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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S64...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S647703.g29829.02.t

Possible name(s)

SLC6A11; SLC6A13; SLC6A6

Location

S647703 [51,145 / 56,839]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 690

>Moocci.CG.ELv1_2.S647703.g29829.02.p
MMEMQTGGLGYDTVCDKIDDTEFDDEKYLVSISTTESSNQTTISIKQTTNVSSFKMDENK
VSSNDINENTSSRDKWKKKIDFAFSIAGGFVGLGNVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYVIFVC
VGALPVFFLEVTVGQYTNLGGMLAWKIAPVMTGVGVACNIINYYLNVYYAVILAWSLRYF
FASMAKELPWSTCGNSWNNEDCFVFGTKKSLNITSASLVAKSLNNSIVDGITNNVITFEN
STKRVSSVLQYWQRGVLGVSGGIEQIGEVKWQLLLCLMLTWIVIYFCIWKGIGWTSKVVY
FTATFPLLMMMVLLVRGLTLDGAIDGVVFYLKPDFKRMADVQVWLDAATQVFYSYALCKG
MLVTMGSYNKYHYNSYRDCIFLSVLNSGVSFISGFAIFSVLGFMAKEQNVEVKDVVASGP
GLAFIAYPKALTMLPLPQFWGCLFFFMLFLLGLDSEFVGQETLMSALVDLKPNFFKKPWR
REIALAFLSLSQFLLGVIMVTEGGVYYFNIFDNYAAAGWCLLFISFCEVIAVSWIFGINK
FWDRVCEMVGFKPFPWFKWCWLIISPISITGLFIFSIMYYKPLRYNKTYIYPTWGLVLAW
MLALSSMLWVPGVAIYKFATANGSLQQRWDEVTTSKFDDTKRAGKQIYEPLSTIGEIEKI
VEMQQTMQNQVEADETPMYDEVIKAEKMAT

