Aniseed - Transcript Card

Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.NC_0...'

Transcript Model

Transcript Id

Cisavi.CG.ENS81.NC_004570.12855-14180.21055.t

Possible name(s)

MT-ND4

Gene model

Cisavi.CG.ENS81.NC_004570.12855-14180

Location

NC_004570 [12,854 / 14,180]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 441

>Cisavi.CG.ENS81.NC_004570.12855-14180.21055.p
MFVYFMFIPLIFLINSSRMKIWFLFYGFIYILKSMFHLFKTNEVVYSNHFAFWSEDVVSN
LLIILSILVILLSGLVMMEGGRMHFMLVSFFFSVFFLIVFFGSDNLLNFLVFFELSMLPI
FMLIGFWGKGKERVFSNYYFFLYTLVTSLPMFIMILKITSIGMESIVTYSFYDLNFTWFM
FFLLVLGFLTKLPIYGVHIWLPKAHVDAPVGGSMVLAGILLKIGGFGMMRCMMILGDGMK
LSYIVMFIMFLGVWGLFFTGSLCLRLTDFKVIVAFSSVSHMSLAVAGLMSFFFWGYKGSF
YMFLGHGILSPVLFFFGDILYKRFSTRHINSMKGISSGVSFFFYLVMLFFFAMNFGFPPS
MNFFGEVGLFMSIFLVNKFLILFLFIGFLMAGVFMLNMFVMLGQSKKMIKNKMILLSYEK
MVMMYFFISYFFISFFLVWIF

Nucleotide sequence

Length: 1,326

>Cisavi.CG.ENS81.NC_004570.12855-14180.21055.t
ATATTTGTGTATTTTATATTTATTCCTTTAATTTTTCTTATTAATTCAAGTCGAATAAAA
ATTTGATTTCTATTTTATAGATTTATTTATATTTTAAAATCAATATTTCATTTATTTAAA
ACTAATGAAGTTGTTTATTCTAATCATTTTGCATTTTGAAGTGAAGATGTAGTTAGTAAT
TTGTTAATTATTCTTAGTATTTTGGTTATTTTACTTAGTAGATTGGTAATAATAGAGAGA
GGTCGAATGCACTTTATATTAGTTTCATTTTTTTTTTCTGTGTTTTTTTTGATTGTGTTT
TTTAGGAGTGATAATTTGTTAAATTTTTTAGTATTTTTTGAATTATCTATATTACCTATT
TTTATGTTAATTGGATTTTGAAGAAAAGGTAAAGAGCGTGTATTTTCAAATTATTATTTT
TTTTTATATACGTTAGTAACATCATTACCTATATTTATTATAATTTTGAAAATTACAAGT
ATTAGGATAGAATCAATTGTAACGTATAGTTTTTATGATTTAAATTTTACTTGGTTTATA
TTTTTTTTATTAGTATTAAGATTTTTGACTAAATTACCTATTTATGGGGTCCATATTTGA
TTACCTAAAGCTCATGTAGATGCTCCAGTAGGAAGATCTATAGTTTTGGCGAGAATTTTG
TTAAAAATTAGAGGATTTGGAATGATACGTTGTATAATGATTTTAAGAGATGGTATAAAA
TTATCGTATATTGTTATATTCATTATATTTTTAAGAGTATGAAGGCTTTTTTTTACGGGT
AGTTTATGTTTACGATTAACGGATTTTAAGGTAATCGTTGCTTTTAGTTCTGTTAGTCAT
ATAAGTTTAGCTGTTGCAGGTTTAATATCTTTTTTTTTTTGAGGATATAAAAGATCTTTT
TATATATTTTTAGGGCATGGGATTTTATCTCCTGTGTTATTTTTTTTTAGAGATATTTTA
TACAAACGATTTAGTACTCGTCATATTAATTCAATAAAAAGGATTAGTTCTGGTGTATCA
TTTTTTTTTTATTTAGTTATATTATTTTTTTTTGCTATAAATTTTGGTTTTCCTCCTTCT
ATAAATTTTTTTAGAGAAGTTGGATTATTTATATCAATTTTTCTTGTTAATAAATTTTTA
ATTTTGTTTTTATTTATTAGATTTTTAATAGCTAGGGTTTTTATGTTGAATATATTTGTT
ATGTTAAGACAATCTAAAAAAATAATTAAAAATAAAATGATTTTGTTAAGTTATGAAAAA
ATAGTAATAATGTATTTTTTTATTTCTTATTTTTTTATTTCTTTTTTTTTAGTTTGAATT
TTTTAA

InterProScan

PANTHER	NADH_UbQ_OxRdtase (IPR003918) - T[34-436] 6.0E-82
Pfam	ND/Mrp_mem (IPR001750) - T[103-388] 1.6E-47
PRINTS	NADH_UbQ_OxRdtase (IPR003918) - T[109-128] 5.6E-40 - T[140-164] 5.6E-40 - T[206-230] 5.6E-40 - T[295-314] 5.6E-40 - T[348-374] 5.6E-40

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
NU4M_HUMAN	34.568 %	198	1.25E-58