- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S62...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S622677.g26549.01.t
Possible name(s)
TGFBRAP1; VPS39
Gene model
Location
S622677 [722 / 3,527]
Amino acid sequence
Length: 934
>Moocci.CG.ELv1_2.S622677.g26549.01.p
MAVKAFNIQLVLGRENIMGNKPKVTIECFNVSGKNIYIGTNDCTLFHFLLLEDVKNEAKK
SSRTMDKSHSLSAFMQNQKKLGLKKSIIQISACNEIKQLLVNCDNSIYVYSMMDLSITAT
LSNKIKHVNKFYINSNPVHANPFSVEVCVSFVKKKSVQLFQISEDNVLLLRDISLSDPLS
AVALDGRHLCMATNLNYVIMDIETGNKLELFPVTDQKPMVQRVAPAEFLLTAPNSLGVFV
TSGGISQRPPIQWSESVFQTEYLHPYIVALDEDFITVHSIMDQQQKQTLPFQGGLQLIKC
DNMLLICTKKDMFIMTMIPYDVQIGFLLSSKLVEEALNLSKACRKCMSQKEYLNMMQIVY
RKCGFVYFEDMNFELAETMFIKGALDARELISLYPGILPANSKFSKSIIPLHDIANVFEI
CNHDKEKIHMCFDFLCDYLQRNLVPVLFSKIQKGEQNGFSVYAKHLSYEKSYHDDIFMSC
ICIFSKQKRSSNLLSTLNIDCEETESIINSFQDSEAFQEFSLEWEDSLKILHDNQCYHIQ
AIAHLLEGKLQAAFNLWKELCMGNLTDTEFPGLSFVAKCLSRYCTDSKMLWFHAEWILTL
DEKIGTEIFTMYLPHYNAIQHKCNQQNVVCCPKPDDVIDFLHHFPASVITYLEHLVFVQK
LEKEKYHTHLVVLYLENVLKLLNENETNQLEMMRVKFQAILKHSNLYRITLILSKINDTI
LYNERVILHGKLGEHQQALDILVNLMKDQTAAESYCIEQALNDEHKKRLFAKLLSVYLSK
ISEANSKGSKSTVAVISLLNKYAENYDACQVLEMLPKTWSVTVLQQFLSRTLRLPKHNAD
TKQIEKMLAKAENLQMQKEEWEMTKKPVLITEEKLCLVCNRSFQSSDCVLYPNGVAVHVQ
CGRNKLICPVTGKMFKCLPSKIEKTTNNINGSLK
Nucleotide sequence
Length: 2,805
>Moocci.CG.ELv1_2.S622677.g26549.01.t
ATGGCTGTTAAAGCTTTTAATATACAACTAGTCTTGGGGCGAGAGAACATTATGGGAAAT
AAACCTAAGGTAACAATTGAGTGTTTTAATGTTTCTGGAAAAAATATCTACATTGGCACC
AATGATTGCACTCTTTTCCATTTTTTGTTGTTAGAAGATGTTAAAAATGAAGCTAAAAAA
AGCTCAAGAACAATGGATAAATCTCATTCCTTATCCGCTTTTATGCAAAATCAGAAGAAG
CTTGGATTAAAGAAAAGTATCATTCAAATATCAGCTTGTAATGAAATTAAACAACTCCTT
GTTAACTGTGATAATAGTATTTATGTGTACAGCATGATGGATTTATCAATCACCGCTACT
CTTTCAAATAAAATAAAGCATGTAAATAAATTTTATATCAATAGCAACCCTGTGCATGCA
AATCCTTTTTCAGTTGAAGTCTGTGTTTCATTTGTTAAGAAGAAATCTGTTCAATTATTT
CAGATTTCAGAGGATAATGTCTTACTGCTCCGTGATATTTCACTTTCAGACCCATTAAGT
GCAGTAGCTTTAGACGGAAGGCATTTATGTATGGCTACAAATTTGAACTATGTTATCATG
GACATAGAAACTGGAAATAAATTGGAATTGTTTCCGGTAACAGACCAAAAACCAATGGTT
CAAAGAGTAGCTCCAGCAGAGTTTCTGTTAACTGCTCCTAACTCATTAGGTGTATTTGTT
ACATCTGGAGGAATTTCTCAGAGGCCACCTATTCAGTGGTCAGAATCTGTGTTTCAAACT
GAATATTTGCACCCTTATATAGTGGCACTTGATGAAGATTTTATAACAGTTCATTCAATT
ATGGATCAACAGCAAAAGCAGACACTACCATTTCAAGGTGGATTGCAGTTGATAAAATGT
GACAACATGCTTCTTATTTGTACAAAAAAGGATATGTTTATAATGACCATGATTCCTTAT
GATGTTCAAATTGGATTTTTATTAAGTAGCAAATTAGTTGAAGAAGCCTTAAATTTATCA
