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  1. Transcript 'KH2012:KH.C1.1010.v1...'

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.1010.v1.A.ND1-1

Possible name(s)

ITLN1; ITLN2; MFAP4

Location

KhC1 [3,773,798 / 3,778,475]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 634

>KH.C1.1010.v1.A.ND1-1
KMDNDYRARNENVRAIAFNSILAACDQNEEIYSNEPRQENAGARQNNVQPAQNKRHSQKF
WKIFASIIFVVIITVSAVVIHYTLANKAAVDCTSTSSQNSGDKVTTTTTTTNTPTNTGTY
GTLTNPALSCLDIKNTSGVTNDGYYFLQPSGTVVPFQAFCDMTTSGGGWTLVASVHENDI
IGKCTTGDMWFSNDLPRYSLFSRNWENTNLFGKADKATSADYKNIGYSSIKAANLMLRHV
PNKTPVDQSKSLASLQYHTSNNFLDEHGGNLFTTYTRHYPMNPKSTVVTFPSNVDKLVDD
IAALSTSLTSGIPDFYKYAYGSTTDRLQDGGNGTYTSYGMQIYFGFYCGYYIQYGSEYKC
SPVQSLVVSRKSHPFIVVIAIENYNLRSSSGNYRIQAYRPSTDSITSYNGKMTEGNFELQ
YRARCVYGRNVPSVCDVVFTVKNTKDWSSSTTFTLSESTNRYTNYYYYYVYINSNPRRIM
VGYTMLSRTGGRLVTKVQMESTLQKMLQPFKNYTWQAPCASNHLAVPVTYTIGKSTLSNF
VPPSMHSATTTGFLQIRAESYDGTYYAMCPAVKLNNCDGQYVCIGGVKNGYTQSNDCNDY
TDWNGLTNNPDYHTSKTYAHSTTDIESTIMIFYR

