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Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S637148.g28240.01.t

Possible name(s)

DNMT1; KDM2B; TRDMT1

Location

S637148 [15,401 / 20,021]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,358

>Moocci.CG.ELv1_2.S637148.g28240.01.p
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NMQDLNSGSPCPKKAKITSPTKTDKTENNSNISVPFTSTMKCKQCRQLLEEVEMFPGDTS
DASEEFIALTHESLSLFMGNEETGRPQHKITNFCVYDKNTHICSFDSGLIEKNIELFFSG
VIMPVYEENMALENGVYGTRLGPINEWWTAGFDGGEKALVGFSTAFADYILVDPNPCYAN
CWNTVQEKIYMSKIVIEFLCDNEAAVYEDLLNYVENAVPPESLGLQRFTEDSLLRHAQFV
CEQVESFDDARNENDDLLMANPCMRDLIHLAGVTIGRRKAARKRVVQEKKVVKASSTKAT
TTPLVASVMERFFQGTVEIKSFKAKLKRCGACENCLQPNCGECSSCKDMKVFGGSGKSKQ
ACLKRKCSNMIYADEVDEADPDEGTDTEKETKKHKSSKPKHPKLLSPKNQSGRKIKWTSE
STKTENKKVYYEEVSIGLLKVSVGDFVSVKPEDSTRPLCVGKVCSFWEESDNIKMMHIDW
FLRSCDTILGETGDTAELFLADDCETTEVEFISNKVDVLYKKPGNDWHMIGGEEKSMKGF
SDYDGETEFFYQKWYEPEFARFEDPPELIKNYDCQSCAREELKSYNETPQLGEQINSENG
KIYYSSVKLNNILYEVGNSIYLPVESYEFDATIDEETKKSKKNKAIDEVKYPEMYRKSTK
YVKGSNLSVPDPFKIALIKSIFKSNKGKEIKMKVNKFYRPENTHKGPSFGFNLDLNLLYY
SEESATVNFSEVKGKCHVQCEFDINTSLKEYTDGGPDRFYFSEMYDAKTKTFDDPPISAR
RLGKKTVTKEKVKMTKKKIKESKTEIKDENVPKFAKLKTLDVFAGCGGLSEGFHQAGVAE
SKFAIELWEPAAQAYKLNNPGATVFTEDCNVLLEQVMSGMEKNKNGQRLPQKGDVELLCG
GPPCQGFSGMNRFNSREYSKFKNSLVVSYLSYCDYFRPKFFLLENVRNFVSFKNCMVLRL
ALASLIKMGYQCTFGILQAGHYGVAQTRRRAIILAAAPGEKLPFYPEPLHTFSLRSGSLS
AQVDDIRYTSNITRLNSAPFRTITVRDTMSDLPSIKNGHSKAEMPCDIDNRSHFQRMISG
GCTQPVIRDHICKDMSPLVEARMRYIPLTPGSDWRDLPNIQVKLSDGNMTKLLRYTSHDK
KQGKSGTGALRGVCACAEGEPCDPMDRQFNTLIPWCLPHTGNRHNNWAGLYGRLEWDGFF
STTVTNPEPMGKQGRVLHPEQNRVVSVRECARSQGFPDTYRFYGTVLDKHRQVGNAVPPP
MAKAIGSEIKKCLIAKVKSMEESTEKSPTQSSDIKEEN

