Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.531.v1.R.ND1-1

Possible name(s)

KCNK10; KCNK2; KCNK4

Gene model

KH2012:KH.C10.531

Location

KhC10 [3,294,322 / 3,298,869]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 323

>KH.C10.531.v1.R.ND1-1
TSPMELKTLFVLVVAYFAYLLIGAGVFNAIEGPMEVQHCRESKTALNTAISNLKFGNLTR
NQLVNLIEVMMTYYDKGIPILQNVTCKTRNWDFQSAFFFSGTIVTTIGYGHITPTSTGSR
AFCVIYALFGIPLFAIMFSGLSERFSLVLKKGTNKVDEKPLMKHLLLFVVFSTVGFVLFC
CIPAAIISVAEQWTFGDSLYYAIITLTTIGFGDFVVGDNPRIKYTPLYRVMVYFWILFGL
AYMATVINFLTERFRQRGLMIKKKLGNYEDPDGENAEIAAAVADSPKNSISNGNHTNKEI
NSLNETTSLKSRESSNTGSPGTK

Nucleotide sequence

Length: 1,776

>KH2012:KH.C10.531.v1.R.ND1-1
CCTTGGGATGTGGTCGTGAGGTCAGTGAGCCAATTTTTGTGTGTTTTTAATTAGGCAAGA
CATTTTAGACGTCGCCGATGGAGCTAAAAACGCTGTTCGTTTTGGTGGTGGCATATTTCG
CATATCTTTTAATTGGAGCAGGAGTTTTCAATGCTATTGAAGGCCCAATGGAAGTACAGC
ACTGTCGAGAATCGAAGACAGCTTTGAACACCGCAATTTCAAATTTAAAGTTTGGTAACC
TTACACGCAATCAGCTTGTAAATCTTATAGAAGTTATGATGACATATTATGATAAAGGAA
TTCCAATTTTACAAAATGTGACTTGCAAAACTAGAAACTGGGATTTTCAGAGTGCTTTCT
TTTTCTCTGGTACCATTGTAACTACCATAGGTTATGGACACATTACCCCGACTTCGACCG
GCAGTCGTGCTTTCTGTGTCATCTACGCTCTTTTCGGGATTCCTCTTTTTGCCATAATGT
TCTCAGGATTAAGTGAACGGTTTAGTCTGGTGCTGAAAAAAGGCACAAACAAAGTTGATG
AGAAGCCATTAATGAAACACCTGTTGCTTTTTGTTGTTTTCTCCACCGTGGGCTTTGTGC
TATTCTGCTGCATACCCGCAGCCATTATATCTGTTGCTGAACAGTGGACATTCGGTGACA
GCCTATATTATGCAATTATCACCCTTACCACGATTGGTTTTGGGGATTTTGTAGTAGGAG
ACAACCCACGCATAAAGTATACACCACTTTACCGAGTCATGGTATATTTCTGGATACTGT
TTGGACTTGCTTACATGGCTACAGTCATTAATTTTTTAACAGAGCGATTTCGACAAAGAG
GTTTGATGATAAAGAAAAAGTTAGGGAATTATGAAGACCCAGATGGAGAGAATGCGGAAA
TTGCTGCTGCTGTTGCCGACTCACCGAAAAACTCAATATCCAATGGTAACCACACCAACA
AAGAAATCAATTCCTTAAATGAAACCACAAGTTTAAAAAGCAGAGAGTCCTCAAATACCG
GTTCACCCGGTACTAAATAAATTCAAATGAAAACAGAAAGATGCTGCGACTTTACACAGT
GATATACTTGTTGCTTGTTCTTGAAACTTCTCGTATTAAGTCGTACTGATCAGGAAATAC
GTACTGCCATGATATCAGTGTCTTACTATAAGTGCTTCAGTTAAATTTGATTTTTAGTGG
TGTTGTCCCAATTTCGATGTTTTATCTAATCTATTATGTCAGTCATTAATTTTTGCGAGC
ATTTTAATCTATATATACTTTATTGTATTTAGTATTGCCTTCATTTCTTTTCTTCCAAGC
AGTGTTTTTTAAACCTCAAAGTAAGTTGGTATGCTCCCCCAAATTTGATTCACATAAAAA
ACTTATGAATATAGTTTTCGGGAAAGTAACGGTCATGCTTTTACCATTAATGTGTAATTT
AAAAAAAAAAAAAATTTTAACATGTATTCACATTTTAACATTTTTCATACCATTCTGCAA
TGCTGCAAAAACAATTCTTTTACATTTAACTGCACAATCACTATTGCCATATTTAGTTAC
TATAATGTTGTCTCAGATTTATTACATTACACAGCTAACCTATTACCACAAACCTGCAAT
TTTCTCACTATTGCATTTGATATTCAAGCAGTAACATTAGTAAATAAACATTTTTTCATT
ATACGTTTTTCAAACAAAGAGTTAAATATTTATAGCTTTGGCTGCTCAACATTGTATCTG
CCTCATATTAATTAACGTACGTTTTGTTCATAAAAA

InterProScan

PRINTS	2pore_dom_K_chnl_TASK (IPR003092) - T[12-34] 3.2E-12 - T[135-151] 3.2E-12 - T[231-245] 3.2E-12
Pfam	K_chnl_dom (IPR013099) - T[85-145] 9.1E-17 - T[169-255] 2.8E-16
PRINTS	2pore_dom_K_chnl (IPR003280) - T[102-130] 3.5E-16 - T[207-216] 3.5E-16

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
KCNKA_HUMAN	32.317 %	179	3.48E-52
KCNKG_HUMAN	36.325 %	151	2.13E-43
KCNK2_HUMAN	36.299 %	176	5.16E-52