Aniseed - Transcript Card

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S625319.g26774.01.t

Possible name(s)

CDC42EP1; CDC42EP2; CDC42EP3

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S625319.g26774

Location

S625319 [13,207 / 15,158]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 268

>Moocci.CG.ELv1_2.S625319.g26774.01.p
MPAKTPIYLKSANGSKGGVGKNSKKLRELLSTDMISPPLGDFRHMAHVGRGGADDMFGDT
SFLKEEENGNTKKGIGSKKKRSVSTTHETATLDRKPRKRNGMDAKSYGKSLGRSGLESPI
LKNAVSLPSLNKKNSTSSTPPQSPKEEETKKEPQNNNTIGNGKNNDCVTAVSPKELYTTH
TTPNSSINGNTEGPPKPRRIMAQDGKCEATSNLNKDDNFSPLRRSSEVLTGKTLSEADID
SSSTWSLNIDLGPSLLDEVMGVMDRVSV

Nucleotide sequence

Length: 1,895

>Moocci.CG.ELv1_2.S625319.g26774.01.t
GAATACAAAAGGTTTAAGGAAACATTAACGTATTTCGCTTATTGAAATCTCTTGACGACT
GTTAGAAACCTCGTGTTACTGGGAATACAGTGAATAGAAAAAGTCGATTTATTCAGTATA
CATTAACATTTAATAACATTCAAACTGGCTAGTACAATATTTACACTTACCGGCAATTCA
CGAAGCAAGAAGCATTCAAAGCCGACCACCATGCCAGCAAAAACTCCTATTTATCTTAAG
TCAGCAAACGGAAGCAAAGGTGGAGTGGGAAAAAATTCCAAAAAACTGCGCGAACTTCTT
TCCACTGACATGATTTCTCCACCATTGGGAGATTTTCGTCATATGGCCCATGTTGGACGT
GGAGGTGCTGATGATATGTTTGGTGATACATCCTTCCTAAAAGAAGAAGAAAACGGGAAT
ACCAAGAAAGGAATTGGAAGCAAGAAAAAGAGGAGTGTTAGTACAACACATGAAACAGCA
ACATTAGATCGTAAACCTAGAAAGAGGAACGGAATGGATGCAAAGTCGTACGGTAAAAGT
CTTGGACGGTCTGGTTTGGAATCACCCATTTTAAAAAATGCAGTCTCACTTCCTAGTTTG
AATAAAAAAAACAGCACGTCATCTACACCACCACAATCACCAAAAGAAGAAGAAACGAAA
AAGGAACCCCAGAACAATAACACCATTGGAAATGGTAAAAATAACGACTGTGTAACAGCA
GTGTCGCCCAAAGAGCTATACACAACGCATACAACGCCTAATAGTTCAATAAACGGAAAT
ACAGAAGGCCCACCTAAACCTCGAAGAATTATGGCACAAGATGGTAAATGCGAAGCGACA
TCGAACTTAAATAAAGATGACAATTTCAGTCCACTAAGACGATCTTCTGAAGTTTTAACC
GGTAAAACTTTATCTGAAGCTGATATTGATTCCTCATCAACGTGGTCATTAAATATAGAT
CTAGGTCCATCTTTACTGGATGAAGTAATGGGGGTAATGGACCGGGTATCCGTGTAGCGA
GCTGCACTACTACAAAATTTAAAGCAATAATTTTTCAAAAGGCAAGTTAATACTAAACGA
AGGAAGTGAGGATATTTTCATGGTTGTTTTGATAAATTTTCCTTCTAACACCAAACCATG
GAAAATCGCAGAGCCATGACATGTCTTGTATTAAATAACCAACATTTACCGATCCAACGA
ACGTGCGTCTCGTCTCGGGTTTGGTTGTTATAATAAAAACGTCTATCAGTATATTTATTT
GAGAAAAATTTTTATTTAAACAAGAAGTCGGGACAAGACTTATGTTGTACTTGTGTTGTG
GCATAACAAAGATAACATCTCTAATGTACATTATACATTATAACGCACAATATTATTATG
TTCAGTTACTGTTATCTGGTTTGTTTTCCAGAGCAAAAAGTACGTCTTTGTTTGTTTTGC
TATTAGCCAATTCACTGCAAGCACGATCCCGTCAGATGCAATGTTAACTGATATTTATTG
CTTTATTTATGTAAAAGTTGTGTGGCCATTTGTAAAGTGTTTTTCGCTATTCATTTACTG
TTCTTATATAATATTAATATTGTTCTTATTACTTTGTTTCCTATTTTTTAATAAAATGCA
GACAATAAAAATTAGTTTATTTTAGTTTATATATATATAAACACCCGTGTAAATAATATT
TCGCTTTAATCGATTAAAGTTTAACCAAGAATATTACAATTAAAAACCAACTTTAAACAA
TATTTTTTGCAATTCAGTTAAAAATAATTAAAGACAGTCGTGTTACTTTTTGTTTTTAAA
ATATAAGAAGTTAACATAAGTAAAATTTGGCTCTTAAGTGGATAAGTAGTTTTATCTTTG
CGTAGTGTGTGAACAGCGAATAAATAATATTGGTA

InterProScan

Pfam	CRIB_dom (IPR000095) - T[34-75] 5.8E-6
ProSiteProfiles	CRIB_dom (IPR000095) - T[35-49] 9.014
SMART	CRIB_dom (IPR000095) - T[35-71] 1.2E-6
Pfam	Cdc42_effect (IPR029273) - T[120-265] 5.8E-15

Best Blast Hits in UniProt

Protein Name	Identity	Bit Score	e-value
BORG1_HUMAN	39.394 %	88.2	3.6E-21
BORG2_HUMAN	35.379 %	105	5.1E-27