- Transcript 'KH2012:KH.C10.214.v1...'
Transcript Model
Transcript Id
KH2012:KH.C10.214.v1.A.SL2-1
Possible name(s)
ALDH1A3; ALDH8A1; ALDH9A1
Gene model
Location
KhC10 [4,866,152 / 4,870,542]
Amino acid sequence
Length: 489
>KH.C10.214.v1.A.SL2-1
IKMCDVKEIKNYINGVFVEPKSGKFIESLCPATGLINAKVPSSETSDVDDAVQSAKQAFY
GWSNTSPQDRCNIMRRIADILESRLDEFAQLESQDQGKPVTLATSVDIPRAIYNFRFFAS
VILHETDDCTHLTNPTNALNYVHRMPVGVAGLISPWNLPLYLLTWKIAPAIAFGNTCVAK
PSEFTSVTAWKLCEVFTQAELPPGVVNIVFGDGPTAGEAIVKHKDVSVISFTGSTAVGHH
ISEVVAPLCKPVSLELGGKNAALVFGDANLDDCVQCCVRSSFANQGEICLCTSRIYVDST
IYEEFVAKFVQRTKLLKVGDPDDKSTNVGALISKQHWEKVKHYINIARDDGGKIECGDGV
EQLRLPQRVKGGFFIQPTVVTGVDDSSRCVQDEIFGPVVCIMPFNTEEEAVKRSNAVKYG
LCATVWTSDLARAHRVSKKLEAGTVWVNCWMVRDLNMPFGGMKQSGIGRESAKHSAEFFT
EAKTVCIKY
Nucleotide sequence
Length: 1,999
>KH2012:KH.C10.214.v1.A.SL2-1
ATCTCCACTATTATATTGGCCCTTTGAACTGTCCAATAACATAAATTAAAATGTGTGACG
TAAAAGAAATAAAGAATTACATCAACGGTGTGTTTGTTGAACCAAAATCTGGAAAGTTTA
TCGAAAGCTTGTGTCCAGCTACTGGGTTAATCAATGCAAAGGTCCCATCAAGTGAAACAT
CAGACGTTGATGATGCCGTACAAAGCGCTAAGCAAGCCTTTTATGGTTGGTCGAATACAA
GTCCACAGGATCGTTGCAACATTATGAGGAGAATCGCTGATATCTTGGAATCAAGGTTGG
ATGAATTTGCTCAACTTGAATCACAAGATCAGGGCAAACCAGTGACCTTAGCAACAAGCG
TTGATATTCCTCGAGCGATTTATAATTTCCGGTTCTTTGCTTCTGTCATCTTACATGAAA
CAGACGATTGTACACATCTCACCAACCCAACCAATGCATTGAATTATGTGCATAGGATGC
CTGTAGGTGTGGCTGGGTTGATAAGCCCCTGGAACCTTCCTTTATATTTATTAACCTGGA
AGATTGCACCAGCCATTGCATTTGGCAACACCTGCGTTGCTAAACCATCAGAATTCACAA
GCGTGACTGCATGGAAGTTGTGTGAGGTGTTCACTCAAGCAGAACTACCTCCAGGTGTCG
TGAATATTGTGTTTGGGGACGGACCAACTGCAGGGGAGGCGATCGTAAAACACAAAGATG
TTTCAGTGATTTCATTCACTGGTAGCACCGCAGTGGGTCATCATATATCAGAAGTGGTTG
CTCCACTTTGTAAACCTGTCTCCCTTGAATTGGGGGGAAAGAACGCAGCCCTTGTGTTTG
GTGATGCAAATCTTGATGATTGTGTTCAATGCTGTGTAAGATCAAGCTTTGCTAACCAGG
GAGAGATATGTTTATGTACAAGTCGAATATATGTTGATTCAACAATTTACGAGGAATTTG
TTGCAAAATTTGTTCAGCGAACAAAACTTCTTAAAGTTGGAGATCCTGATGATAAATCAA
CCAATGTTGGTGCACTGATTAGTAAACAACACTGGGAAAAAGTGAAACATTACATCAACA
TTGCCCGTGATGATGGTGGTAAGATTGAATGTGGAGACGGGGTTGAACAACTTAGATTAC
CACAACGTGTGAAAGGTGGTTTCTTCATTCAACCTACCGTGGTGACTGGTGTTGATGATT
CTTCACGATGTGTTCAAGATGAAATATTTGGGCCCGTTGTTTGTATTATGCCATTCAACA
CAGAGGAAGAGGCAGTGAAAAGATCAAATGCCGTCAAGTATGGATTATGTGCAACAGTGT
GGACTAGTGACCTTGCAAGGGCTCATAGAGTATCTAAGAAACTGGAAGCAGGAACTGTGT
GGGTAAACTGTTGGATGGTTCGTGATTTGAACATGCCGTTTGGTGGAATGAAACAATCTG
GTATTGGTAGGGAGAGTGCCAAGCATTCAGCCGAGTTCTTCACAGAGGCCAAGACAGTGT
GCATTAAATATTAATAATAATCATGTAATGGGTTATAGAGGTGTTGGTGGTATATGAACA
CTGGGTTAAATCTATGTATGATTTTAATGGATGCTGGAAAAGTTGAGTACAGTGGCGGGA
AGTGTGTGGGCAATTTAACTGTTTATAAACTGCTGCAACTTTCTTTCATTTAATTATTAT
ATTCTTGCATTATGCTAATGTTCTGAAAACAACATAATGTAACTTACAAATTCTCTATTT
GTTCATTTAAGCTTGGTTTGTTCAACATGTTAATATCCAACACACAGTTGGTTTGTTTGA
ATAGTCTTTTGTCATGCTAATGTCATATAATTAAGATTAGTAATAAGTTCCAGTTATGAC
AAGTTAATTTATCACAAAATTGTTTGGGCTTTGTATTTTACCTCTTAAGGTTTGTGTTTG
AAATAACTTAACAATATTTCATGATTCAATCATGTACACTTTTTTACCGTAAATTGTTAT
ACTAATTAGTGCAATCATT
| SUPERFAMILY |
Ald_DH/histidinol_DH (IPR016161) - T[7-489] 2.23E-163 |
| Gene3D |
Ald_DH_N (IPR016162) - T[13-258] 2.2E-177 - T[456-483] 2.2E-177 |
| Pfam |
Aldehyde_DH_dom (IPR015590) - T[17-485] 5.2E-169 |
| ProSitePatterns |
Ald_DH_CS_GLU (IPR029510) - T[254-261] . |
| Gene3D |
Ald_DH_C (IPR016163) - T[259-455] 2.2E-177 |
| ProSitePatterns |
Ald_DH_CS_CYS (IPR016160) - T[282-293] . |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| AL1A3_HUMAN | 40.081 % | 350 | 7.68E-116 |
| AL8A1_HUMAN | 56.341 % | 590 | 0 |
| AL9A1_HUMAN | 37.603 % | 353 | 2.26E-117 |
