- Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S0.g...'
Transcript Model
Transcript Id
Boleac.CG.SB_v3.S0.g00051.01.t
Possible name(s)
CELF1; CELF2; CELF5
Gene model
Location
S0 [471,682 / 481,807]
Amino acid sequence
Length: 477
>Boleac.CG.SB_v3.S0.g00051.01.p
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CCFVTFYSRKSALDAQNELHNIKRLPGMHHPVQVKPADSEGRNDERKLFIGMISKKYMEN
DVRTMFSQFGDIEECRLLTNPEGGSKGCAFVTFSKKHMAQSAIRNMHHSTTMESCSAPLV
VKIADTPKDKERKKMQAQVQTQLSTLSLQWKNFANLAVLAPFLQQGAQNHSNQFGSNAMQ
MPNLAQLNPAQLQQLFTLMAAAQSIINNNQSAMDSMGPISPGLHNAPSGSTGAPLSSLSS
PHGGNNMHPASHNGGSPASNGFGGGMGNHNGNPLSQMAASLGLGIPHDGVSPGPSGANVI
GNIPGLHNGAYGQNMLNGNGAAGSQKEGPEGANLFIYHLPSHFNDHDLMERFLPFGNVIS
SKVFIDKQTNLSKCFGFVSYDNCVSAQQAIRAMNGFQVGTKRLKVQVKRSKNESKPY
Nucleotide sequence
Length: 4,213
>Boleac.CG.SB_v3.S0.g00051.01.t
CTGTAGTTGACATATGTCAAATTTGTGTGTCTTTGTGCACTGTTTTGTGCTGGAGCGAGC
ACTCCCAAGGATTATACGGGACGAGTATCTGCTGCTTACCTAGTTGAACATTCTCCAATC
AAACACCGCTCCACCGGTATCTAACCTAACAACAACCTCATATAAAGATTTGACTGCGAT
TTTACAAATCATCGAAACTGCATTGAAGCACAGCTCTTTGAATTCGGTTATACTTATTTG
TTGAGATCATCTTAACCCTATCATGAATGGGAGTTCACAAGGATCAGTTCCAGATCAGCC
AGATCCGGATGCCATCAAGATGTTTGTGGGACAGATTCCCAAATCTTGGGATGAGTCACA
ACTCCACCAGCTTTTCGACAAGTATGGTAGAATTTATCAGTTAAATATACTCCGAGATAA
AGGACTGAATACGAGCAAAGGTTGTTGCTTTGTGACATTTTATTCAAGAAAATCGGCCCT
TGACGCACAGAACGAACTTCACAATATAAAGAGATTACCTGGCATGCATCACCCTGTGCA
AGTTAAACCAGCAGACAGTGAAGGTCGTAATGACGAACGGAAGTTGTTTATTGGTATGAT
AAGTAAGAAGTATATGGAAAATGATGTTCGGACAATGTTTTCACAATTTGGAGATATCGA
AGAATGTCGGTTACTGACAAATCCTGAAGGTGGTAGTAAAGGCTGTGCTTTTGTAACGTT
CTCAAAGAAACATATGGCACAGAGTGCAATTCGAAACATGCATCACTCAACGACAATGGA
GAGCTGCTCAGCTCCTTTAGTTGTGAAAATCGCTGACACGCCCAAAGATAAAGAACGAAA
AAAGATGCAAGCACAAGTGCAAACACAGCTCAGCACTCTTTCTCTTCAATGGAAAAACTT
TGCTAATCTTGCCGTTTTAGCCCCGTTTCTTCAACAAGGTGCTCAAAATCATTCGAATCA
GTTTGGAAGCAATGCTATGCAAATGCCTAATTTAGCACAATTAAATCCTGCGCAGTTGCA
GCAATTGTTTACTTTGATGGCAGCGGCACAATCAATTATCAACAACAATCAGTCTGCCAT
