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  1. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S643...'

Transcript Model

Transcript Id

Boleac.CG.SB_v3.S643.g12720.01.t

Possible name(s)

SLC31A1; SLC31A2

Location

S643 [53,325 / 63,002]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 228

>Boleac.CG.SB_v3.S643.g12720.01.p
MNGMTSXMDMGNSTMPMNEGGMDMNQGGMDMGQGGMDMGNSAANPQSKVLTVCRIGEAES
VDVPDDDKKLWLCNNGEMMPMYFYFGAHNVIVLFKSWVVNTPGQMVGACFGVFFLAALYE
GLKVLREVLLQRSTMKARARQDGVSYSNGQLVDSSIIVTKPGSTIWSWSHLLQSFLHLIQ
VTVSYALMLIFMTYNGYLAISILLGACVGYFAFGWKKAVIIDVNEHCH

Nucleotide sequence

Length: 3,485

>Boleac.CG.SB_v3.S643.g12720.01.t
TGTAATTTCAGTTTGTGAGTCTAATAATGTTCAGCATATAAGCTGTAGGGTTTAGGCTTG
AGTAGCAGTGCGCTTTCACCGTCTCTTATCATGAATGGGATGACATCTNCCATGGATATG
GGCAACTCTACCATGCCGATGAATGAGGGAGGCATGGATATGAACCAAGGAGGCATGGAT
ATGGGCCAAGGAGGCATGGATATGGGAAATTCGGCTGCGAATCCTCAAAGCAAAGTGCTC
ACAGTTTGCCGTATTGGGGAGGCTGAGTCGGTGGATGTACCTGATGATGATAAAAAATTG
TGGTTGTGTAATAATGGTGAGATGATGCCTATGTACTTCTATTTCGGTGCCCACAATGTC
ATTGTTCTTTTCAAGTCATGGGTCGTCAACACTCCTGGACAGATGGTTGGGGCTTGCTTT
GGTGTTTTCTTCCTAGCCGCTTTATATGAAGGGTTGAAAGTCCTCAGGGAAGTTTTACTT
CAAAGATCGACAATGAAAGCAAGAGCGAGACAGGATGGCGTATCTTATTCCAATGGACAG
CTAGTAGACTCCTCAATTATAGTGACGAAACCAGGATCTACCATCTGGTCNTGGTCACAT
TTACTTCAGTCTTTTCTTCATTTAATTCAAGTGACAGTCAGTTATGCGCTGATGCTGATC
TTCATGACATATAACGGCTATCTAGCAATATCCATTCTTTTGGGTGCATGCGTTGGATAT
TTTGCCTTTGGGTGGAAGAAGGCTGTTATAATTGATGTGAATGAACACTGTCATTGAGAT
TAGTCATCGCTTCAAAGCATAGGACCCCGGTATTAGGTTGCTCATAATTTTGCCAAAAAG
ACGATTCACAATTTTGGATTAATTTTATAGTACATGCCCTGATGGGTTGTAATAAGCAAT
AGCTTCCATGCTATTACACTACTAGGGCAAATATAATTTGTCTCGTTAAAATCCAGGGTG
CAGTGAAATCCATGAAGCTGGTGTTCGACAAAATTCTGTATTCCACATTCTTACTGTTGT
CTACTCCCGTTTCGTCCCTCAAAATCCTGAAGCCTGATAGACCTAGTCTGTATCCACCAT
ATTGAGCTTGAGTGTCCTAGTAAATCAAGATTTGCACCGTGGACAGTGAGACATGCCTGC
GGAGTAGCCATGTTTTGTCATGGAGTCGTGTTGTAGTACCAAGTGTTCTTGAAGGGGACC
TCGCATACAATCTTCCAAATTATTAGGATTCAACACAATCCATGTACCCAAAAACTTCAA
GAAATTTTGCTTGTGAAATATATATGCCGGTTAGTTAAGCACCGTTTACTCCAGAAGCAG
GTCTAATTGTATATATATACGATATGAGTTACACTAATCTGAAGCTTTCGTTTGATCAAG
ATGCAGTTTCTCATTTGCCTCTTCACAGTAAATCCCAGTGATGGACCTATGCAATTTCAA
TGTCGGCTTGTTGTTTCCCCTGTTTATACTGGTAATTGTATGATACAATGAGACTGGACA