Nucleotide sequence

Length: 4,532

>Moocci.CG.ELv1_2.S637148.g28240.01.t
ATGTTGGGTGAATCTGAAAATATACAGTCTGTTTTAAAAACAAATGAAAAAGAACCAAGT
ACATCGAAAAAGTTAATCTCACCAAAATCAAAACAAGCAAATTTACTTGATATGTTTTCG
CGTCAGACAAAGAGACGAAAATCTGAAGGTAAAGAAAACATTGACTTAAATGAAAAGTCA
AATATGCAAGATCTAAACAGTGGATCACCATGCCCAAAGAAAGCCAAAATAACTAGTCCT
ACTAAGACTGACAAAACAGAAAATAATTCCAATATTAGTGTACCTTTTACAAGCACCATG
AAATGTAAGCAATGTCGACAGTTGCTTGAAGAAGTTGAAATGTTTCCAGGAGATACCAGT
GATGCTTCAGAGGAATTTATTGCACTAACACATGAATCACTTTCTCTTTTTATGGGAAAT
GAAGAAACTGGAAGACCTCAACATAAAATAACAAATTTTTGTGTATATGATAAAAATACC
CATATTTGTTCATTTGATTCAGGTTTAATAGAAAAAAACATTGAACTTTTCTTTAGCGGA
GTTATTATGCCAGTATATGAAGAAAACATGGCTTTAGAAAATGGTGTTTATGGAACTCGA
TTAGGGCCAATAAACGAATGGTGGACGGCTGGTTTTGATGGTGGAGAAAAAGCTCTTGTT
GGGTTTTCCACAGCATTTGCTGATTACATTTTAGTTGATCCTAATCCTTGCTATGCAAAC
TGTTGGAACACAGTGCAAGAAAAAATTTATATGAGTAAAATTGTTATAGAATTTTTGTGT
GATAATGAAGCAGCTGTATATGAAGACTTATTGAACTATGTTGAAAATGCAGTTCCGCCA
GAATCCTTAGGCCTTCAGAGGTTTACAGAGGACTCCTTGCTCCGACATGCACAGTTTGTT
TGTGAACAAGTTGAATCATTCGATGATGCTAGGAATGAAAATGATGATCTACTAATGGCA
AATCCTTGTATGCGAGATTTGATACATTTAGCTGGAGTTACTATAGGAAGAAGAAAAGCA
GCAAGAAAACGAGTTGTTCAGGAGAAAAAAGTTGTCAAGGCTTCATCAACAAAAGCCACA
ACTACACCACTTGTTGCTTCAGTAATGGAAAGATTCTTTCAAGGTACAGTTGAAATTAAA
TCTTTTAAAGCAAAACTTAAAAGGTGTGGCGCTTGTGAGAACTGTTTGCAACCGAATTGT
GGTGAATGTTCCTCATGCAAAGACATGAAAGTATTTGGCGGTTCTGGTAAGTCCAAGCAG
GCTTGCTTAAAACGTAAGTGTTCTAATATGATTTATGCTGACGAAGTGGATGAAGCTGAT
CCAGATGAAGGAACTGATACAGAAAAGGAGACAAAGAAACATAAATCTTCTAAGCCAAAG
CATCCCAAATTACTTTCACCAAAAAATCAATCAGGTAGAAAAATAAAATGGACAAGTGAA
AGCACTAAAACTGAAAATAAGAAAGTGTACTATGAAGAAGTTTCTATTGGATTACTAAAA
GTAAGTGTAGGGGATTTTGTTTCAGTAAAACCAGAAGATTCTACAAGACCTCTGTGTGTT
GGGAAAGTTTGTTCATTTTGGGAAGAAAGCGATAACATTAAAATGATGCACATTGATTGG
TTTTTACGTAGTTGTGATACAATTCTTGGTGAAACGGGAGATACTGCTGAACTATTTTTA
GCTGATGACTGTGAAACTACTGAAGTAGAGTTTATATCTAACAAGGTAGATGTGTTATAC
AAAAAACCAGGCAATGACTGGCATATGATAGGTGGCGAAGAAAAAAGCATGAAAGGGTTT
AGTGATTATGATGGAGAAACAGAGTTCTTCTACCAAAAATGGTATGAACCAGAGTTTGCT
AGATTTGAAGATCCTCCAGAATTGATTAAAAATTATGATTGCCAGTCTTGTGCAAGAGAA
GAACTTAAAAGCTATAATGAAACTCCTCAATTAGGAGAACAGATTAATTCTGAAAATGGT
AAGATTTATTATTCATCTGTAAAATTAAATAACATACTATATGAAGTTGGAAATTCTATT
TACCTTCCTGTGGAATCTTATGAGTTTGATGCAACCATAGATGAAGAAACGAAAAAGTCG
AAGAAAAATAAAGCTATTGATGAAGTGAAATACCCAGAAATGTATAGGAAATCTACAAAG
TATGTCAAAGGAAGTAATCTATCAGTACCAGATCCTTTTAAAATTGCACTTATTAAATCT
ATATTTAAAAGCAACAAGGGTAAAGAAATTAAAATGAAAGTTAATAAATTTTATAGGCCT
GAAAATACACACAAAGGACCATCGTTTGGTTTCAATCTTGACCTGAACTTATTGTATTAT
AGTGAAGAATCTGCAACTGTAAATTTTTCGGAGGTAAAAGGAAAATGCCATGTTCAGTGT
GAATTTGACATTAACACATCTCTTAAAGAGTATACAGATGGTGGACCTGATCGATTTTAT
TTTAGTGAAATGTATGATGCTAAAACAAAAACTTTTGACGACCCCCCTATTTCTGCTCGA
AGATTAGGTAAAAAAACAGTGACCAAAGAAAAGGTAAAAATGACGAAAAAGAAAATTAAA
GAATCAAAAACTGAAATAAAAGACGAAAATGTTCCAAAATTTGCTAAACTTAAAACATTA
