Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S628364.g27113.01.t

Possible name(s)

RAB7A; RAB9A; RAB9B

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S628364.g27113

Location

S628364 [15,457 / 20,562]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 208

>Moocci.CG.ELv1_2.S628364.g27113.01.p
MASRKKVLLKVIILGDSGVGKTSLMNQYVNKKFSNQYKATIGADFLTKEVMVDDRLVTMQ
IWDTAGQERFQSLGVAFYRGADCCVLVYDVTMPNTFKTLDSWRDEFLIQASPRDPENFPF
VVIGNKIDLENRAVSHKRAQGWCHSKNDIPYFECSAKENVNVEQAFQTVAKQALLQESDV
ELYNTDFPDRIDLRNNADSKPKGGDCAC

Nucleotide sequence

Length: 1,569

>Moocci.CG.ELv1_2.S628364.g27113.01.t
TTCCATTTAGATACACATACTGTATTGTTAAATAAAACTTAAAGTTTACCTATAAATCAA
AATGGCTTCGAGAAAAAAGGTTCTTTTAAAAGTTATCATTCTAGGTGACAGTGGAGTCGG
AAAAACGTCATTAATGAATCAATATGTGAATAAGAAATTTAGTAACCAATACAAAGCAAC
AATTGGAGCAGATTTTTTAACCAAGGAAGTTATGGTAGATGACCGTCTTGTGACTATGCA
GATTTGGGATACAGCAGGGCAAGAAAGATTTCAGTCACTAGGTGTGGCGTTTTACAGAGG
GGCAGATTGTTGTGTGTTGGTCTACGACGTTACAATGCCTAATACATTTAAAACGCTGGA
CAGTTGGAGAGATGAATTCCTTATTCAAGCCTCACCAAGAGACCCAGAAAATTTTCCATT
TGTTGTCATTGGAAATAAAATTGATTTAGAAAACAGAGCGGTGTCACATAAACGTGCTCA
AGGGTGGTGCCATAGTAAGAATGACATTCCATACTTTGAATGTTCTGCTAAAGAAAACGT
CAATGTTGAACAAGCTTTTCAAACGGTTGCAAAACAAGCTCTCTTACAGGAATCTGATGT
TGAATTATATAATACAGACTTTCCGGACCGAATTGACTTAAGAAATAATGCAGATAGCAA
GCCTAAAGGAGGGGATTGCGCATGTTGAGTTATTTGTTTGTGACATTTTATGTATTAAAT
TAATTTCATAATCAATTCATTTTATATTTGATTGTTTTTCATTTGTGCTTATTTAGCTTC
CGAAATGCCATATGTATGTATGGATAAATACAATTTTGGAAGAATAATTATAATATTACA
TTACAACCGTCTTTTAAATCTTACTTTGCTTGGTGTATTCTCCAAACAATCTTTTATTAA
ATAATATTTATGTTAAAGTTTGTGTTACTTGTTCATGATTATAATTTATTCCTTGGAAAT
TCAGCTTGGATTACCTCTGCTAAAATAAACTTGTATAAAATATTACTGTGCAATAAAAAT
AAAACCAAATCCATGGATTTCACATTTTTTCGCGTACAAACTAATTGTTTTGGGGGTTAT
TATATTTTCAATCTTGGGTAAGAAGACCAAATTAAATAATTATAAAGGTTATACAGCTTT
TCACTTGTCCATATAGACTATATAATATTTAATTTCTGTGTTTATTAAAAAGCACATTCA
AATCATTTTTGCAATGAGACCAATTACAAAAAAAGGAAATTTATTTGTTCATATATATTT
TAAATTAATCTATTTAATATTTTAACCAGAGTAGCAGAACATCCATATTCCGTTATAATA
ACATACCATTTCTAAATTAATTGGGAAATACTGGATATATGTAAATATCACTTTTAATAA
TTATATTCTGTCAAAAATTAATGGTTTTGACAAACACCTTTTTTACTCATTACTCTGTTT
ATTTTGTTGAGATATGTTCTGCTTCTTTTATTAAAATGAAATGTCGTATAGGTTAAAAAC
ATTGAAAAATTGTATATAATTTAATATAAATAATGTTACAATAATAAGTTGGAACTTTCC
TAATTGAAA

InterProScan

SUPERFAMILY	P-loop_NTPase (IPR027417) - T[5-179] 3.51E-55
TIGRFAM	Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[10-170] 1.8E-26
Pfam	Small_GTPase (IPR001806) - T[10-173] 1.7E-58

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
RAB9A_HUMAN	49.515 %	202	2.93E-66
RAB9B_HUMAN	50 %	206	4.24E-68
RAB7A_HUMAN	83.173 %	363	9.96E-130