CCTGGATAGGCATTACTAGGAAACTGATTTTATGCTATGTCCTANTCATTGATATTCCAA
ATTGCGTNNCCGTTTCTGTCCAATTTGTCTGGCTGGTTTCAGCATATTAGTACGTGGTGG
CCATGTGCAATCCAGAGTATATAATGTATATTCCTGTGCTATCATTCTGTAGTAGCTTCC
AAACTTGACAACTCTTGGGAAGCCTGGAGTGGTCGGCTTCTTGAGATCACAATGTAATTT
TGAATGTACCAGGGTGTATCTGTCTAACCTGAGTCATGGAGTNGCATGTTTTACTATCAG
ATATTTTTTGTTAATTTTGTGCTTTCCCTGATGCCTTGTTTGATGTAGAATTTTTCTTTT
TAGCTCATGACGCTAAATACACTATCATGTATTACATCGTTGTCTTCTGCAAAGCAGTAA
AGGATCGTTGCTATCTTTCCATCAGCCATGGTTTGGTAACGACCTAAAACTAATCAACCC
ACATTTGACCTTGAAATAAATCAATCTTGCTGTTGAGGAGACACAAGGAATCACTTCTCC
AGCTTGTGGTGGCAACAAAACATGATTCATACAGACTCTGCATTGCAGAGATGTCTATAG
ACGTCACTGGATGCGTCTTAGTTGATCATCNGCGATGGGCGAAGCCTGGATGATGTTGTT
TACTATTATCGACATCATTTGTGTCTGCATTTATATTCTTTGACATGCATGTATGCAGAT
TCACACATTCATATGCCAACACACTATTTGTGCTAATTGCTAACTATATGTATAATGTAT
TCCGTCCTCTGTGCCATGACCGGCTAAGTCTTTGGACGCGAACTATAACAAATTGAGCTA
CTGTACTGGTATCCCAATAGGGAAATGGTGGCAGTGTCGTGTGTAATTTATTGAGCATAC
AGTAACTGCCATCTTTTCCATACTGGCTGCTGGCTGGTATTGTGGAGACAGTGGCTTGCT
GTCTTACTCCACTGACACTTGATCATATTATTAAGAAGCAATATGGACAAGAAGTCAAAC
AAAAGAGTAAGACCATTTTATTAACAGTCTAATACAGTGAGCAGCCGTACTTAATTGCGG
CAACCCAAATATAATGCTATTTCACCAGGCATGCAAATAGATGTAGCACGGGTGCAAGGG
GATTCCTGATAGCCACTTGGTATCCTGGAGGATAACNTTCAATANTAAGAAATCAGTTTT
AATTGAAGTTACATCAATCTTCATCAGAGTCGCTGTCTTCCATTGATTGCTTNGCNTAAT
CTTCTGCTTGCCTGTGCAATACATCTGGAACCATTGTATGCTTTTTATCAGTGTCATTTC
CGACCCAGCTAAGTTGTAGGTCAAAATCTTTATCCTTGACTTCATCGTGGACAACGTAAA
TGATTTTAGCGGCCTCTTTCAATGCTTGCTGGCAAGTGATGTTTGAGAAATCTAACTTTT
CAATTTCTGTTTTCGCTCCTTGCTTTGCTTTACCAATAGCGCAACCATTGTACCCACATG
ATAACCCAGAAGGGTCAATCATGTAAAGCTCCGGCTCACCTTCCATTGATGATAGAAGGA
CACTTGCACCAAATGGTCGGAATGCTCCATATAATGTGTATTGATGCATGTACATCGCCA
CTCTATGTGTTAGGTACTTGAGTGGGATATGGGTGCCATATTCCAGTCTGTAATTAGCAG
CTTCGTCTCTTGCTATTTCGACGATGTGCCTTGCATCTGCTAACAGGCCAGCAATAGCAA
TGCCAATATGTTTATCAACATTGAATATACGCATGTTTGAGTCATCCTCATGAAGGCTCG
AGACAATCAGCTTCTCAACGGCCATCACAACACCATCTTTGCATTTTATCGCTATTGCCG
TGCTGCTATTTTCGACTGCCTTTTGAGCATACTCTACTTGAAATATTCTCCCATCAGGAG
AGAACTGATCCGCACTCAAGTCGTAACCTGTCCCGATAGAACTCATATTTTCTGAAAGAA
AACAA

InterProScan

PANTHER
Cop_transporter (IPR007274) - T[76-228] 6.1E-53
Pfam
Cop_transporter (IPR007274) - T[81-213] 9.4E-34

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
COPT1_HUMAN 53.289 % 158 5.17E-49