AAGGCCTGTCGTAAATGCATGTCTCAAAAAGAATATCTCAATATGATGCAAATTGTTTAT
AGAAAATGTGGATTTGTATATTTTGAAGACATGAATTTTGAATTAGCCGAAACGATGTTT
ATTAAAGGTGCTCTGGATGCAAGAGAACTCATATCTCTCTATCCAGGAATATTGCCAGCC
AATTCCAAATTCAGCAAATCTATAATTCCCTTGCATGATATAGCTAATGTTTTTGAAATT
TGTAATCATGATAAAGAAAAAATTCACATGTGTTTTGATTTTTTGTGTGACTATTTACAA
CGTAATCTTGTTCCAGTTTTATTTAGTAAAATACAAAAAGGCGAGCAAAATGGTTTTTCA
GTTTATGCAAAGCACTTAAGCTACGAAAAATCCTATCATGATGATATTTTTATGTCCTGC
ATTTGCATATTTTCCAAACAAAAGAGATCTTCCAATTTACTTAGTACACTTAATATTGAT
TGTGAAGAAACTGAAAGTATAATTAATTCTTTTCAAGATTCCGAAGCATTTCAAGAATTC
AGTTTAGAATGGGAAGATTCTCTGAAAATCCTGCATGATAACCAGTGTTATCATATTCAA
GCAATTGCACATCTGTTAGAAGGAAAACTACAAGCAGCTTTTAATTTGTGGAAAGAGCTA
TGCATGGGTAATTTGACAGACACTGAATTTCCTGGATTATCATTTGTAGCAAAATGTCTT
TCTCGGTACTGTACAGATTCAAAGATGCTTTGGTTTCACGCTGAATGGATTCTTACATTG
GATGAAAAAATTGGTACAGAAATTTTTACAATGTATTTACCTCACTACAATGCAATACAA
CATAAATGTAATCAACAAAATGTTGTTTGTTGTCCTAAACCAGATGATGTAATTGATTTC
TTACACCATTTCCCAGCATCAGTTATTACTTACTTGGAACATTTGGTGTTTGTTCAAAAA
CTGGAGAAAGAAAAATACCACACTCATCTAGTTGTACTTTATCTTGAAAATGTGCTTAAG
TTGCTAAATGAAAATGAAACTAATCAGTTGGAAATGATGAGAGTTAAATTTCAGGCAATC
TTAAAGCACTCTAATTTGTACAGAATAACATTAATATTGAGTAAAATAAATGACACCATT
TTATATAATGAACGAGTTATACTTCATGGAAAACTTGGTGAACATCAACAAGCATTGGAT
ATTTTGGTAAATTTAATGAAAGATCAAACTGCTGCAGAAAGTTATTGTATTGAACAAGCT
TTAAATGATGAGCATAAAAAGAGGTTGTTTGCTAAACTATTATCTGTGTACTTGTCAAAA
ATATCTGAAGCAAATTCTAAAGGCTCAAAATCTACTGTTGCTGTTATTTCACTCCTTAAC
AAATATGCTGAAAATTATGATGCTTGCCAAGTGCTAGAAATGCTTCCGAAAACATGGTCT
GTGACAGTTCTTCAGCAGTTTTTAAGCAGGACTTTAAGGCTTCCAAAGCACAATGCTGAT
ACAAAACAAATAGAAAAAATGTTAGCAAAAGCAGAAAATTTGCAGATGCAAAAAGAAGAA
TGGGAAATGACAAAGAAACCTGTTTTGATTACAGAAGAAAAACTCTGTTTAGTTTGCAAT
CGTTCATTTCAATCTTCAGACTGTGTTTTGTATCCCAATGGTGTTGCAGTTCATGTACAG
TGTGGACGAAATAAACTTATTTGCCCAGTCACTGGAAAAATGTTCAAATGCTTGCCATCA
AAAATTGAAAAAACTACTAATAATATTAATGGGTCACTGAAATAA
| PANTHER |
Vam6/VPS39/TRAP1 (IPR032914) - T[19-906] 2.1E-148 |
| ProSiteProfiles |
CNH_dom (IPR001180) - T[23-304] 20.427 |
| SUPERFAMILY |
WD40_repeat_dom_sf (IPR036322) - T[23-219] 4.4E-6 - T[264-316] 4.4E-6 |
| Pfam |
CNH_dom (IPR001180) - T[80-290] 1.8E-14 |
| ProSiteProfiles |
Clathrin_H-chain/VPS_repeat (IPR000547) - T[616-782] 17.895 |
| Pfam |
VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2 (IPR019453) - T[796-903] 4.6E-26 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| VPS39_HUMAN | 23.861 % | 162 | 9.14E-41 |
| TGFA1_HUMAN | 35.185 % | 564 | 0 |
