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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S64...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S648250.g29921.01.t

Possible name(s)

SLC12A2; SLC12A6; SLC12A9

Location

S648250 [9,899 / 15,983]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 676

>Moocci.CG.ELv1_2.S648250.g29921.01.p
MAGANMSGELKNPSRSIPVGTIAACAITFFVYMILIILISASTPRKLLECDYSFLTTINV
WQPFVAIGVFLSSISATLSSFIGASRILLALARDEVFGFLLNPITKTTSGGNPYVAVLVT
WLLIQLVLFAQKVNVIAPVVTIFFLFAYAAVDMSCLALDWASAPNFRPTFKYFTWYTSLL
GILSCVVMMFLIEPIYTTVSFAVLVILVVVIHYRAPTTSWGYISQALIFHQVRKYMLMLD
VRKEHVKFWRPQILLMVKNPRTSCQFIDFINSIKKSGLYVLGHVSLGHLGDMKRDLLQVQ
HEHWLNLVDALGIKAFVELTLSNSVREGTEHLLRISGLGGMKPNTLVMGFYDDSPQVDTF
QEMSIFKEPFSVTDRPASALSNSSGEPHNDSANYFPLVCNDEKRLSAEEYVAILVDAIKL
RKNICLGRSFAKLNKNELIRLRKTPETMKYIDVWPVNFLYPVLSQFHQQGQNNPVRSPST
VDVGSLALTDTSSFDVTSVFLMQMACILNMVHFWKRNTKLRINLCSNENMQQNDSSFEKL
KDFLKNVRIKAEIRNVEWHQTNLLPLPQEGRKMASVIPNISNIQSDGGSSCSYDIHSSSA
SVLGEDPESINRYLEDVNTLLKNNVTSSAVTFLYLPAPPHAENQHVDYLSMLTRISDNLG
PVLFVYGLSDVVSTSL

