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  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.13.v2.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.13.v2.A.SL1-1

Possible name(s)

SLC19A1; SLC19A2; SLC19A3

Location

KhC1 [5,783,670 / 5,787,858]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 289

>KH.C1.13.v2.A.SL1-1
GRDMSGSIESTHLNEENPAEEASEVNADGITIEERGTSFSAPKPNPKNKSKIDWKGVLVR
LWADVKGCYMNTVLLRWSLWWALSTCGWLLVVNYAQNLWETIHSSAEGEVYNGAVEATAT
VLGALGAFCVGFIKLNWTRWGEIALGLCSLCKCGLLLLMYWTTDIWLCYAAYVGFIVLYN
FVITITQFQLAVGLNTQRFALVFGVNTFTAVLLNTVLTVILIDKAGFGLDVNTQFIIYSG
YFAIIAVIFLLHGVYFLCKNGFSGGSSFSVSAPEEEDPKTIKISEQTPL

Nucleotide sequence

Length: 2,291

>KH2012:KH.C1.13.v2.A.SL1-1
AACTAACAGTTAAAATGGAATCGGCCGCTAGCGATAGGTCTTGGCTAAAACCAACTGTAT
TACTTTGCGTTTATGGTATATTTAGCTACATGAAGCCATCAGAGCCCTTTCTTACCCCGT
ATTTAATGGGCCCCAGCAAGAATTTCACTGAATTTGAAGTGGTTAATGAAATCTATCCAG
TATGGACTTATGCCTATGTTTGTTTTCTCCTACCCGTGTTCCTGCTCACCGATTATGTAA
AGTACAAACCTGTGATCTTAATGCAAGGACTTGGATATATTGGATGTTGGATTTTGTTGT
TATTTGCCCAAGGAGTTCCTTTAATGCAAGTGATGCAAGTCAGTTATGCTATTGCAACTG
CCGGAGAAATTGGATACTATTCCTACATCTACAGCATTGTAAAGCAAGAGCACTACCAAC
GTGTGACATCATATGTGCGTTCTACCACACTCATTGGACTTTTCCTTGGTTCCCTCATTG
GTCAACTTTTGGTTCTCTTCGCCGATGTTACATATTTTGACTTAAACATATTTTCTCTTG
TGAATGTATCTATTGCATTCGTAATATCTTGGTTTTTACCAATGCCAAAAAAAACGCTCT
TCTTTTTTACTGAGGAAGAGATATGAGTGGTTCGATTGAGAGCACGCATCTAAATGAAGA
GAATCCTGCTGAAGAAGCAAGTGAGGTCAATGCAGATGGGATCACCATTGAAGAAAGAGG
GACTTCTTTTTCAGCTCCAAAACCAAATCCCAAAAACAAATCTAAAATAGATTGGAAAGG
AGTTTTGGTGAGGTTGTGGGCAGATGTAAAAGGTTGTTACATGAACACTGTGTTATTGCG
TTGGTCGTTGTGGTGGGCCTTGTCTACATGTGGTTGGCTGCTTGTGGTAAATTATGCTCA
GAATCTGTGGGAAACAATTCACTCAAGTGCAGAAGGGGAGGTGTATAATGGTGCAGTTGA
AGCAACTGCTACAGTGCTAGGTGCACTGGGAGCATTTTGTGTTGGATTTATCAAGTTAAA
CTGGACAAGATGGGGAGAGATTGCCCTTGGACTTTGCTCTCTATGCAAGTGTGGCTTACT
TTTGCTGATGTATTGGACAACAGATATCTGGCTATGTTATGCTGCATATGTTGGATTTAT
TGTGCTGTACAACTTTGTCATCACTATTACCCAGTTTCAACTTGCTGTTGGTCTCAATAC
TCAACGTTTTGCTTTGGTCTTTGGTGTGAACACATTCACTGCTGTCCTTCTCAATACAGT
ACTTACTGTCATTCTAATTGACAAGGCTGGATTCGGTCTGGATGTCAACACTCAATTTAT
TATATACAGTGGCTACTTCGCAATCATCGCTGTAATATTCCTTCTTCATGGAGTCTATTT
TCTCTGCAAGAACGGTTTCAGCGGCGGTAGCAGTTTCTCTGTTTCTGCTCCAGAAGAAGA
GGACCCCAAAACAATAAAGATATCGGAGCAAACTCCCCTGTAGGTTTGATAGAAAATAAA
ATGCGTAAAACAATGACACCCGTTTGCAAAGCATGGGGTAACTATACTATTTTGATTATT
ATTTTTCTAAGTTTGTTTTTATCAGCTTTGATTACGATGTTTAACATTTTTCATTGTTCC
ATTTCGAATTGTAATTTTTCATACATGTGCTACCTTTTTTAACTTTTAATATGAATTGCA
ATTTCTTTACTTCAATTTTTTTGTCAGTTAGTTCAATGCAAATTACTGTGGTAGAAAATT
ATAAGTGGTAGCTGGTAGGGTAAGTGGCCATCGAGATTATAGCTTTATTTAAATATTGAG
CATATAAACCTTGCAAGGCTGCAATAAAACGTTATTTAACAGTAAATATTAGTTTCGGGA
AGTCACCCATTATTATACTGTGCAAGGTGTTGCAATTCTTCGAAACTGTTTTCTTGTCAC
GCATGTGTTTTACACATAGCTTAGTTTAATTCGTGCTCACTTTTAGCCCAGTCGGATGCC
TTAAAATTTTTATTGCTCTGCACTTAATTTTTTCCTCGATGTCCCAAAAGTATGGTAGTG
TTTTTTGAAAAACAGAATTCATTTGTTATAATTGGCTTGTTAACTTTATACCATTACCTT
CACTAGAATACACTTCCCTGCAAAGCCGAAATATAACCCTGCCTATAAATGACTCTTACT
ATCAGTGTTAAAAACGACGCATGTGAGGGTTGTGTGATTTTCTTTTATTTCACATGACAC
TTGAATAGTTTACCGCCAAAGAAACGCGTTCAAAATCCGTCAGATTTGCGATAATAAAAC
GTACAGCATGA

InterProScan

PANTHER
Folate_carrier (IPR002666) - T[4-26] 3.4E-127 - T[45-287] 3.4E-127
Pfam
Folate_carrier (IPR002666) - T[31-237] 8.3E-73
SUPERFAMILY
MFS_trans_sf (IPR036259) - T[57-251] 2.35E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S19A2_HUMAN 47.768 % 199 1.4E-60
S19A3_HUMAN 41.429 % 207 1.88E-63
S19A1_HUMAN 40.201 % 157 4.25E-44