAT
GACTATCCGTGTTATTATTTCGTATATAACCAAGCTTATGTATGTATGGGTTTACACCAC
AAAACTTAAGTTACAATAGCCAAGACAATTGTTAAATGTGAAATGTAAATATCATTGTGT
GAAACATGTAATAAACTGTAGTGGAATTGGA

InterProScan

ProSiteProfiles
FATC_dom (IPR003152) - T[1186-1218] 14.014
SMART
FATC_dom (IPR003152) - T[1186-1218] 7.8E-12
Pfam
FATC_dom (IPR003152) - T[1188-1217] 3.2E-10

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SMG1_HUMAN 33.466 % 641 0