GACGTTTTTGCTGGTTGTGGAGGGTTGTCTGAAGGGTTTCATCAGGCTGGTGTAGCTGAA
TCAAAGTTTGCCATTGAGCTTTGGGAACCAGCTGCACAAGCATACAAATTAAATAACCCT
GGTGCCACTGTATTTACTGAAGACTGTAATGTATTATTGGAACAAGTAATGTCTGGTATG
GAAAAGAATAAAAACGGACAAAGATTACCTCAAAAAGGTGACGTTGAATTGCTATGTGGT
GGACCTCCTTGTCAAGGCTTTAGTGGAATGAATAGATTTAACTCGAGAGAATATTCAAAG
TTTAAAAATTCATTGGTAGTTTCATATTTGTCTTACTGCGATTATTTCAGACCAAAATTC
TTCTTGCTAGAGAATGTAAGAAATTTTGTATCATTTAAAAATTGTATGGTCTTAAGGTTA
GCTCTTGCTTCCTTGATAAAAATGGGATATCAATGCACTTTTGGTATTCTACAGGCAGGG
CATTATGGGGTTGCTCAAACTAGACGAAGGGCAATTATTTTAGCTGCTGCCCCAGGTGAA
AAATTACCATTTTATCCTGAACCTCTGCACACATTTTCTCTTCGCAGTGGGTCATTAAGT
GCACAAGTGGATGACATTAGATATACAAGTAATATTACAAGATTGAATTCTGCCCCCTTT
AGAACTATTACTGTCCGTGACACTATGTCTGATTTGCCAAGCATCAAAAATGGACATAGT
AAAGCGGAAATGCCTTGTGATATTGATAACCGAAGTCACTTCCAAAGAATGATTTCAGGA
GGGTGCACTCAACCAGTAATTCGAGATCACATATGTAAGGATATGTCTCCACTTGTTGAA
GCTAGAATGAGATATATTCCCCTAACACCTGGTTCAGATTGGAGAGACTTACCAAATATT
CAAGTAAAATTATCTGATGGAAATATGACAAAGCTTTTACGATACACAAGTCATGATAAG
AAACAGGGCAAAAGTGGTACAGGTGCATTAAGAGGTGTTTGTGCATGTGCTGAAGGTGAA
CCATGTGATCCAATGGATCGCCAGTTTAATACATTAATACCATGGTGTCTTCCCCACACT
GGAAATCGTCACAATAACTGGGCTGGTTTATATGGTAGACTTGAATGGGATGGATTCTTT
AGTACTACAGTAACTAACCCAGAACCTATGGGAAAGCAGGGTAGAGTATTACACCCTGAA
CAAAACCGTGTTGTAAGTGTCAGAGAATGTGCAAGATCTCAGGGATTTCCTGACACTTAT
CGTTTTTATGGAACTGTTTTGGACAAGCATAGACAAGTTGGAAATGCTGTTCCACCGCCG
ATGGCTAAAGCCATTGGTTCAGAGATTAAAAAATGTTTAATAGCAAAAGTAAAATCAATG
GAGGAAAGTACAGAAAAATCTCCAACTCAAAGTAGCGATATTAAAGAAGAAAATTAAATA
ATACTTTATTTTCAATATTTTATTTTGTGTTTATTCTATTCTATTTAGTACATTGTTTGT
TACATATATATTGGATATGCCTCAATGTAAAAAGTTTATTATTGTTAAGCATACTTGTAA
TAATGTTCAAATTTGTAGTGCTGTTTGTGAGCCATTAAACAATCATAAACTGTTTTGATC
TAATAATATTCAGAGTTAGATGAATATTATGTTAGTGAAATACATTTGAACCTTCTATTT
TCTACATAGTGAAATTATAATAGCCAGTAATATTTAGTTTCATAACATCGCTAGATAACA
ATTTAAAAAAAAAACATTGGATAAAAACTTTTACGCAACTGACTATATAGCAGAAGTTTT
TTTATACATTTATACTTACAAAGAAATATTTTTTATATGGAATGATACAAATTATAATAA
TATGTAAAATAATACTGGTTGTGATATTCCTC

InterProScan

PIRSF
DNMT1-like (IPR017198) - T[4-1356] 0.0
Pfam
Cytosine_MeTrfase1_RFD (IPR022702) - T[143-275] 1.2E-39
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Znf_CXXC (IPR002857) - T[381-428] 13.037
Pfam
Znf_CXXC (IPR002857) - T[385-427] 1.5E-12
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BAH_dom (IPR001025) - T[499-626] 1.7E-21 - T[672-836] 6.5E-18
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SUPERFAMILY
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PRINTS
C5_MeTfrase (IPR001525) - T[878-894] 4.0E-15 - T[997-1011] 4.0E-15 - T[1043-1056] 4.0E-15
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ProSitePatterns
C5_DNA_meth_AS (IPR018117) - T[956-968] .
ProSitePatterns
C5_meth_CS (IPR031303) - T[1311-1329] .

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
DNMT1_HUMAN 55.819 % 1454 0