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  1. Transcript 'KH2012:KH.C12.200.v1...'
  2. Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S903...'
  3. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S63...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S638660.g28489.01.t

Possible name(s)

SLC10A1; SLC10A2; SLC10A4

Location

S638660 [2,408 / 5,111]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 449

>Moocci.CG.ELv1_2.S638660.g28489.01.p
MNLTSKINATYGSRLISENASFLINDVGLNGREVSRINIFEDIQIPMLDNSNASEKAINS
AITFLSVAVLLEVMLGMGCSVDLTDLKEHLKKPIGVLAAAITQFGLMPLIAFGLSKGLHL
GAVPAIATLLTASVPGGSLSNILTYLAKGDMSLSMLMTTVSTLLALGFIPLNLFLYGSAY
LPADKNATSIVPFPAIIVSFVIMLLPMSLGIFLHKKFPQITRKVMLACKIMLLLTLTTLV
ILSCFLYGIQLLIIMPKELWLISSTMPIIGYCIGFALSTVGGMRGDARRTVAIEAGCQNC
QLSVAILKVAFPAQVIGSYFLFPFIYAMFQFIEGFLMILVTRLFLQTSCSRENSSVVFGN
EHKRTFSTQKLYDAIKISFWKNNIAEDKENIIKNNEDILEDEKPNLQPTAFVNKAVSELN
ETPNKFSAAGKKNSCESTSIVNTQQTRKF

Nucleotide sequence

Length: 1,798

>Moocci.CG.ELv1_2.S638660.g28489.01.t
CCTGCGTATAATCCGCTGCAATAACAGGTAGTTATAAACATCATAGCTTCCTTTCATAGC
TAAACGTTTTAACTTATAGAAAAGAACAAGAATGTTATTATTCAATCCTAGTGTTTAGTC
AGTTTATTTGAATAGATCTGTTTGAATAGATCTTTAAGTTTCTATAGAGAGTTAAACATA
TATGTTGAACATTTATAGTTAGCGTTTATGTAAGCTATTAACATAAAAAGACAAGAAATA
TATGTATAATTATGAATTTAACGTCGAAAATCAACGCAACGTATGGGAGCAGATTGATTT
CTGAAAATGCCTCTTTTTTAATAAATGACGTGGGTTTAAATGGTAGAGAAGTTAGCAGAA
TTAATATATTTGAAGATATTCAAATTCCAATGTTGGATAATTCAAATGCATCGGAAAAAG
CCATTAATTCTGCAATCACGTTCCTCTCAGTGGCTGTTTTGTTGGAAGTAATGTTAGGAA
TGGGTTGTTCTGTGGACTTAACGGATTTGAAAGAACATTTAAAGAAACCGATTGGAGTTT
TGGCAGCAGCAATAACACAATTTGGTTTAATGCCACTGATCGCGTTTGGACTTTCAAAAG
GTTTACATCTAGGCGCTGTCCCCGCTATAGCTACCTTGTTAACCGCCAGTGTTCCCGGAG
GAAGTTTATCAAATATATTAACTTATTTAGCTAAAGGCGATATGTCACTTAGCATGTTAA
TGACAACGGTATCAACGCTTCTGGCGCTTGGGTTTATACCATTGAATTTATTTCTGTACG
GCTCTGCTTATTTACCAGCTGATAAAAACGCTACGTCCATTGTGCCGTTTCCCGCAATAA
TTGTGTCTTTTGTGATAATGCTACTACCCATGTCCCTCGGAATATTTTTACATAAAAAAT
TTCCACAAATTACCAGGAAAGTGATGTTGGCTTGCAAAATCATGTTGCTTCTAACTTTGA
CGACACTTGTGATATTATCATGTTTTCTGTATGGAATACAATTACTAATCATAATGCCAA
AAGAGCTTTGGTTAATTTCATCCACAATGCCAATAATAGGGTACTGCATCGGATTTGCCT
TATCTACAGTCGGAGGTATGCGAGGAGATGCAAGAAGAACAGTTGCTATAGAAGCAGGAT
GTCAAAACTGTCAGTTAAGCGTCGCTATCCTTAAAGTTGCATTTCCAGCGCAAGTTATCG
GGTCGTACTTTTTGTTCCCTTTTATATACGCGATGTTTCAATTTATCGAAGGTTTCTTAA
TGATTCTTGTGACAAGACTTTTCTTGCAAACATCTTGTAGCAGGGAAAATTCGAGTGTTG
TTTTTGGTAATGAACACAAAAGAACATTTTCCACACAAAAGCTTTACGATGCTATAAAAA
TAAGTTTTTGGAAAAACAATATCGCCGAGGATAAAGAAAACATTATCAAAAACAACGAAG
ATATATTGGAAGATGAAAAACCGAATTTACAACCTACCGCATTCGTGAACAAAGCAGTAA
GCGAATTAAATGAAACACCTAACAAGTTTTCTGCAGCAGGAAAAAAAAATTCATGTGAAA
GTACCTCTATTGTTAATACACAACAAACACGTAAATTTTAAAACAATTTTAAAACGAATG
ATGTGTGTTTAAGTGCAATAAATACATATAGGTCTATCTGTAAGTTATCAATAAATTTAT
TTTATGTTGAATATTTCTTTATTATTCTGTTGTAATATTAGCATCGATTAACATCAATTC
TGTGTGTCAATAATTCCTATGTAAATAATCCCTGGAAACTAAAAAGGTTTTACCCCGA

InterProScan

PANTHER
SLC10A1 (IPR030208) - T[49-355] 3.3E-94
PANTHER
Bilac:Na_transpt (IPR004710) - T[49-355] 3.3E-94
Pfam
BilAc:Na_symport/Acr3 (IPR002657) - T[69-244] 7.1E-30

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
NTCP_HUMAN 37.785 % 213 1.75E-65
NTCP2_HUMAN 33.775 % 177 1.83E-51
NTCP4_HUMAN 37.586 % 186 3.64E-54