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  1. Transcript 'Boschl.CG.Botznik201...'
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  5. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S568...'

Transcript Model

Transcript Id

Boleac.CG.SB_v3.S568.g11697.01.t

Possible name(s)

SCAMP1; SCAMP2; SCAMP3

Location

S568 [45,569 / 50,757]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 322

>Boleac.CG.SB_v3.S568.g11697.01.p
MSDYDANPFSDPFADQSVTDAATNSXQANLEDYNPFANQGQSKSEPAVMEPTGNPPAYTP
TPVATXDPQPTPQQQAAVGHEDXLRRQEELERKAEELAQREKQLNSGNYNARTNNWPPFP
KWCPFGPCFFQDFTLDIPVESQRIIKLLYYSWMYYVLLMFLNVFACLGIFIVDPSSGVGF
GLAILWFCINSPCSMCWYRPAYNAFKSDSSFWFFFYFFIMFAQVIVSLIQTIGIPNSGYA
GFIVALSLTSNIGITVVTLVMASLFAVNTTMEIILLKKVHSIYRTSGASFEKAQQEFASG
VMKNPGVQKAATEAATSAINRN

Nucleotide sequence

Length: 4,295

>Boleac.CG.SB_v3.S568.g11697.01.t
AGGCGAAGTAGGCCAATATTTAGATTTTCAACTGCTGTATTGCTTCATCGATACCAGAGT
CTGGAATATTGCAATTATGTCAGATCTTGATAGCAACCCGTTTTCTGATCCTTTTGCTGA
TCAATCAGTTGGTCGAGCAACTACCAACCAAACGGGCGACCTGGAAGATTATAACCCATT
TGCATCTCAATCTGCTTCACAGCCCGCAGTAGTTGAACCTACAGGAAACCCTCCTGTCTA
TACCCCATCACCAGTTGCAAACTCCAAGCCCAATTTCCAACAGCAGGCCGCCCAAGGGCA
GGAAGACCTCTTGCGTAGACAAGAAGAGCTTGAACGCAAAGCAGAAGAACTAGCAAGGAA
AGAGCAGCAACTCAATTCGGGNAATTATGGTGTCCGGAAGAACAACTGGCCACCATTGCC
TGGTTTTTGTCCGGTNGGGCCTTGCTTCTTTCAAGACTTTGCNTTGGATATTCCGATGGA
GTCCCAATGGACAGTAAAGATGGTCTACTTCTCATGGATCTTCTACGCCGTGCTTTTGTT
CTTTAATATGTTGGCAGCCCTGGCGGTCATGACCCAAGACAAGGATCAATCTGTTGGATT
TGGGTTGTCGATTTTGTGGTTTATCCTTTACACGCCACTTTCTCTGTGCTGGTACCGACC
GGTCTACAATGCCTTCAGGTCAGACAGCTCGTTCTGGTTCTTCATCTACTTCTTCATAGT
ATTTGTTCAGATTATTGCCTGTATCATTCAGGCAATTGGAATAACAAATTCTGGGTATGT
TGGATGGATCACATCGTTAAGTATGATGAGTAAAAACACGGGTGTGGCAATATTCGGATT
TGTATTGTCTGGACTCTTCACGTTCAATGTTGTATTAGAGATCTTTCTTTTGAAGCAGGT
GCACTCNATATACAGAAGATCTGGAGCCAGCTTTGAAAAAGCTCAACAAGAATTCGCCAG
TGGGGTGGTGTCAAATCCAACTGTTCAACAGACTGCCGCTCAAGCTGCAGCTAATGCTGT
AACTCGAAAATAGGAATAAGGAAAAAGTTATTGTAATCTGTAACAATATTCCNTGTGTCA
GGCAATGTGATATTCCTTTAATGACCTGTACTGGCAATNATCATACTAGTATTGTAGCCC
ATCATTGGTAATACGTGGCACAGTAAGATGAAGTTACAAAGCTTCTGAAAGTGTATGCAT
TCTTGAACGTTTTCTAAACAATATTTTATTAATTCATAATGGCNAACTCCACAAGATTAG
ATAGATGTAAAGTAATAATGTTCATACACTCAAAGTGTCTGCAATCATCCATGTGAGTGT
AGNACTGTTGAATGCTGATGTTGCAGAGCCAGTTGTATTATTTCTCTTTGACCTATTGCA
GAACACAAAGTAGACTATCATTTGTATTGTATTGTATTGCAGTTGATATTTCTTTATTAA
TTTTATGTTCACACCTTGCCTTTACTGATCCCTGCTGTTATGAAAGTAGTTGACAGTTGA
TGTGCTCTGTTCATTACCAAAGTTGCTGTTATGCAGTAGTTTGTTCACCCGTACTATTAC
AGCAGGTTATTCTGAACAAAGAAAATACAATTGGAGCAAAAACATATTTTCCATATTCGT
TATTGAATCGTGTCTGATTATTTAGCAAAACGAATGAAAAGGTGATTTCATTTGCTTTGT
NCANAAAATTTAAGACTCGGTAGCTCGTCCCTCAAATATATCTAACCTGGGATTCCTGAT
CTCCTCCACAAATCATCCCAAACCAATATCTCAAGCTGCTNCCATNGATGTTTCAGATTC
TGGTTCAATTTAGGGGAGAGGTGTAGTTCTGTCAGAGTACCAGAGAATGATGATCCTGGT
