Aniseed - Transcript Card

Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S65...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S658687.g31245.01.t

Possible name(s)

DHDH; GFOD1; GFOD2

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S658687.g31245

Location

S658687 [4,603 / 7,127]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 292

>Moocci.CG.ELv1_2.S658687.g31245.01.p
MGVPFSTSHIDQLLLQQKVDVVCINSPPFLHSQIAVKTLGIGKNVLCDRPAGLEHNDTVK
MIEAARYYPSLMSLMTYHMRFLPTFRTMRSMVAERFIGNILIIEVRVHCNLSQSDRYNWS
HDDRMGGGILAMFGSHFVDIVSFISTQKAIDVHGHLRTFQKSTDHVNGKFSYEVLVIGSQ
GQLVVKEGVLTGSKIDTKEQTFAQDAVDVTKDVPSEITTLMPPPLFQGMARFVGALRESF
ALFEDPRKWDKTHLASAATFEDALYIQTVLEAIRQSDKSGAWERVEPNLNLN

Nucleotide sequence

Length: 1,282

>Moocci.CG.ELv1_2.S658687.g31245.01.t
ATGGGTGTTCCATTCTCAACTTCTCATATAGATCAATTACTTCTCCAGCAAAAAGTTGAT
GTTGTATGTATCAACTCACCTCCTTTTTTACACTCACAAATTGCAGTTAAAACACTTGGT
ATAGGAAAAAATGTTCTTTGTGATCGACCAGCTGGGTTGGAACATAATGACACCGTTAAA
ATGATTGAAGCTGCCAGATACTATCCATCACTAATGTCATTAATGACCTATCACATGCGT
TTTCTTCCAACGTTTCGGACAATGAGATCAATGGTTGCTGAAAGATTTATTGGAAACATA
TTGATAATTGAAGTCCGTGTGCATTGCAATTTATCACAAAGTGACCGTTACAATTGGTCG
CATGATGACAGAATGGGTGGAGGAATATTAGCCATGTTTGGGAGCCATTTTGTTGACATT
GTTAGTTTTATAAGCACTCAAAAAGCTATAGATGTTCATGGACATTTACGAACCTTTCAA
AAATCTACTGATCATGTCAATGGTAAATTTTCTTATGAAGTTCTTGTAATTGGCAGTCAA
GGACAGCTAGTTGTAAAAGAGGGTGTCCTAACTGGATCCAAGATTGACACTAAGGAGCAG
ACATTTGCTCAAGATGCTGTGGATGTAACCAAAGATGTTCCTTCAGAAATAACAACTTTG
ATGCCTCCTCCATTATTTCAGGGTATGGCAAGATTTGTCGGGGCTTTAAGAGAGTCTTTT
GCACTGTTTGAGGACCCAAGAAAGTGGGACAAAACCCATTTAGCATCTGCAGCCACTTTT
GAAGATGCGTTATATATACAAACTGTTTTAGAAGCAATTAGGCAATCGGATAAAAGTGGA
GCATGGGAAAGAGTTGAGCCCAACTTGAATCTAAACTAATGTGATGAAATAAATAAATTA
AAATCACTGCTAATATTAATATACCTGTGACCTGTGTTAATATTAATATACATTTAAAAA
TAATCATTCATCTTTAAAAAACATTGATCTTGAAGCATACCGTACTTAATCTAATCTATT
CACTAAACACATTTAAAAAAATATTTCCAATTTAAATTATATGTCTAGTCTATTTCAACA
TCATTTTACATACAAAATTAGTAATCATTATTTTCTGCATTAGAATGTTTTTTTCTTATG
TAAAAATTTGTTTATATTATTTGTACTTTTATAATTGTTATTTATTGATGCATAACTAGA
TTTTGCATGATTGTACTGTTTTTTTTTATATATAATCTATGCAGTATATTTAATAATAGT
CCATCATATATATGAAATAACA

InterProScan

SUPERFAMILY	NAD(P)-bd_dom_sf (IPR036291) - T[2-107] 3.71E-21
Pfam	Oxidoreductase_N (IPR000683) - T[6-67] 1.8E-8

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
GFOD1_HUMAN	39.818 %	238	1.57E-76
GFOD2_HUMAN	37.879 %	223	5.43E-71