Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C1.101.v1.A.nonSL4-1

Possible name(s)

CDIPT

Gene model

KH2012:KH.C1.101

Location

KhC1 [1,298,482 / 1,301,235]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 216

>KH.C1.101.v1.A.nonSL4-1
VFVCVAIQSFLPLPYFFAGYVRIVLAIASAYYMPFDYVTASLCYVISVGLDAIDGYAARV
FNQGTKFGAMLDQLTDRASTATLVMTLSYFYPKYMFLFQMSLVIDIICHWLHLHVSIMKG
SSHKSMGLDSNPIMKVYYTSRPVLFFMCAGNELFYSMLYLLYFTEGPIVLGVSLFRVCLF
VSFPIMAVKTLISIIHLMDASIRLCAIDADDRNKSN

Nucleotide sequence

Length: 1,479

>KH2012:KH.C1.101.v1.A.nonSL4-1
ATTGTGTTTGTTTTGAAACGTAACAATTGGTCGCTCGAGCTTTGCGTTTCTCAATTACGT
AGTTGTTACGCGTTTCCTCACTTTAGACTACTACAGACAGTTGTTGTTCTACTAGCAAGG
TAAAGTTGAATTCCAATCTCACCAACATGGCAACTACAGTCAAGGATATTATGCTCTTCA
TACCGAATTTAATTGGTGGGTAAGTTTTTGTTTGTGTGGCAATACAATCATTTTTACCGT
TACCCTATTTCTTTGCAGGATACGTCCGTATAGTGCTTGCTATAGCTTCAGCTTATTATA
TGCCGTTTGATTACGTCACTGCTTCTTTATGTTACGTCATAAGCGTTGGTTTGGACGCAA
TAGATGGATATGCTGCCAGAGTTTTTAACCAGGGCACAAAGTTTGGGGCAATGTTGGACC
AGTTGACTGACAGAGCAAGTACTGCTACACTGGTGATGACACTCAGTTACTTCTATCCCA
AATACATGTTCTTGTTCCAAATGAGCTTAGTGATTGATATCATCTGCCATTGGTTGCACC
TCCATGTCTCTATTATGAAAGGTTCAAGCCATAAATCAATGGGATTGGATAGCAACCCAA
TCATGAAGGTTTATTATACATCAAGGCCTGTTCTGTTCTTCATGTGTGCTGGAAATGAAT
TGTTCTACTCCATGCTCTATCTTCTTTATTTCACCGAAGGGCCTATTGTGTTGGGCGTGA
GTCTGTTTCGTGTTTGTCTCTTTGTTTCATTCCCAATCATGGCAGTAAAGACACTGATCA
GTATCATACACCTCATGGACGCTTCTATTCGCTTGTGTGCAATTGATGCGGATGATAGAA
ATAAGTCAAACTAAATCCACTTTTAAGATTTCATGCACAACTTTCTAGTTTTATCATTTA
AACCATAATCTTTTGGATTAATTTGTATTATAAATCTAAAAAAGTTATTTTGTTATTTTT
TTACCTGCACCAATCTGAGAGGCAGGGTTACTCACTTTTAATATGCTTGGTAGCACCAGT
TATTATAAACTATAAAGTTTTAATTTGTTTCTTGTTAAAAAAGTACCATAGATTATAGAG
AAGGTACATAAAAGCCAAGTGTAACTGTTGTTGTTGAAGCTGCTTTCGTAATTGTTTCTT
GTTGTTGTACACCAACTACCTATGTAAAAAGTTAAGCCACATATATTCACTATATTATTT
CAACTGTGTAATTTATTGCAGTCGTTTTAGCAACACTGTAACTGTATCTTAAATCAAAAA
TATGTTCGCAGTAGTATTATCAGGTTTTACTAATTTCTCGTTCTTGGTTCCATAGCTTTC
ACATTGTAATATAAACTGTATCATGCAAAAACATTTATCAAATATCATGTTTTATGCTGC
TGTTTTAACTGTGCTGTGTATTGATTTTGTGTTCATAGTACTTTTTAAAGCAAAATGAAT
AAGTCAATGTAATTAGATTATATTCTAACTGATCTATTA

InterProScan

PIRSF	CDP_diag_ino_3_P_euk (IPR014387) - T[5-216] 1.9E-74
Pfam	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[20-76] 6.7E-10
ProSitePatterns	CDP-OH_P_trans (IPR000462) - T[54-76] .

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
CDIPT_HUMAN	54.774 %	224	1.38E-74