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  1. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S0.g...'

Transcript Model

Transcript Id

Boleac.CG.SB_v3.S0.g00075.01.t

Possible name(s)

RAB26; RAB37; RAB8B

Location

S0 [710,157 / 714,885]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 269

>Boleac.CG.SB_v3.S0.g00075.01.p
MAQDSHTGVTGWHSTDRLRHTNNEREDLPSAKAAYIISMPRRSSRVQLPNGRSRISSSAS
TADFDISFKIMLVGDSGVGKTCLLVRYKDDTFLSGSFISTVGIDFRNKIVAIDDRKIKLQ
IWDTAGQERFRSVTHAYYRDADALLLVYDVTNRKSFNSVKSWITDIQHHAKDGVTVLLVG
NKADNSSRSITTAEGEQIAKEYHMTFVESSARTGMNVELAFNAIAKELHRKSLTAADCFG
EGKGAYCKTRDSFNINEYVESEKEKVSCC

Nucleotide sequence

Length: 3,324

>Boleac.CG.SB_v3.S0.g00075.01.t
GGCAAAAGAGGCGGAGGTTAGTCTTCTTTTCTCACGAGTGTCGTGTTGCGGTATATTGGT
TGCGATCAAGCTTGCGGTTGTGGGAACAAAAGGTAAGATGCCGAACTTGACTAAATGGCT
CAAGACAGCCATACTGGCGTAACAGGGTGGCACAGTACCGATAGATTACGTCACACGAAT
AACGAAAGAGAAGACTTGCCAAGCGCGAAAGCAGCATATATTATCAGCATGCCAAGGAGA
AGCAGCCGAGTTCAATTGCCAAATGGAAGGAGTCGTATTTCAAGTTCAGCTTCAACTGCG
GATTTTGACATAAGTTTCAAGATCATGTTAGTGGGTGATTCCGGTGTTGGTAAAACATGT
TTACTGGTTCGCTACAAAGACGACACATTCCTCAGTGGAAGTTTCATATCAACTGTCGGA
ATTGATTTTCGGAATAAAATTGTTGCCATCGATGATCGAAAAATTAAGCTACAGATCTGG
GATACTGCAGGTCAAGAAAGGTTTCGCAGTGTCACACATGCATATTACCGAGATGCTGAT
GCTCTTCTACTTGTTTATGATGTGACAAATCGAAAGTCTTTCAACAGTGTCAAGTCTTGG
ATCACAGATATCCAACATCATGCCAAAGATGGTGTTACTGTGCTGCTTGTTGGCAATAAA
GCTGATAATTCATCAAGATCAATTACAACAGCGGAAGGCGAACAGATCGCAAAAGAATAC
CATATGACGTTTGTAGAGAGCAGTGCTAGGACTGGTATGAATGTTGAACTGGCGTTCAAT
GCTATTGCTAAAGAACTACATAGGAAATCACTAACTGCCGCTGACTGTTTTGGGGAAGGG
AAAGGTGCCTACTGCAAAACAAGGGACTCCTTCAATATTAACGAATATGTTGAAAGTGAA
AAAGAAAAAGTGTCATGTTGTTAGTGTTCAATTTATCAATGCATTATGATTATATTATCA
TGTCCTGTTTGATTAATGTTTTCTTTTGGCAATTCCAATGGTCAGCAACACATGAATCTC
AGAACTTGTCCCACAATTGTTTTGTGTATTTGGATAACATTCAAGTATTTACACTATCAA
GCATCAAAGCTGATTGTAATAATCTTGAGTGCTGCTAATAACAGCTGTGAAATTGCAGCT
TGATGTGCCTATATTCACTTACCTGGGCCTATTGTTTATATCCATAAGATGCAAGTTCCT
CCATATTGTAAATTTANTGTGAGGTGGTTTTCACCACCATGCTGCTATACAGTATTGCTG
AGACGCTGATGAAAACTCAACCTTGATGGCTTCACCCATAATTCTTCCCTTGTTTGATAG
TACACGATCATATTAAATAATTTGTTGTAGATTTTTCAGTTTTAGCCTTAGTGTTACTGC
ACCGAGCTGTACTGTTCATACAGCCAGACTTCATATTTTTATCCATTATTACAGTGAATA
TAAGACTATCTGTTTGCTGTAGCAGCTTGGTAGTCGCTCATGTCATACTGTATTATGATT
