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  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.13.v1.A...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.13.v1.A.SL1-2

Possible name(s)

SLC19A1; SLC19A2; SLC19A3

Gene model

KH2012:KH.C1.13

Location

KhC1 [5,782,990 / 5,787,858]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 306

>KH.C1.13.v1.A.SL1-2
GRDMSGSIESTHLNEENPAEEASEVNADGITIEERGTSFSAPKPNPKNKSKIDWKGVLVR
LWADVKGCYMNTVLLRWSLWWALSTCGWLLVVNYAQNLWETIHSSAEGEVYNGAVEATAT
VLGALGAFCVGFIKLNWTRWGEIALGLCSLCKCGLLLLMYWTTDIWLCYAAYVGFIVLYN
FVITITQFQLAVGLNTQRFALVFGVNTFTAVLLNTVLTVILIDKAGFGLDVNTQFIIYSG
YFAIIAVIFLLHGVYFLCKNGFSGGSSFSVSAPEEEDPKTIKISEQTPLLGQHSGHRTSI
HTEIVG

Nucleotide sequence

Length: 2,103

>KH2012:KH.C1.13.v1.A.SL1-2
AACTAACAGTTAAAATGGAATCGGCCGCTAGCGATAGGTCTTGGCTAAAACCAACTGTAT
TACTTTGCGTTTATGGTATATTTAGCTACATGAAGCCATCAGAGCCCTTTCTTACCCCGT
ATTTAATGGGCCCCAGCAAGAATTTCACTGAATTTGAAGTGGTTAATGAAATCTATCCAG
TATGGACTTATGCCTATGTTTGTTTTCTCCTACCCGTGTTCCTGCTCACCGATTATGTAA
AGTACAAACCTGTGATCTTAATGCAAGGACTTGGATATATTGGATGTTGGATTTTGTTGT
TATTTGCCCAAGGAGTTCCTTTAATGCAAGTGATGCAAGTCAGTTATGCTATTGCAACTG
CCGGAGAAATTGGATACTATTCCTACATCTACAGCATTGTAAAGCAAGAGCACTACCAAC
GTGTGACATCATATGTGCGTTCTACCACACTCATTGGACTTTTCCTTGGTTCCCTCATTG
GTCAACTTTTGGTTCTCTTCGCCGATGTTACATATTTTGACTTAAACATATTTTCTCTTG
TGAATGTATCTATTGCATTCGTAATATCTTGGTTTTTACCAATGCCAAAAAAAACGCTCT
TCTTTTTTACTGAGGAAGAGATATGAGTGGTTCGATTGAGAGCACGCATCTAAATGAAGA
GAATCCTGCTGAAGAAGCAAGTGAGGTCAATGCAGATGGGATCACCATTGAAGAAAGAGG
GACTTCTTTTTCAGCTCCAAAACCAAATCCCAAAAACAAATCTAAAATAGATTGGAAAGG
AGTTTTGGTGAGGTTGTGGGCAGATGTAAAAGGTTGTTACATGAACACTGTGTTATTGCG
TTGGTCGTTGTGGTGGGCCTTGTCTACATGTGGTTGGCTGCTTGTGGTAAATTATGCTCA
GAATCTGTGGGAAACAATTCACTCAAGTGCAGAAGGGGAGGTGTATAATGGTGCAGTTGA
AGCAACTGCTACAGTGCTAGGTGCACTGGGAGCATTTTGTGTTGGATTTATCAAGTTAAA
CTGGACAAGATGGGGAGAGATTGCCCTTGGACTTTGCTCTCTATGCAAGTGTGGCTTACT
TTTGCTGATGTATTGGACAACAGATATCTGGCTATGTTATGCTGCATATGTTGGATTTAT
TGTGCTGTACAACTTTGTCATCACTATTACCCAGTTTCAACTTGCTGTTGGTCTCAATAC
TCAACGTTTTGCTTTGGTCTTTGGTGTGAACACATTCACTGCTGTCCTTCTCAATACAGT
ACTTACTGTCATTCTAATTGACAAGGCTGGATTCGGTCTGGATGTCAACACTCAATTTAT
TATATACAGTGGCTACTTCGCAATCATCGCTGTAATATTCCTTCTTCATGGAGTCTATTT
TCTCTGCAAGAACGGTTTCAGCGGCGGTAGCAGTTTCTCTGTTTCTGCTCCAGAAGAAGA
GGACCCCAAAACAATAAAGATATCGGAGCAAACTCCCCTGTTAGGGCAGCACAGCGGGCA
TAGAACGAGCATTCACACCGAAATAGTTGGTTGAGGTGGCCAAGTCGACTACCCTATCGT
TGATGTACACCTTGCGCATGTTTCCGTTGAACGGGGCTAACGTCCCCCCTGGAAATATGC
AAGATTTATGGTAAAGATAAAGCTTTGGTGAAGATGCAAAATATCTGGGAATCTGTATGT
TGTCAGTGACAAGTTCTGAGTATGGCGTTTATATATAATTCTCTTGCCTGGCTCGCCACC
AATATACAGCGGTGCTGCTGAATCGAAACGAAACCTTCCGCCTCTCATTTCTTCACTTCC
CGGCCTTCCATCAACATACAGTGAAATCTGAGAAAATGAGTTGTTTTATCTATTGGTCGG
CACACCTTTGTTCGCTTAATGCCTTACATACCTTTCCGCGGGTGGAAATTTTACAGTAAA
TGCTCATCCACAAACCGGTGCACATCAATTGCCCCTCCTTTCTATATATAGATGAATGTG
TGCGGATGCCGGAGATGTCCGTAACCTCTGCCCGAATCTATCAAAAAATAACCTTTCTTT
ATCATCGCACTTATATCTACATTGTCATGTCCTTACAGTTCCGTCACTAAGAGATAAAAC
TAA

InterProScan

PANTHER
Folate_carrier (IPR002666) - T[4-26] 4.4E-127 - T[45-287] 4.4E-127
Pfam
Folate_carrier (IPR002666) - T[31-237] 1.0E-72
SUPERFAMILY
MFS_trans_sf (IPR036259) - T[57-251] 2.88E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S19A2_HUMAN 47.768 % 200 1.52E-60
S19A3_HUMAN 40.989 % 207 3.85E-63
S19A1_HUMAN 40.201 % 157 5.87E-44