Nucleotide sequence

Length: 2,670

>Moocci.CG.ELv1_2.S648250.g29921.01.t
GATATCTATAGAATAATCTTAGCATTATGTTTAAGTTACTTTACTGTGTTGCGTAAAATA
ACAACTTTAAATAAACTACAAAATTAATTGAATAAATTTGGCACTATAGCAAACTTTACT
GTGGACTACTCAAACAGCAATAAACCAACGTCATTTGTGGTTGTGTTTGCTGTTTTGTTT
AACGGATGCACAGGGATCATGGCAGGTGCCAACATGTCAGGAGAACTTAAGAATCCCAGT
CGATCTATTCCTGTTGGAACCATTGCTGCTTGTGCAATCACATTCTTTGTTTACATGATC
CTAATAATACTTATAAGTGCATCCACACCCAGAAAACTTCTGGAATGTGATTACAGTTTT
TTAACCACCATTAATGTATGGCAACCTTTTGTCGCTATTGGGGTTTTTCTTTCATCCATT
TCGGCTACCCTTAGTTCGTTTATTGGAGCGTCAAGAATTTTGCTGGCATTAGCAAGGGAT
GAAGTTTTTGGTTTTCTACTGAACCCAATCACTAAAACTACATCTGGTGGAAATCCTTAT
GTTGCTGTTCTTGTTACATGGCTGCTCATACAATTGGTTCTTTTTGCACAGAAAGTAAAT
GTTATAGCTCCTGTTGTCACTATATTCTTTTTATTTGCATATGCAGCTGTGGACATGTCT
TGTCTTGCTTTGGATTGGGCATCAGCACCTAATTTCAGACCAACATTCAAGTATTTTACT
TGGTACACATCGCTATTAGGTATACTCAGTTGTGTGGTGATGATGTTTTTGATTGAACCA
ATCTATACTACAGTAAGCTTTGCAGTTTTGGTTATACTGGTTGTTGTGATACATTATCGA
GCACCTACTACCTCTTGGGGTTACATATCTCAAGCCCTAATTTTTCATCAGGTTAGAAAG
TATATGTTAATGCTGGATGTGAGGAAGGAACATGTGAAATTTTGGAGGCCACAAATTCTT
CTTATGGTTAAAAATCCCAGAACTTCATGCCAATTTATTGACTTCATAAATTCTATTAAA
AAATCAGGATTGTATGTTCTTGGACATGTTAGCCTGGGCCATCTTGGAGACATGAAGCGC
GATCTACTGCAAGTCCAGCACGAACACTGGCTTAACTTGGTGGATGCGCTTGGTATTAAA
GCTTTTGTGGAACTCACCTTGTCAAACTCGGTTAGAGAAGGAACGGAACATTTGCTTAGA
ATTTCTGGTCTGGGAGGCATGAAGCCAAATACATTGGTAATGGGTTTTTATGATGATTCT
CCACAAGTTGACACATTTCAAGAAATGTCCATATTTAAAGAGCCTTTTAGCGTCACAGAT
AGACCTGCATCCGCATTATCAAATTCTTCTGGTGAGCCACACAATGATTCTGCCAATTAC
TTCCCACTTGTGTGCAATGATGAAAAACGGCTATCAGCAGAAGAGTATGTTGCAATATTA
GTTGATGCAATTAAACTGAGAAAAAATATTTGCCTTGGAAGGAGTTTTGCAAAGCTAAAT
AAAAATGAATTGATCCGGCTCCGAAAGACCCCAGAAACCATGAAGTATATTGATGTTTGG
CCAGTTAACTTTTTGTATCCAGTGCTTTCACAGTTTCACCAGCAAGGCCAAAACAATCCT
GTACGTTCACCAAGTACTGTGGATGTGGGTAGCTTGGCACTTACTGATACATCCAGTTTT
GATGTCACTAGTGTATTCTTGATGCAAATGGCCTGTATTTTAAATATGGTACATTTTTGG
AAAAGGAATACGAAATTACGTATTAATTTATGCAGTAATGAAAATATGCAACAAAATGAC
AGCAGCTTTGAAAAGTTGAAGGATTTTTTAAAAAATGTTCGAATAAAAGCTGAAATTCGT
AATGTGGAATGGCATCAAACAAATTTGCTACCATTACCTCAAGAGGGTCGGAAAATGGCA
TCAGTTATTCCTAACATTTCAAATATACAATCGGATGGCGGTTCCTCATGTTCCTATGAT
ATACACTCCTCATCAGCATCCGTACTAGGGGAGGATCCGGAATCAATAAATCGTTATTTA
GAGGATGTTAACACATTACTGAAGAACAATGTTACGAGTTCGGCCGTGACATTTCTTTAC
CTGCCCGCACCACCACATGCCGAAAATCAGCATGTTGATTACCTTTCTATGTTGACAAGA
ATATCAGATAATTTAGGACCAGTTCTATTTGTATATGGACTATCTGATGTTGTTTCGACT
TCACTGTAAAATGCCGTATTTGGTATGGCTTTAGTATTAAATTGTTCACTTTTGTATCAT
CAATTTATATTTATGAATTTACTTATGACTTTTATTGTTACCTATTCCCACATTACATTA
CATTACTATAATTGTTTTTATTACAACGGCCATAAAGCTGAATTTCATTAATAATTTCGT
ATCTGTCATTTTCCACCAAATCTATGGATCTATATGCTTTGTATTTTTTGTTAATAAGTA
AGCTGTATTTATGACAGAATATTTTTATTTTACCTTTAAAAGTGCAATATCATTTATATT
CCGCTAATAAAAAAATTTTCTGTTTGCATTAATATTGTGATTTCCTAATGTAATGTTCAT
CACCTGTTTTACTGCAGTTGCTGTGTTGTAAACGTTGGGTGCTAATTCATTCAAATGGTC
GTTTGTCCACCAATAAAAATATTGCCTAAG

InterProScan

Pfam
AA-permease/SLC12A_dom (IPR004841) - T[1-254] 3.1E-46
PANTHER
SLC12A9 (IPR030345) - T[1-674] 4.5E-226
Pfam
SLC12_C (IPR018491) - T[266-353] 7.4E-14

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S12A9_HUMAN 43.343 % 543 0
S12A2_HUMAN 27.638 % 191 6.13E-51
S12A6_HUMAN 30.982 % 192 1.55E-51