TTCCAATTTTATGATATACTGGTAGAATAAATAAGGTCTATTCAGGCTCCTATCACACGG
GATTGATATGAATCTTTGATGAATGGCTTTTCTATCATGACTTGTACATGTTGAGTGCAA
GCCTTATACTGTACTAGGATGTTGGGTTCTTGATATTACTATGATATAGTGACTGGTTGA
ATAGTAATTTATCATGATGCCAGGTTGATGGCAATATCGGCTACTTACAAAACATACTTT
GTTAGTATGATTCTGGCACTAGAGAATTTTATATTGTAGCTTAATGATTTATACTACTGT
TTTGGGGCTGGCGAATGGTACTTGTAAAATTCATAAGTGTGGGCTTATTTGTTTTATATT
CTCCCCTTGGAAATCATTTAGTATCACTTTGCCAATAGACTATAATTTACTAGTAATCAA
AGCGTTAGACTCATATCAGACATGTTATTAATGCCAAAAGCTACTCATTTTTCATAGAAA
CTGTGCTTCTATGATACCAGTATACAGTCCAAAGTTGTGTGCAACTGTGCATGCAAGACA
TCAGTAAGATTAATCTCTGCTGTAGGAATTGACTTTATCATATTGTTCCTTTGTATNCAG
GAACATCCATCTTCACAAATATATTCCTTGAAAGGCACACCTTGAGCTAACTTAAGGATG
AATTGATTTACGGTGCATTTTATAGACGGTGATTAAAATTGTCACAGAGCCCTGGCCATG
AAGCATCGGCATACCTTAACTTGTCAAGTAGGAGAATCAATGAATATGCATTATTGAATG
TATCCAAGCGTCTCCTTGACTGGCTTATAAATTTTTCATTGTGTCATTAGATATTATCCG
TGTCTTCTATGGATTGGATCATAAGAGATTACCGGTACCTTTCATTAACGGAATACCATG
GTCATATATGGAGGTTTGACTGTTGTCAGCATTCTCTTATCAGATTTTTTCTCTTGATAA
GACATAACTGTTGCATCTCACTGTATTTAATTCCACTGGGCAATTAAGCAAAAGTTGTGA
CACTGTTCCAGTTGAAATATATCATGAAAATAATGTGTCACGGCTCAGAATGCAATTAGA
ATCAGTGCAATACTTTGGGCAACAGTGATAATCATTTGATTTTAAGTATGAATTCCAAGT
TTTCCTTTACAATTACTGTAGCCCTGGTTGGTTCTGCATTTTGGTGTCATCCTGTCATTT
GGCTACATGATTCGATACAGTAAGCATTAATTGTTACATGTGTTAAATCGTGTTTGTTTT
GTTTGTGAAATGCAATCACAATTTCAGTGTTCTATTAGTTGATGAAACCTTTGAAAGGAC
TGCTAGCTATCATTACCATACCTTGTACAGTGTATATATACATTTTATTAATTGAAAGGG
GTCGTTGCGTCTAAATGAGATGTCACTAAAGTTACATTTTGACGATAAATATTTTGCACA
ATTTTGTTATTAAAAGTGGGATCTTGAGATTCACCATTATCTTCTTTCCACAATAGTCTT
GTTAGCCTGCAGCCGTACTCCCTGTTTATCCTTGTTTGTAAACAAAGGGGATTATAGCCA
GAAAACAATAAAACGCTAAGATTGTGATTCCTCACCTGTGTCTGAGGTAAATGACTATTA
ACCTAGACAAAAATACCCAAACTCTTGTACCAGTACACAAAGAATTTAGCGAAATGTGAC
TACTGCCAAAACCTCCCAGATGCTTCTTTTCTTTTACTTTAGTCATATAAATAAATGTAC
TAAATTCATCCTTTTTTGTGACATTGTTTCAAGTTCATTTTTGCACTGTATGGTACGATA
CGTGTCATGTCTAACCACCCCATC

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[65-230] 2.93E-56
TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[68-224] 3.5E-34
Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[69-228] 5.8E-59

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RAB26_HUMAN 50.207 % 257 4.3E-86
RAB37_HUMAN 54.299 % 256 2.49E-86
RAB8B_HUMAN 50.888 % 189 3.83E-60