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  1. Gene 'Boleac.CG.SB_v3.S16....'
  2. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S16....'

Transcript Model

Transcript Id

Boleac.CG.SB_v3.S16.g03355.01.t

Possible name(s)

SLC12A2; SLC12A6; SLC12A9

Location

S16 [375,522 / 387,120]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 975

>Boleac.CG.SB_v3.S16.g03355.01.p
MGRTGTEKQRLVVESNSNEDVSGTLAGNPQEPNWSSNNMNGVEREPRQLSTFFGVVVPCV
LSMFSVILFLRMGFIVGQAGLTQSLIILFLSYIIIGLTVLSVCAISTNGAIEGGGAYFMI
SRALGPEFGGAIGLMFFLANVASAAMYVFGIVEAMDAYFGQNGELISDAIPSGQWYEFGY
GSAVLFICFLICLIGANIYAKATFIIFVIVMVSVISVIVSFFAKKEFTIYFNEDSALAKC
NHTNVSYTGFNRTTLEENVPYGYSIDYTTGNVQNFISVFAVFFNGCIGINAGANMSGELK
NPSKAIPVGTILACVITWFIYLLLMLFIAASTPRDILQCSYTFLVSINVWKPFVVVGIFA
SSTSALLSQIIGGSRILLALARDELFGIVLRPVVKTTTGGNPYIAVTVTWLLVQILLFAR
NVNTIAPVVTIFFLFAYAAVDMSCLALEWASAPNFRPTFKYFSWHTCLMGMIGCVIMMFL
IQPIYTSVSAVVLIVLVIFIHYRVPTSSWGYISQALIFHQVRKYLLMLDVRKEHVKFWRP
QILLMVKNPRTCCEMIDFINSIKKSGLYVLGHVSPGRLSDMPKDILQAQYLHWTNLVSEL
GVKAFVELTXCPSVREGTEHLLRLSGLGGMKPNTLVLGFYDDSPPKNSFDKMKVFKPRAE
TLQNVNQSKDLPYPGLPHAQSANYFPAIDDTMSSADVLENKSLDAQEYVEIIADAIKLRK
NVCIGRNFNQLDKTDIVARRQSGHLLYIDVWLVNFLHPVMRRNLARPMGASFPEPKSPSP
FDIGTMCGLPESTSSHFDITSVFLMQMGCILNMTPFWKRNSKLRITLCTNDSVDDCDIED
ELNEFLRTVRIKAEIRKVQWEYASLMHTTYSPAKQGLQNQAFSPNFNVEAPKDLHSKHIP
AIGDDDESINQYLSDVNNLIKSNTDNSVVTFLYLPAPPTDDSLYAEYLRMLTVISQDLGP
TLYIHGLSHVVSTTL

