Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S34...'
  2. Transcript 'KH2012:KH.C12.325.v1...'
  3. Transcript 'KH2012:KH.C4.686.v1....'
  4. Transcript 'KH2012:KH.C8.109.v1....'
  5. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S65...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S653765.g30756.01.t

Possible name(s)

LMBRD2

Location

S653765 [638 / 2,786]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 715

>Moocci.CG.ELv1_2.S653765.g30756.01.p
MSVGPFILELLVVLLVSVLLLHHYGRISKQHPIVTVATLTSWYFSLIIIFVLPLDVSSAF
YRQCLSVNKPITPPTTAATTISSIVTTANNSNINMKRSVRSISEDSICKEPISHVPDMTL
KVMWRIVYWSSQCLTWVVLPFMQSYIYSGEFSTSGKIKHALIKNAVYYGTYLAIVIALLI
YVAANPKIRLDFTQLKVICITASNTWGLFLLILLLGYGLVEFPRSIWNAANPVVSIAYTQ
FKLAKLSTEKQEAIENLEDLLEEVKQISHSVRYNHPLRKYVNTIISKCPDEFQEKVSQGM
DDYEDYEDGNRNRTDIPSEKSLTKLHMKIIYAVQTKQRTTVQWNMNMNKALHLDNVLKNM
KQTANVWVDDELVTHKKGMLEKLICQPAVKWYWECVIRSILFKFLAVCLVIVSLMVIWSE
CTFFNASPVLSLFAIFLNKASANYNYFYIELASCLIISYMCVCAYYTVFRIKFFNYYYIA
GHHQTNEVSLMFVGIMLCRLTPPLCLNFLGLIHLDAHIATAAIGENETFYTQIMGHLVVI
PFISKGFNVYFPILVVVLCIATYFSLGHRCLSAIGFQQFISGNMNDEFTADLVEEGRQLV
NREKRRLQREFKSASRSNGFNSDSDGNIRTRQWKGRVMRDLDQSSSPPRKNDKFELLNDA
EPIDYSAINEDNQEVYTKDNKAQRNASRWASNSNWAPNSTRSYSNRPPSNIFDDI

Nucleotide sequence

Length: 2,148

>Moocci.CG.ELv1_2.S653765.g30756.01.t
ATGAGCGTTGGACCATTTATATTAGAACTTCTAGTTGTTCTATTGGTCTCTGTATTGCTT
CTACATCATTATGGCAGAATAAGCAAACAACATCCTATTGTAACAGTTGCTACACTAACT
TCATGGTATTTCAGTTTAATTATTATTTTCGTTTTACCACTGGATGTTTCAAGTGCATTT
TATCGACAATGTTTATCTGTTAATAAACCAATTACACCGCCTACAACAGCAGCAACAACT
ATTTCATCTATAGTCACAACTGCTAATAACAGCAACATTAATATGAAACGAAGTGTTAGA
AGCATTTCAGAAGATTCTATTTGCAAAGAACCAATTAGTCATGTTCCTGACATGACTTTA
AAAGTTATGTGGAGAATTGTTTATTGGTCATCACAATGCTTAACATGGGTTGTTTTACCA
TTTATGCAGTCTTATATTTATTCAGGTGAATTTTCTACATCAGGCAAAATAAAACATGCA
TTAATTAAAAATGCTGTTTATTATGGTACATATTTAGCTATCGTTATAGCTTTGCTCATT
TATGTTGCTGCTAATCCTAAAATACGATTGGATTTCACACAATTAAAAGTAATCTGCATT
ACTGCATCAAACACTTGGGGTTTATTTTTGTTAATTTTACTGCTTGGTTATGGATTGGTT
GAGTTTCCTCGGAGCATATGGAACGCTGCTAATCCAGTTGTATCTATAGCATATACACAA
TTTAAGTTAGCAAAACTTAGCACAGAAAAACAAGAAGCAATTGAAAATTTAGAAGATTTA
TTAGAAGAAGTTAAACAGATTAGCCATTCTGTACGATACAACCATCCCCTAAGAAAATAT
GTCAATACAATTATTTCTAAATGTCCTGATGAATTTCAGGAGAAAGTAAGTCAAGGAATG
GATGATTATGAGGACTATGAAGATGGCAATAGAAATAGAACAGATATTCCGAGTGAAAAG
TCATTAACAAAATTACACATGAAAATTATTTATGCTGTTCAAACAAAACAAAGAACGACA
GTTCAATGGAATATGAACATGAATAAAGCTCTGCATTTGGATAATGTATTAAAAAACATG
AAACAAACTGCTAATGTCTGGGTTGATGATGAATTAGTAACTCACAAAAAAGGGATGCTG
GAGAAACTTATTTGTCAACCTGCTGTTAAGTGGTATTGGGAATGTGTCATTAGATCCATT
TTATTTAAATTTCTTGCAGTTTGTCTGGTGATAGTATCCTTAATGGTAATTTGGTCAGAA
TGTACTTTTTTTAATGCTTCACCTGTACTGTCACTATTTGCTATATTTTTAAACAAAGCC
AGCGCCAATTATAATTATTTTTACATTGAATTAGCCAGTTGCTTAATTATATCATACATG
TGTGTATGCGCTTATTACACCGTATTTCGTATCAAGTTTTTTAATTACTATTATATCGCT
GGTCACCATCAAACAAATGAAGTAAGTTTAATGTTTGTGGGTATAATGCTGTGCCGTCTC
ACACCTCCATTATGTCTCAATTTTCTTGGTTTAATTCACCTGGATGCACACATTGCTACT
GCAGCCATTGGAGAAAACGAAACATTTTACACACAAATAATGGGCCATTTAGTTGTGATC
CCTTTTATATCAAAAGGATTTAATGTTTATTTTCCAATTTTGGTTGTGGTTTTATGTATA
GCAACTTACTTTAGTTTGGGCCACCGATGTCTCTCTGCGATTGGGTTTCAGCAGTTTATT
AGTGGAAATATGAATGACGAGTTTACTGCAGACTTAGTGGAAGAAGGTCGTCAATTGGTT
AACAGGGAAAAGCGAAGACTCCAGCGAGAGTTTAAAAGTGCAAGTCGATCGAATGGGTTT
AATTCTGATAGCGATGGAAACATAAGAACGAGACAATGGAAAGGTAGAGTAATGAGAGAC
TTGGACCAATCGAGTAGTCCTCCACGTAAAAATGACAAATTTGAACTTTTAAATGATGCT
GAACCAATAGATTACAGTGCAATTAACGAAGACAACCAAGAGGTTTATACAAAAGACAAC
AAGGCGCAAAGAAACGCTTCTCGATGGGCAAGTAATTCGAATTGGGCACCAAATTCAACT
CGGAGTTACTCTAACCGACCACCTAGTAATATATTTGACGATATATAG

InterProScan

Pfam
LMBR1-like_membr_prot (IPR006876) - T[1-567] 7.8E-169

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
LMBD2_HUMAN 44.624 % 612 0