Nucleotide sequence

Length: 2,591

>KH2012:KH.C1.1010.v1.A.ND1-1
TATAATATATTGATTAGTCATTTAGGTAAAGAGTTGCACCATATATTGAAATCTTCTTCC
TACACATTCATTTGCATTAAATAACTGTGAGTTCACATGTTAATCAGGAAACATGTGATG
GCACGTCAATTCTGGCTCAATATCTATTGCTATTTTTAACCCACCCCCACAATAAGCATG
GTTTATAAAAAGGCTCACTTTCAAGACAGATACTCACTTTGAACTGCAAACTGTTGATCT
TGAAAAATGGACAACGATTATCGAGCTAGAAACGAAAATGTACGAGCAATAGCATTTAAT
AGCATTCTGGCAGCATGCGACCAAAATGAAGAAATTTATTCTAATGAGCCGAGACAAGAA
AATGCAGGAGCAAGGCAAAACAATGTACAACCTGCTCAAAACAAGCGGCATTCTCAAAAA
TTTTGGAAGATATTTGCATCCATTATATTTGTGGTGATTATAACAGTTAGTGCTGTTGTT
ATTCACTACACTCTTGCAAATAAAGCTGCAGTGGATTGTACAAGCACTTCATCACAGAAT
TCAGGGGATAAAGTTACAACCACAACAACTACCACCAATACTCCAACAAACACTGGTACC
TATGGAACATTAACCAACCCAGCTCTCTCATGCCTGGATATAAAGAACACATCAGGAGTG
ACCAATGATGGATATTACTTCCTACAACCAAGCGGCACTGTTGTACCATTTCAGGCATTT
TGTGACATGACAACATCTGGTGGTGGTTGGACATTAGTAGCATCCGTTCATGAGAATGAT
ATTATTGGAAAATGCACAACTGGAGATATGTGGTTCAGTAATGACCTACCACGATACTCA
CTATTTTCAAGGAACTGGGAGAACACAAACTTATTTGGAAAAGCAGACAAAGCCACTTCA
GCTGATTATAAGAATATTGGATATTCATCTATTAAGGCTGCTAACCTGATGTTACGTCAC
GTACCAAACAAAACACCGGTGGACCAATCGAAATCCTTAGCAAGCTTGCAATATCACACA
AGTAACAATTTCCTTGACGAACATGGGGGAAATCTATTCACAACCTACACAAGACATTAC
CCAATGAATCCCAAATCAACAGTTGTTACCTTTCCATCCAATGTTGACAAGTTGGTTGAT
GATATAGCAGCTCTCTCAACCAGCTTAACCTCTGGAATTCCAGACTTTTACAAATATGCA
TATGGCTCAACAACTGATCGTTTGCAAGATGGTGGAAATGGTACTTACACCTCCTATGGA
ATGCAGATTTATTTTGGTTTTTACTGTGGCTACTACATTCAGTATGGAAGTGAATACAAA
TGTTCACCTGTCCAATCCTTAGTTGTCAGCAGAAAATCTCATCCATTTATTGTTGTAATA
GCGATTGAAAATTACAATTTACGATCTTCATCTGGGAATTATCGGATTCAAGCCTATCGA
CCATCCACTGACTCCATCACATCATACAACGGTAAAATGACAGAAGGCAACTTTGAGCTT
CAATACAGAGCTAGATGTGTTTATGGAAGAAATGTACCAAGTGTGTGTGATGTTGTCTTT
ACAGTTAAAAATACAAAGGATTGGTCTTCATCTACCACCTTCACTTTGTCAGAATCTACC
AACCGTTACACTAATTATTACTATTATTATGTTTATATAAATAGTAATCCAAGAAGGATA
ATGGTTGGTTACACAATGTTATCAAGAACTGGTGGACGACTTGTGACCAAAGTTCAGATG
GAATCCACTCTTCAGAAAATGTTGCAACCTTTCAAAAACTACACCTGGCAAGCCCCATGT
GCATCCAATCATCTTGCAGTACCAGTGACATACACAATTGGTAAATCTACTTTGAGCAAC
TTTGTTCCTCCTTCCATGCACTCAGCAACAACCACTGGATTCTTACAGATTCGTGCTGAA
TCTTATGACGGAACTTACTATGCTATGTGTCCTGCTGTTAAATTAAATAATTGTGATGGA
CAATACGTTTGTATTGGGGGTGTGAAAAATGGATACACACAATCCAATGACTGCAATGAT
TATACCGACTGGAATGGGTTGACCAACAATCCAGATTATCATACCAGTAAGACCTATGCC
CATTCAACTACAGATATTGAATCCACCATCATGATTTTCTATCGTTAAGCTAGTTTTTAT
AAATCTGATACAAAGTTTCTGTATTTTATATTTGTCATAGAATAACTTTAAAATTGATCA
GTTTATCGTGTTAATAGTATGGACTAATATTATGTCAGTTGATTTCTTACAGTAATTGGA
ACTTTAATTGATTTTAATTTTATAATGAAATGGTGATCATATAAATATATTTATTATTTC
TCACAATTTATTATAGTCCTCTTGTAAAACTCCAAGGTTTTTTTAAAACATAATAATAAT
TTTGTATTCAATTATCTTAACACAAGTTGTTTGTTTATTAAGTGTAGTGACCACCTGTTT
AACCATTCAGTTATGTACATTTTATCAAAACATTGTTTTAAGAACTGTTCTGTTGTGATT
CTATTCTGTCAATTATTTTTGTGCATCATTTTTGATTTCCTCAACCATAATAAAACAAAC
AAATACAAGAT

InterProScan

Gene3D
Fibrinogen_a/b/g_C_1 (IPR014716) - T[86-223] 8.6E-11
SUPERFAMILY
Fibrinogen-like_C (IPR036056) - T[119-282] 2.99E-25
ProSiteProfiles
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[121-182] 13.925
Pfam
Fibrinogen_a/b/g_C_dom (IPR002181) - T[130-173] 1.6E-5

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
ITLN2_HUMAN 49.686 % 146 3.72E-39
ITLN1_HUMAN 48.148 % 144 2.42E-38