Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.101.v2.A.nonSL6-1

Possible name(s)

CDIPT

Gene model

KH2012:KH.C1.101

Location

KhC1 [1,298,601 / 1,301,235]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 223

>KH.C1.101.v2.A.nonSL6-1
VKLNSNLTNMATTVKDIMLFIPNLIGYVRIVLAIASAYYMPFDYVTASLCYVISVGLDAI
DGYAARVFNQGTKFGAMLDQLTDRASTATLVMTLSYFYPKYMFLFQMSLVIDIICHWLHL
HVSIMKGSSHKSMGLDSNPIMKVYYTSRPVLFFMCAGNELFYSMLYLLYFTEGPIVLGVS
LFRVCLFVSFPIMAVKTLISIIHLMDASIRLCAIDADDRNKSN

Nucleotide sequence

Length: 1,297

>KH2012:KH.C1.101.v2.A.nonSL6-1
GTAAAGTTGAATTCCAATCTCACCAACATGGCAACTACAGTCAAGGATATTATGCTCTTC
ATACCGAATTTAATTGGATACGTCCGTATAGTGCTTGCTATAGCTTCAGCTTATTATATG
CCGTTTGATTACGTCACTGCTTCTTTATGTTACGTCATAAGCGTTGGTTTGGACGCAATA
GATGGATATGCTGCCAGAGTTTTTAACCAGGGCACAAAGTTTGGGGCAATGTTGGACCAG
TTGACTGACAGAGCAAGTACTGCTACACTGGTGATGACACTCAGTTACTTCTATCCCAAA
TACATGTTCTTGTTCCAAATGAGCTTAGTGATTGATATCATCTGCCATTGGTTGCACCTC
CATGTCTCTATTATGAAAGGTTCAAGCCATAAATCAATGGGATTGGATAGCAACCCAATC
ATGAAGGTTTATTATACATCAAGGCCTGTTCTGTTCTTCATGTGTGCTGGAAATGAATTG
TTCTACTCCATGCTCTATCTTCTTTATTTCACCGAAGGGCCTATTGTGTTGGGCGTGAGT
CTGTTTCGTGTTTGTCTCTTTGTTTCATTCCCAATCATGGCAGTAAAGACACTGATCAGT
ATCATACACCTCATGGACGCTTCTATTCGCTTGTGTGCAATTGATGCGGATGATAGAAAT
AAGTCAAACTAAATCCACTTTTAAGATTTCATGCACAACTTTCTAGTTTTATCATTTAAA
CCATAATCTTTTGGATTAATTTGTATTATAAATCTAAAAAAGTTATTTTGTTATTTTTTT
ACCTGCACCAATCTGAGAGGCAGGGTTACTCACTTTTAATATGCTTGGTAGCACCAGTTA
TTATAAACTATAAAGTTTTAATTTGTTTCTTGTTAAAAAAGTACCATAGATTATAGAGAA
GGTACATAAAAGCCAAGTGTAACTGTTGTTGTTGAAGCTGCTTTCGTAATTGTTTCTTGT
TGTTGTACACCAACTACCTATGTAAAAAGTTAAGCCACATATATTCACTATATTATTTCA
ACTGTGTAATTTATTGCAGTCGTTTTAGCAACACTGTAACTGTATCTTAAATCAAAAATA
TGTTCGCAGTAGTATTATCAGGTTTTACTAATTTCTCGTTCTTGGTTCCATAGCTTTCAC
ATTGTAATATAAACTGTATCATGCAAAAACATTTATCAAATATCATGTTTTATGCTGCTG
TTTTAACTGTGCTGTGTATTGATTTTGTGTTCATAGTACTTTTTAAAGCAAAATGAATAA
GTCAATGTAATTAGATTATATTCTAACTGATCTATTA

InterProScan

PIRSF	CDP_diag_ino_3_P_euk (IPR014387) - T[3-223] 6.3E-80
Pfam	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[21-83] 4.0E-13
ProSitePatterns	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[61-83] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CDIPT_HUMAN	55.238 %	241	4.47E-81