Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.101.v1.A.SL1-1

Possible name(s)

CDIPT

Gene model

KH2012:KH.C1.101

Location

KhC1 [1,298,740 / 1,301,235]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 197

>KH.C1.101.v1.A.SL1-1
YVRIVLAIASAYYMPFDYVTASLCYVISVGLDAIDGYAARVFNQGTKFGAMLDQLTDRAS
TATLVMTLSYFYPKYMFLFQMSLVIDIICHWLHLHVSIMKGSSHKSMGLDSNPIMKVYYT
SRPVLFFMCAGNELFYSMLYLLYFTEGPIVLGVSLFRVCLFVSFPIMAVKTLISIIHLMD
ASIRLCAIDADDRNKSN

Nucleotide sequence

Length: 1,221

>KH2012:KH.C1.101.v1.A.SL1-1
GATACGTCCGTATAGTGCTTGCTATAGCTTCAGCTTATTATATGCCGTTTGATTACGTCA
CTGCTTCTTTATGTTACGTCATAAGCGTTGGTTTGGACGCAATAGATGGATATGCTGCCA
GAGTTTTTAACCAGGGCACAAAGTTTGGGGCAATGTTGGACCAGTTGACTGACAGAGCAA
GTACTGCTACACTGGTGATGACACTCAGTTACTTCTATCCCAAATACATGTTCTTGTTCC
AAATGAGCTTAGTGATTGATATCATCTGCCATTGGTTGCACCTCCATGTCTCTATTATGA
AAGGTTCAAGCCATAAATCAATGGGATTGGATAGCAACCCAATCATGAAGGTTTATTATA
CATCAAGGCCTGTTCTGTTCTTCATGTGTGCTGGAAATGAATTGTTCTACTCCATGCTCT
ATCTTCTTTATTTCACCGAAGGGCCTATTGTGTTGGGCGTGAGTCTGTTTCGTGTTTGTC
TCTTTGTTTCATTCCCAATCATGGCAGTAAAGACACTGATCAGTATCATACACCTCATGG
ACGCTTCTATTCGCTTGTGTGCAATTGATGCGGATGATAGAAATAAGTCAAACTAAATCC
ACTTTTAAGATTTCATGCACAACTTTCTAGTTTTATCATTTAAACCATAATCTTTTGGAT
TAATTTGTATTATAAATCTAAAAAAGTTATTTTGTTATTTTTTTACCTGCACCAATCTGA
GAGGCAGGGTTACTCACTTTTAATATGCTTGGTAGCACCAGTTATTATAAACTATAAAGT
TTTAATTTGTTTCTTGTTAAAAAAGTACCATAGATTATAGAGAAGGTACATAAAAGCCAA
GTGTAACTGTTGTTGTTGAAGCTGCTTTCGTAATTGTTTCTTGTTGTTGTACACCAACTA
CCTATGTAAAAAGTTAAGCCACATATATTCACTATATTATTTCAACTGTGTAATTTATTG
CAGTCGTTTTAGCAACACTGTAACTGTATCTTAAATCAAAAATATGTTCGCAGTAGTATT
ATCAGGTTTTACTAATTTCTCGTTCTTGGTTCCATAGCTTTCACATTGTAATATAAACTG
TATCATGCAAAAACATTTATCAAATATCATGTTTTATGCTGCTGTTTTAACTGTGCTGTG
TATTGATTTTGTGTTCATAGTACTTTTTAAAGCAAAATGAATAAGTCAATGTAATTAGAT
TATATTCTAACTGATCTATTA

InterProScan

PIRSF	CDP_diag_ino_3_P_euk (IPR014387) - T[1-197] 6.3E-73
Pfam	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[2-57] 7.0E-10
ProSitePatterns	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[35-57] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CDIPT_HUMAN	54.545 %	221	5.7E-74