Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

KH2012:KH.C10.142.v1.A.SL2-1

Possible name(s)

CPTP; GLTP; PLEKHA8

Gene model

KH2012:KH.C10.142

Location

KhC10 [3,842,389 / 3,844,172]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 217

>KH.C10.142.v1.A.SL2-1
IINLTMPCLLATNFPIVPDDKQIKTEEFLEACSKIPSIFDLLGGKVFYPVKNDVVGNIKK
IQDRFLQNPIKFATLNQIIEEEKLETDKALKAKDGGGIATNALMWLKRGLLFIILFMEHL
LKKDYGEDMESLKECAKLAYKDSLQSYHGWIVQKLVQAATSACPYRSDFLKKFSEGEGLS
VDEVLVRLEEYIVNFRANVDVIYDLFETTGAEKTHKV

Nucleotide sequence

Length: 1,783

>KH2012:KH.C10.142.v1.A.SL2-1
TGCAAATTTTACAGTTGTTTTACTTAATAATTTAAATTATAAACTTGACTATGCCTTGTT
TACTTGCAACCAATTTTCCCATTGTACCTGATGACAAACAGATCAAAACAGAAGAATTTT
TAGAAGCTTGTTCAAAGATCCCATCTATCTTTGACTTGCTTGGAGGAAAAGTTTTTTATC
CGGTAAAAAATGATGTAGTTGGAAACATCAAGAAGATACAAGATCGGTTTCTTCAAAATC
CGATAAAATTTGCGACGTTAAATCAAATAATTGAGGAAGAAAAGTTGGAAACGGACAAAG
CTTTGAAGGCAAAAGATGGCGGAGGAATTGCCACTAATGCTCTTATGTGGCTGAAACGAG
GACTTCTCTTCATTATTCTCTTCATGGAGCATCTGCTGAAGAAAGATTATGGGGAAGATA
TGGAGAGTTTAAAAGAGTGTGCAAAGCTGGCTTATAAAGACTCCCTGCAGAGTTACCATG
GATGGATTGTGCAAAAACTTGTTCAAGCCGCCACAAGCGCTTGCCCGTATCGTTCTGACT
TCCTGAAAAAGTTCTCAGAAGGAGAAGGATTATCAGTAGATGAGGTGCTTGTACGTTTGG
AGGAATACATTGTAAACTTCAGAGCAAATGTGGATGTCATATATGATTTGTTTGAGACCA
CTGGTGCCGAAAAAACCCACAAAGTTTAGGGTTTTGTGGAAAATCCTATACTGGACCAAA
GCTTTATATGGTACTGGATAAAGGCGCTAATAGTTAGTGTAATCAAATGTAGATTAGTAA
ATGGTTCGTATTTAAATGAGTTTTTTTCTTAGATAATTTTTGATTTCGTAAGAAATAATG
TATTCTAAAATCTTGTAGTTCCTTTTCTTTCTACTTCCTAAGTTATTTCCTATTTCATGT
AGTCCTACTATTACTGCTATCTTGCTTTCTAATCACATTTCTAATACAGGCTTATTATTG
TTATAATATAAATATGATTAAGTAATTTTATGATAATAACTAGCCTAAGCCAAGATATTA
CCATCGTAAAATATTGAAGCTATTTCTTTTTATCCTATTGCTGGCTAATTATACTTTTGA
TATTTCATTACTAAATCTGTTGAAATAACACACAACTGTGCACATGGCCACAATTCAAAA
ATTAATGAAGCTAAAAATGTGCCTTTCAGTTTTTCTAGCTATGTAAGGGAAAAATCCACT
TCATATAATGCAAATTAAAATTGGCCATTTAAGATGAATGCACTGCTGCCTTTCACCATA
AATGACCAAACCATTTTTCTTTTCAAATATCATTGAATTTATGTGTGGGTTGAGAAATCA
TTTCTGTGTCGTTTCCTAATTCCCGTGGTTGTGCACTTAAGTAATTCCTTGTTTTTATGC
AATACCAATTTTCACAGCACCACGTACCGTGACGTCACCAGCGTCTGACACGTCATCGCT
ATTAACAGGTAACGTCCGGTCGGAATGAATGATTAACCTATGATGACGTCATCGGCCGTT
TGGTTTCAGTAATCTGATGCCCTTTTCCCCGGCAAAAATCATGCCTCTGAGCAATCGCGG
AAGCCAGAATCACTTTATTTGTAATACAGCTAAATGAAGCTCAAAAACATGTTTTTCTTG
GCTTAATTATTATACAGTTATTTTCTCTGCGGTAAGATGGATAGTTAAATACCACCCGGT
CTACGATACAAATCGCCAAATTTTCGTAATCGTTTTTAAGAGTTATTGTGCGGTGGGGTA
TTAAGATGGATACCGTTAGAATAAAAATCCTCGAATTTCGTAA

InterProScan

SUPERFAMILY	GLTP_sf (IPR036497) - T[16-216] 1.96E-51
Gene3D	GLTP_sf (IPR036497) - T[22-209] 5.1E-58
Pfam	Glycolipid_transfer_prot_dom (IPR014830) - T[23-174] 2.4E-45

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
PKHA8_HUMAN	33.166 %	98.2	7.04E-24
PKHA9_HUMAN	36.25 %	96.3	1.89E-23
GLTP_HUMAN	46.535 %	171	8.33E-54