Nucleotide sequence

Length: 4,016

>Boleac.CG.SB_v3.S16.g03355.01.t
ATACAGTTGGTACCTGGAAGTTAGGAACTGAGTTGATGTGATAATTGTGTAGTTGAGAGC
TCATAAGTGCAGAGTTGCGACGTTGACGTGAACTAGTATCAGTATCACAACCCTGTCCTC
AAAAATGGGTAGAACTGGTACTGAGAAGCAGCGTCTTGTCGTGGAATCGAACAGTAATGA
AGATGTTTCAGGAACGTTGGCTGGAAATCCTCAAGAGCCCAACTGGAGCTCCAACAACAT
GAATGGTGTGGAGCGAGAGCCGCGACAACTATCGACATTCTTCGGAGTAGTAGTGCCATG
TGTCTTGTCAATGTTCAGTGTAATTCTCTTTCTTCGAATGGGTTTCATCGTCGGCCAAGC
TGGATTGACACAATCTCTTATCATTTTGTTCCTCTCATACATTATCATTGGATTGACAGT
TCTCTCAGTTTGTGCAATATCTACAAATGGGGCTATTGAAGGTGGTGGAGCATACTTTAT
GATAAGCCGAGCTCTCGGACCTGAGTTTGGGGGAGCCATTGGCCTCATGTTTTTCTTGGC
AAATGTAGCATCAGCAGCCATGTATGTCTTTGGTATTGTTGAAGCGATGGATGCATATTT
TGGTCAAAACGGAGAACTGATTTCTGATGCAATACCAAGTGGACAATGGTATGAGTTTGG
ATATGGCTCTGCAGTGCTGTTCATATGTTTTTTGATCTGCCTTATTGGAGCCAATATCTA
CGCCAAAGCGACGTTCATTATTTTTGTAATTGTTATGGTGTCGGTCATATCTGTGATTGT
AAGCTTTTTTGCAAAGAAGGAATTTACTATCTACTTTAATGAGGACTCAGCACTTGCCAA
ATGCAATCATACCAATGTTTCATATACAGGCTTCAATAGGACAACTCTGGAAGAAAATGT
ACCATATGGGTACTCTATTGATTACACAACTGGAAATGTACAAAATTTCATATCAGTGTT
TGCTGTATTTTTTAATGGTTGCATTGGAATCAATGCTGGAGCAAATATGTCAGGAGAATT
GAAGAATCCAAGTAAAGCAATTCCAGTAGGGACCATTTTGGCTTGCGTCATCACATGGTT
CATCTACTTACTGCTAATGTTGTTCATTGCTGCGTCTACACCCAGGGATATATTGCAGTG
CAGTTACACCTTCCTTGTCAGCATTAATGTTTGGAAGCCATTTGTTGTTGTTGGAATCTT
TGCGTCTTCTACATCAGCATTACTCAGCCAAATAATTGGAGGGTCAAGAATTTTACTCGC
ACTGGCCAGAGATGAACTTTTTGGCATAGTCTTGCGGCCTGTTGTCAAGACTACCACAGG
AGGAAATCCGTATATTGCAGTCACTGTTACTTGGCTTTTAGTCCAGATTCTACTTTTTGC
AAGAAATGTAAATACAATTGCTCCTGTTGTCACCATCTTCTTTTTGTTCGCTTATGCCGC
TGTGGATATGTCATGCCTTGCTTTGGAATGGGCTTCGGCTCCTAATTTCAGACCCACATT
CAAGTATTTTTCATGGCACACATGCCTTATGGGAATGATCGGATGTGTAATCATGATGTT
TCTTATACAACCTATCTATACCTCCGTTAGTGCTGTTGTTTTGATTGTTTTGGTCATTTT
CATACATTATCGGGTGCCAACCTCTTCCTGGGGATACATCAGTCAAGCATTGATATTTCA
TCAGGTTCGAAAATATCTTCTTATGCTTGATGTCCGGAAAGAACATGTCAAATTCTGGAG
GCCACAAATTTTGTTAATGGTGAAGAACCCCAGAACTTGTTGTGAAATGATTGATTTCAT
CAATTCCATTAAGAAATCAGGGCTCTACGTGTTAGGGCATGTAAGCCCTGGACGTCTATC
GGATATGCCAAAGGATATCCTCCAAGCACAGTATTTACATTGGACAAATTTAGTGTCGGA
ATTGGGTGTGAAGGCTTTTGTCGAGTTGACGNTATGTCCATCTGTAAGAGAAGGAACTGA
ACACCTGCTNAGATTGTCAGGATTGGGTGGAATGAAACCAAACACCCTGGTGTTGGGTTT
TTATGATGATTCTCCTCCGAAGAATAGCTTTGACAAAATGAAAGTTTTCAAACCTAGAGC