CAAATATTGAGGTGAGGCATGATTTGGTTTGATTTTCCTCGGTTACCTGATCATGAAAAT
CCATGTTCTTGCTTCTCCAGCATGTGACTGCCTCTGGTCCATTAATAAAGTTCTATTTGA
ACTGAATACACTTTCATAAGTTGAAGCGTCTGAAGCAGTGATTTCAGATCAATTGAAATA
TTTTTTGAACATTTGGTTGAGATTCATCTCTCTAATATTTTTATACTTTTCCATATTGCA
TTTTTCTCACTTTCATATATTTCTGACTTAAGATGACTTTGACTCTGCTTGGTGACCCAT
CTATTTGCATGGTTCAAAGCACCTTACCTAGATTGAACCATGTTTCGCATAGCAAACAAA
TATTTTGGCTCTAGCACTTTTTCTCTNTTCATGCTCATTGCAAAAACGGTNGGAGGCTAT
ATCCACAATATGTATAGTCCAGGAGTTTTCAACCTTTCTATACTCATGGCCCACTAAAAG
AATAAAANTATGCGTATGGCCTATTACCTTATTCTTAACAATGAGAATAAATGTGCACAA
GACTTGCTCAAAAATGCTATGGTCTACCACATTATAGTTCCTTTATAGGCATTGCTACTG
GGCTGTTTTTCTATGCTTACCGGTATTTGAAAAATTGTCCAACCTCTGCTCTNACTCTGG
TGAATAGGCTCAGTCTAAAATATTGCATGACATACTATTATTCTACTCCATGACATAACT
TGACATTTCTACCTGCTAATTTCATCAGGCATGTTCACATTTTTGTTGAGACAAGTTCTT
GAGATCTTCGGTGGCATTTGTGATCTAATATTGCTTTGATGTTTGCCATGAACTTGTTCA
AATTCTAATCTTGCTTTATGTCTATGCACATTCAGAAATTCATTATGCTTAATGGTGTTT
AACCTACATATGGTGGTGTGCTTTTCCTCTGCAATCAACAAAAATGTCAGATTATGATGC
CAATCCGTTCTCTGATCCCTTTGCGGATCAATCTGTCACTGATGCAGCTACTAACTCGCA
NCAAGCAAATCTAGAGGATTACAATCCCTTCGCCAATCAAGGTCAATCAAAGTCGGAACC
TGCTGTAATGGAACCAACTGGCAACCCCCCTGCATATACCCCAACACCAGTAGCAACTNC
AGACCCACAGCCCACGCCTCAACAACAAGCAGCAGTCGGTCATGAGGATNTGCTAAGAAG
ACAGGAGGAGCTTGAACGTAAAGCAGAGGAGTTGGCACAGAGAGAGAAGCAATTGAATTC
AGGAAACTACAATGCAAGAACCAACAACTGGCCCCCTTTTCCCAAGTGGTGTCCATTTGG
TCCATGCTTTTTCCAAGATTTCACGCTTGATATACCAGTTGAATCCCAGCGTATCATCAA
ATTGCTGTACTACTCCTGGATGTATTACGTCCTGCTTATGTTCTTGAATGTTTTTGCTTG
CTTGGGTATCTTCATCGTTGACCCAAGTAGTGGAGTTGGATTTGGCTTGGCAATTCTTTG
GTTTTGCATCAACTCTCCATGTTCTATGTGCTGGTACAGACCAGCCTACAATGCATTCAA
ATCTGACAGCTCATTTTGGTTTTTCTTCTATTTCTTTATCATGTTTGCTCAGGTGATTGT
GAGTTTGATACAGACCATTGGCATACCAAATTCTGGATATGCTGGCTTCATAGTTGCACT
GTCTCTCACAAGTAATATTGGAATAACCGTGGTCACATTAGTTATGGCATCGCTTTTCGC
AGTGAATACTACTATGGAAATTATTCTGCTAAAAAAGGTCCATTCCATCTACAGAACTAG
TGGTGCTAGTTTTGAAAAGGCTCAACAAGAATTTGCCTCTGGAGTTATGAAAAATCCTGG
CGTGCAAAAAGCAGCAACCGAAGCAGCTACATCAGCCATCAATAGAAATTGAGAGCTAGC
GTTGCGCTATTGTCACCCCATCATTCTTCCAAGTCCATACTAGCCTGGGCTGAGTGCATT
CATATCGGTGTCGTGGAGTGTGTTGATTGTGTCNTATCTAATTATAATGTATTTAGTGTA
GAAGAATAGTGGCAGAAAGCCAATATACGCTTGCTCTCAATCTGAGGCTTGCGACCTGGT
AGCTTATATGTTGATGAAATTTTGTAATTTATGGGATCACCTTCACTATAAGATCTATAA
AGTTTACTATTCTATCCTCTGTAGCTTACTATACAGTTATCAGAAGTCGTTGCTGTGTAT
AGTACTTCTGTCAGTTTGATATCTTATAACTTTGAGATGTACATAATAACATTGTCATGT
TAGTATCATTATTCTTCAATGCGCAATATCACTTATCTGATGATAGGCTTATATCATGAT
CAGCCATTGCGTGTGGTGCACATTTGTGAAATTGACTGCGCTGTTACTTGATTTACGTGG
CTGTNGCCTACCATTATTAAAAGTAGGAGTACCAG

InterProScan

PANTHER
SCAMP (IPR007273) - T[1-322] 1.2E-106
Pfam
SCAMP (IPR007273) - T[114-285] 2.5E-57

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
SCAM1_HUMAN 45.846 % 281 1.53E-93
SCAM2_HUMAN 44.578 % 278 8.06E-93
SCAM3_HUMAN 50 % 229 1.95E-73