Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.101.v1.R.ND2-1

Possible name(s)

CDIPT

Gene model

KH2012:KH.C1.101

Location

KhC1 [1,298,507 / 1,301,235]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 216

>KH.C1.101.v1.R.ND2-1
VFVCVAIQSFLPLPYFFAGYVRIVLAIASAYYMPFDYVTASLCYVISVGLDAIDGYAARV
FNQGTKFGAMLDQLTDRASTATLVMTLSYFYPKYMFLFQMSLVIDIICHWLHLHVSIMKG
SSHKSMGLDSNPIMKVYYTSRPVLFFMCAGNELFYSMLYLLYFTEGPIVLGVSLFRVCLF
VSFPIMAVKTLISIIHLMDASIRLCAIDADDRNKSN

Nucleotide sequence

Length: 1,454

>KH2012:KH.C1.101.v1.R.ND2-1
ATTGGTCGCTCGAGCTTTGCGTTTCTCAATTACGTAGTTGTTACGCGTTTCCTCACTTTA
GACTACTACAGACAGTTGTTGTTCTACTAGCAAGGTAAAGTTGAATTCCAATCTCACCAA
CATGGCAACTACAGTCAAGGATATTATGCTCTTCATACCGAATTTAATTGGTGGGTAAGT
TTTTGTTTGTGTGGCAATACAATCATTTTTACCGTTACCCTATTTCTTTGCAGGATACGT
CCGTATAGTGCTTGCTATAGCTTCAGCTTATTATATGCCGTTTGATTACGTCACTGCTTC
TTTATGTTACGTCATAAGCGTTGGTTTGGACGCAATAGATGGATATGCTGCCAGAGTTTT
TAACCAGGGCACAAAGTTTGGGGCAATGTTGGACCAGTTGACTGACAGAGCAAGTACTGC
TACACTGGTGATGACACTCAGTTACTTCTATCCCAAATACATGTTCTTGTTCCAAATGAG
CTTAGTGATTGATATCATCTGCCATTGGTTGCACCTCCATGTCTCTATTATGAAAGGTTC
AAGCCATAAATCAATGGGATTGGATAGCAACCCAATCATGAAGGTTTATTATACATCAAG
GCCTGTTCTGTTCTTCATGTGTGCTGGAAATGAATTGTTCTACTCCATGCTCTATCTTCT
TTATTTCACCGAAGGGCCTATTGTGTTGGGCGTGAGTCTGTTTCGTGTTTGTCTCTTTGT
TTCATTCCCAATCATGGCAGTAAAGACACTGATCAGTATCATACACCTCATGGACGCTTC
TATTCGCTTGTGTGCAATTGATGCGGATGATAGAAATAAGTCAAACTAAATCCACTTTTA
AGATTTCATGCACAACTTTCTAGTTTTATCATTTAAACCATAATCTTTTGGATTAATTTG
TATTATAAATCTAAAAAAGTTATTTTGTTATTTTTTTACCTGCACCAATCTGAGAGGCAG
GGTTACTCACTTTTAATATGCTTGGTAGCACCAGTTATTATAAACTATAAAGTTTTAATT
TGTTTCTTGTTAAAAAAGTACCATAGATTATAGAGAAGGTACATAAAAGCCAAGTGTAAC
TGTTGTTGTTGAAGCTGCTTTCGTAATTGTTTCTTGTTGTTGTACACCAACTACCTATGT
AAAAAGTTAAGCCACATATATTCACTATATTATTTCAACTGTGTAATTTATTGCAGTCGT
TTTAGCAACACTGTAACTGTATCTTAAATCAAAAATATGTTCGCAGTAGTATTATCAGGT
TTTACTAATTTCTCGTTCTTGGTTCCATAGCTTTCACATTGTAATATAAACTGTATCATG
CAAAAACATTTATCAAATATCATGTTTTATGCTGCTGTTTTAACTGTGCTGTGTATTGAT
TTTGTGTTCATAGTACTTTTTAAAGCAAAATGAATAAGTCAATGTAATTAGATTATATTC
TAACTGATCTATTA

InterProScan

PIRSF	CDP_diag_ino_3_P_euk (IPR014387) - T[5-216] 1.9E-74
Pfam	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[20-76] 6.7E-10
ProSitePatterns	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[54-76] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CDIPT_HUMAN	54.774 %	224	1.38E-74