GGACTCGATGGGCCCTATCAGTCCAGGACTTCACAACGCTCCTTCCGGTTCAACAGGTGC
GCCACTATCGAGCTTGTCATCACCACATGGAGGAAATAACATGCATCCAGCTTCCCACAA
TGGCGGGTCACCTGCCAGTAATGGCTTTGGTGGTGGAATGGGCAATCACAACGGTAATCC
ACTAAGCCAAATGGCTGCTTCTTTGGGTCTTGGCATTCCTCATGATGGTGTTAGTCCTGG
CCCATCTGGTGCAAATGTCATTGGCAACATACCCGGCTTGCACAATGGAGCTTACGGACA
GAACATGCTGAATGGAAATGGAGCAGCTGGGAGCCAAAAAGAAGGTCCGGAAGGTGCTAA
CTTATTTATATATCATTTACCATCACATTTTAACGACCATGACCTAATGGAGAGATTCCT
CCCTTTCGGCAACGTGATATCATCAAAGGTTTTCATCGATAAGCAGACGAACCTTAGTAA
ATGTTTCGGTTTCGTGAGTTATGATAATTGCGTCTCAGCTCAACAAGCTATCCGAGCTAT
GAACGGGTTTCAAGTTGGAACTAAAAGGTTAAAGGTGCAGGTGAAGCGGTCAAAGAATGA
AAGTAAGCCATATTGACGTTTACGATGTCAAAATAGGTTGTGGCTCCTCCACGCCATTCA
TCAACTATAGCGTGTTTGTGATACAGTTATTGCGTTGTGTTTTGGCTTTGTTATGATTAA
TATTCCATTCGTTTTGGTATGGGTCTGTCCACGTACGAAACATCGCAAACGGCATTGCAT
TGTTGTCTATTTCCGGTCTCTTTGCACTTTCGTATGTGACCAGCGAAGGACTGTTGCGGA
CAGTATTCTCTGGTGTAACTGAAGTTATATGTGGTCGCGTCTTTCTGTTATTACATCCGT
TGGGTAATGGGGAGGATGAATTTTCTTCATGCTATCACTGGCCGGAATACGCTATTTATT
ACTGGAGAATACTCTACTGCGCTTTTGACACACAATTCTGTAAACGAAGCATAAACTACT
GACATCATGGGCATCCCAAATAATATTTTCCTCAACACACCTTCTGGATTCAACTCTTTG
AAGCATTTGTTGCTGACGAACTGAAAAATAGCTGCGGAACACTTTATACTATTGTAGTAC
GCATTTGAGATGGCACCCTTCGAGTAGAAATAGTTGCTATTGATGCACGCCGTATCTCCA
CCGTCAACCGATTGATTCTGTAAGACTGCGTCTTTGTGGCGGACATGATCGATGATATTC
TTCTTTTCGCCCTGAAACAACTAATTTCGTTGTCAAACCTGTTGTTCTGCGAATCTATAT
TTTGTCGTTGGTGATTTGGATATTAGTGTGGTCGTTATCTGTCGCTATAGGTGCCCTGGT
GCTGTCATTGATGAAGGCATATGCTGTGAAACGATTGTGAATCGTTGGTGATGCCGATTC
CAGTAGATTCTATCAGATAACGTTGTTTTACGGTTTTATTTATTCTCATTTACTGTTGTT
CTCATTTGTAAGTCCAGAGTTATATTTTAGCCGATAAATATTATGTGAAATACAAAGTTA
TATTTTGCGGTGATTTTGGATGTTAACGCTGTTGCATTTGTTCTCTTCATCAGTTCATGT
CACGCCACCTCGTGGCAGTTTCATTGATGTATTATGGAGTTATGAGTGGCCTCATTTGTA
TGTATGCACAGAAACTGATTCCACAGACAACTAACAAATTCGTGCGTTTGATGCAGTCGT
TTCCAATAGTAACTAGCGAGGCAAGCGCAGGCAAATTACTTCTGTTTCTTCCTGTCTTGT
CGGTTTGGTTCGCTCAATATACACTAGGGCTCATCCGGCACTACAGTTGTAGCAGTTCTG
TAAGTCAAGCGTTTTCGAAACCTGTGACTTACACTAAACTAGTCAGTAACCATAAGTTAT