TGAAACACTGCAAAATGTTAATCAATCAAAAGATCTGCCATATCCAGGATTGCCTCATGC
CCAATCTGCAAATTACTTTCCTGCAATCGATGACACGATGTCTTCTGCGGATGTTCTTGA
AAATAAGAGTCTCGACGCGCAAGAGTATGTCGAAATTATTGCCGATGCGATCAAGCTCAG
AAAAAATGTCTGTATTGGAAGAAACTTTAATCAGCTTGACAAGACTGACATTGTAGCAAG
AAGACAGAGTGGCCATCTTTTGTACATTGATGTTTGGCTGGTTAACTTCCTCCATCCAGT
GATGAGACGAAATCTAGCAAGACCAATGGGAGCATCATTTCCCGAGCCGAAATCACCGAG
TCCTTTTGACATCGGGACCATGTGTGGCCTTCCTGAGTCTACATCATCACATTTCGATAT
TACAAGCGTGTTTTTAATGCAAATGGGGTGTATTTTGAATATGACTCCTTTCTGGAAGAG
GAATAGCAAATTGCGCATTACGTTATGTACAAACGATAGTGTTGATGACTGTGATATTGA
AGATGAGTTGAATGAATTTCTGCGTACTGTCAGAATAAAAGCAGAGATACGTAAAGTACA
ATGGGAATATGCATCACTAATGCATACCACTTATTCACCAGCAAAACAAGGTTTACAGAA
CCAAGCTTTCTCTCCAAATTTCAATGTTGAAGCGCCAAAGGATCTTCACTCCAAGCATAT
TCCAGCCATCGGAGATGACGATGAGAGTATCAATCAATATTTGTCGGACGTCAACAACCT
GATAAAATCCAACACTGATAACTCTGTGGTTACATTCTTGTATCTTCCGGCTCCACCAAC
GGATGATTCACTGTATGCTGAATATCTTCGTATGCTTACTGTAATATCCCAAGATTTGGG
CCCTACTTTATACATCCATGGACTATCCCATGTCGTTTCCACCACGTTGTAGTTGCAGTT
TTTATGTGTGTTTATGTCTTTAATGTTTAACTTGCTCTTATTTGAGATTGTTCCCAGTTG
CTATATGTACTTGAACTGTATGCTGTTAGCTCATTGCTCAAGTGTATAGTGGATTGTTTT
ATGTGTTCTTGTGTTCGTAGCAAAGCTGTGGAGTTGGGTTTCAGTTTTGATCCTTTTTAA
TGTACTTCACCATTTATGTATTGAACAATTACAGGATTTAAGTGTTGTTCCTGCTGTGTA
ATGTCATAGTTCTCAAAGTTTTGTATTGATCTTAATGTAAGCAAATTGTAGTGACTGACT
AGTAATCCATGATATACCAGTTCATGAATCCTGGTGATTATCATCATCAATATGCCGATG
TAGAGTTGTAGATCCAGTGTTCCGTCTACTAAGGTTGGACTCAAAATCATATTTGCTATT
GCTAGGTCACGTTACATTTTCAATCCCCCCGCCACTGGTATTGAATGAGTGTATTTTTCA
CCCACTGCGGATTCAAATCATTTGCATTCGATGAGATACTGTTTTCTGATCCGGGAATTC
TGTCAGTGGGTTTCCTACATAGATGGTGATTAAAGCTAATCCTACATTAGTGGTTTTTGA
AAACCAATATTAGGGAAGGCTGCTCAATTTCGAGTCGGCTGAATCATAATCTGCTTAAAT
CTATGTTCCCAGATAATCTGAAATCGTTAATCTACGATTAACCTTAATCGTTATTTACGA
AACCGATACTACACTTCATTACATCGTTACTGCATGTGCTCGAATTCTGAGGTTTGGTTA
TAATACACGTATTGCTGTTCCTATCGGGGGATAGCGTCCATTTTAATTATATTTTTTGGG
CAACTGTATCCATAATATATTTCATTCAATTGTTGGTTTTTCTTGAGTTGCCGTTGGCGA
GTAATACTTATTAGTGCAATATACTTATAGAGCCATTAAACGAATTCGTTGTGATA

InterProScan

Pfam
AA-permease/SLC12A_dom (IPR004841) - T[54-543] 2.1E-91
Pfam
SLC12_C (IPR018491) - T[554-642] 3.1E-13

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S12A9_HUMAN 44.894 % 764 0
S12A2_HUMAN 31.002 % 293 2.02E-83
S12A6_HUMAN 30.085 % 288 3.66E-82