Nucleotide sequence

Length: 2,636

>Moocci.CG.ELv1_2.S647703.g29829.02.t
ATGATGGAGATGCAGACAGGAGGACTTGGTTATGATACTGTGTGTGATAAGATTGATGAT
ACCGAGTTTGATGACGAAAAATACTTGGTGAGCATTTCCACAACGGAATCAAGTAATCAA
ACAACTATATCGATAAAACAAACTACAAACGTCTCCAGTTTTAAAATGGATGAAAATAAA
GTAAGCAGTAATGATATAAATGAGAATACATCTTCTCGGGATAAATGGAAGAAGAAGATT
GATTTTGCTTTTTCCATAGCTGGAGGATTTGTAGGACTTGGAAATGTTTGGAGATTTCCT
TATCTTTGTTATAAAAATGGAGGGGGTGCTTTTTTAATTCCATATGTTATATTTGTATGC
GTTGGTGCTTTGCCAGTTTTTTTCTTGGAGGTTACTGTTGGACAATACACCAACCTTGGA
GGAATGTTAGCTTGGAAAATAGCACCTGTTATGACGGGAGTTGGAGTAGCATGTAATATT
ATCAATTACTACTTGAACGTTTATTACGCCGTTATTCTTGCATGGTCACTCCGGTATTTC
TTTGCTTCTATGGCAAAAGAACTTCCGTGGTCTACTTGTGGAAACTCGTGGAATAATGAA
GATTGCTTTGTGTTTGGAACCAAGAAATCTCTCAATATTACTTCTGCTTCTTTGGTGGCC
AAGTCTTTAAATAATTCTATCGTGGATGGAATCACCAACAATGTGATTACATTTGAAAAC
TCGACAAAAAGGGTATCATCTGTATTGCAATATTGGCAACGAGGAGTACTGGGAGTTTCT
GGAGGAATTGAGCAAATCGGAGAGGTCAAATGGCAGCTTCTATTGTGCCTGATGTTGACC
TGGATTGTGATATACTTTTGCATTTGGAAGGGAATTGGTTGGACTAGCAAAGTGGTGTAC
TTCACTGCGACCTTTCCCCTTCTTATGATGATGGTCCTTTTAGTAAGAGGTCTGACATTA
GATGGAGCTATCGATGGTGTAGTGTTCTATCTCAAGCCTGATTTTAAACGTATGGCTGAT
GTTCAGGTATGGTTGGACGCAGCAACTCAAGTATTTTATTCTTATGCTCTATGCAAAGGA
ATGTTGGTAACAATGGGGAGTTATAACAAATACCATTACAACAGCTACAGGGACTGTATA
TTTCTCTCGGTATTGAACAGTGGCGTGAGTTTTATATCGGGATTTGCAATATTTTCTGTA
CTTGGGTTTATGGCAAAAGAGCAAAATGTTGAAGTGAAGGATGTGGTTGCGTCGGGACCG
GGACTTGCTTTTATTGCTTATCCGAAAGCTCTTACAATGCTTCCATTACCTCAATTCTGG
GGATGTCTTTTCTTTTTCATGTTGTTTTTGTTGGGACTTGACAGTGAATTCGTCGGACAA
GAAACGCTAATGAGTGCTTTGGTTGATTTAAAGCCAAATTTCTTCAAAAAACCATGGCGT
CGAGAAATAGCTTTGGCGTTTTTAAGTCTTTCACAATTCCTTCTTGGTGTAATTATGGTG
ACTGAGGGAGGAGTGTATTACTTTAACATATTTGATAACTACGCTGCGGCAGGGTGGTGC
CTCCTATTCATTAGCTTCTGTGAAGTAATCGCTGTTTCCTGGATATTTGGAATCAATAAA
TTTTGGGACAGGGTTTGTGAAATGGTCGGCTTTAAGCCTTTCCCATGGTTTAAATGGTGC
TGGCTCATTATATCACCTATTTCAATTACTGGTTTGTTCATATTCAGCATAATGTACTAT
AAACCTCTTCGCTATAACAAAACTTATATTTATCCGACCTGGGGTTTGGTGCTTGCGTGG
ATGTTAGCTCTTTCGTCGATGCTTTGGGTTCCAGGCGTGGCCATTTACAAATTTGCTACC
GCTAATGGGTCATTACAACAGAGATGGGACGAGGTTACTACGTCAAAATTTGACGACACT
AAAAGAGCGGGAAAACAAATTTACGAACCTTTGAGCACAATTGGTGAAATTGAGAAAATA
GTTGAGATGCAGCAAACGATGCAGAACCAAGTTGAGGCCGATGAAACACCAATGTACGAC
GAAGTGATAAAAGCAGAAAAAATGGCAACTTAAATGATTTTTAATAACTTCTTCTTGTAC
ATTACATTTTTTACAAGAATTTTGCTTTTCATTTCCATTTTTACTACATTTTTTCATATA
AACATTATTTACTTTCATATAAAAATGAATGTCGTTATTGTTTCAATTGATTGTTTAGGT
AATGATTGTAAGTTTGTTTTAAGCGTCGTTCACACGGTATTAACAACGTAGTGCAAGGGT
TTTACTACGTTTGTTTTTAATTGTGTCGCTCACACGTGAGTATATAGTGCTTGGTAGACT
TCGTAAAACTGTGTAAACTTGTGCAATAGCCAAGATTACGCAAGCCCCTTAAGTTACCAC
AGAAAAATTCCGTGAATCTTGCGTAATATTCTTGAGTTAATACGTTGCAAACTTTGGGTG
AACGGCGCTTTATAAACAAATTTTCTGTTCAGCTAAGTTAGCCGAATAAAAGTATACATA
CATTCCATTGTGACTGTTTTATTGCTTCATTTTCGCTTGTATTTTTAATTCATATTTGTA
AATTTTTACCCAAGATATTTGGCTCAATAAATTTTAAACTATTTGGCTTAATAAAA

InterProScan

PANTHER
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[56-642] 1.6E-263
ProSiteProfiles
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[72-623] 100.443
Pfam
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[73-619] 1.7E-203
SUPERFAMILY
SNS_sf (IPR037272) - T[73-202] 1.96E-166 - T[246-618] 1.96E-166
PRINTS
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[81-102] 1.8E-72 - T[110-129] 1.8E-72 - T[153-179] 1.8E-72 - T[298-315] 1.8E-72 - T[380-400] 1.8E-72 - T[434-453] 1.8E-72 - T[518-538] 1.8E-72 - T[558-578] 1.8E-72
ProSitePatterns
Na/ntran_symport (IPR000175) - T[97-111] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
S6A12_HUMAN 48.562 % 590 0
S6A13_HUMAN 48.586 % 616 0
S6A11_HUMAN 47.126 % 598 0