TGAAATTTTGGTGTGTTAAACCGTAGTTCAAACAAGTGTTTATATCACTCACGTTTAAAA
TCACTAGTAACGATAACTGCGCGATGCCCCCACATATTGGAAACGCCTGGCATTTTGACT
GCATTTTTGTTGAACCGTTAGTGGCTCATTGGCAGCTCAAAGGCCACTATTCGCGTCACC
ACAACCAAGTTAATAGCAGTTGGCCAAGTGGTGTGCTATGGTGAATTAATCTTGATGGGA
TGTGTAACGTCGCTTGATTCAAGGTCATGAAAATTCCATTGTACACCCTGACATCAGCGC
TGAAAGTGTTAACGTTGGTTCACTTTTTTCTCTACGTTAGCTGTCAGTGGAAACAGCTCT
AAAAAAATCGGTCGTTGCTCGAGAGGTTTAATGCGCTCATTTTGTTCGTTGTTTTGGGAA
ACAGCCTCAAATAAAAGGTTTTCCAGTTTTGTTGTTTTTTGTGTTGTTTCTATTGTTGAT
AATTGAGAGATATATATTTGTTGACAATTATTTTGTGTATGTGATAAAAACGCTCTTCGC
GAAAAAGATGAAGATCTATATAAATAGATATATTCATTACAAAATAGTTAACTAAAAAAT
GTTATTTGTTCATGTTATAATTCAGATATTGTTTTTTGTTTCTGTGTTAATATATCAACG
TTAATCGTGTTTAATCAGAAGTAGATGAAGGGTTTAAAAGATAGGCAATTCTTTTGATTA
GCTGACTAATAACGATANCCTTTCGGTGGTAATATCACTCAGAGTGTATTTTTTGCAGTA
TTATTCATCCCTAGTGCCCAGGAGTGATGTTAAAGTTCAAAATCTGCTGCTTTGTGTTGA
TGTGCGAACGGGCATAATTTAATGATTTTAACCGGTCTAATTCATATGTTAAGATTGTTC
TAATAGGTTTTGTAAGATATAAGGTTAACTATACGTTTAAGGTCGTTTTAGGAATGCTAT
CAGCATTGTGGTATACAAGACGATGTCTGTCCAATTGCTTAATTTCACCCACCAAGCACT
GTTTAGTATGAGAATTTTATGAGCGAATATTTCGTCTTATCGGTCCAGTTCCGTTTAGAT
TTTATTGTATTGTACGTGTATACAATAGTATTGATTGTAGTGTTCTCGTTCGGTAAGTCG
TGGTGTTCATTTGTCCTAACTATATGTCGTAATGCAGAATAAATGTGTGCTTGCTATTTG
TCGTTTACTTATG
| Gene3D |
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[4-101] 3.3E-23 - T[102-194] 3.2E-25 - T[372-476] 7.8E-26 |
| SUPERFAMILY |
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[7-103] 7.52E-21 - T[104-196] 1.9E-41 - T[389-473] 1.9E-41 |
| ProSiteProfiles |
RRM_dom (IPR000504) - T[18-99] 14.146 - T[106-186] 14.846 - T[392-470] 15.46 |
| SMART |
RRM_dom (IPR000504) - T[19-95] 5.5E-17 - T[107-182] 4.2E-17 - T[393-466] 1.1E-20 |
| Pfam |
RRM_dom (IPR000504) - T[21-85] 5.0E-13 - T[108-172] 5.1E-15 - T[394-464] 1.0E-14 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| CELF2_HUMAN | 52.286 % | 459 | 1.17E-158 |
| CELF1_HUMAN | 51.215 % | 445 | 1.86E-153 |
| CELF3_HUMAN | 40.166 % | 338 | 4.03E-112 |
