Login
Help

TRANSCRIPT CARD

Submit your Data

  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S60...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S606180.g25159.01.t

Possible name(s)

RPAIN

Location

S606180 [38,103 / 47,915]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 230

>Moocci.CG.ELv1_2.S606180.g25159.01.p
MDRPKTPGSSTKYQTMYKKGSPMNWKDAYKARCSEHLKKSRSKLLQKFRNINIENNNENL
NDSLMSNVDDVMNIELQEMKDIGGIEEFDKIIESMEQIKRELVIQEQEMMTQYYNNLQYE
NSALDAEISEYEKQALNGYNYQKNIDIICPLCKNNILYKQNTVIRCACGLSIDTMQDCIT
LNNVSIQLQVGVTSHSEQCKSQPQFSVSEGFGMQNLIMSCSVCDYLFVVI

Nucleotide sequence

Length: 9,583

>Moocci.CG.ELv1_2.S606180.g25159.01.t
ACTTAGAGTAAAATTAATAAATTTTATTTTAATTTATCTGTGTAAATCTGATCATGGATC
GTCCAAAAACTCCTGGGTCTTCTACTAAATACCAAACAATGTACAAAAAGGGTTCCCCAA
TGAATTGGAAGGACGCATACAAAGCACGGTGTTCTGAACATCTTAAAAAATCAAGATCAA
AACTCCTGCAAAAGTTCCGGAACATAAATATTGAAAATAACAACGAAAATTTAAACGATA
GCCTAATGAGTAATGTTGATGATGTTATGAATATTGAACTCCAAGAAATGAAAGATATAG
GCGGCATTGAAGAATTTGACAAGATCATTGAATCAATGGAGCAAATAAAAAGAGAGCTGG
TGATACAGGAACAGGAGATGATGACACAATACTACAACAACTTACAGTATGAAAATTCAG
CGTTAGACGCGGAGATTTCAGAATACGAGAAACAAGCTCTAAATGGCTACAATTACCAAA
AAAATATTGATATCATATGTCCCCTTTGTAAGAATAATATTTTGTACAAACAAAATACGG
TGATCCGATGTGCTTGTGGCTTGAGCATTGACACTATGCAGGATTGTATTACGCTAAACA
ACGTCAGCATACAGCTTCAAGTTGGTGTTACGTCACATTCCGAGCAATGCAAATCGCAGC
CACAGTTCAGCGTTAGTGAAGGGTTTGGCATGCAGAATTTGATAATGTCTTGTTCAGTTT
GTGATTATCTTTTTGTTGTTATTTAAGCACAATAATACTTCCATTAGTAAACTTGATAAC
TTTAAATATATATTTTGAATAACTCAACACCCAGTAGTCAGTATATTACCTGGCAGTAAC
TATACATGTTTGCAATAATTATTACATACCTGGTAGCTCAAATAATACCTTTGCACTTTA
ACCGCCTGCTAGACTTGTTTTAGACTATTTTGTTTAGCTGTTTTAATACGTGGTAAAAAT
TATTTTTATTTCAGATATCGTAAAAAGTTCACNNNNNNNNNNAAATAATACCTTTGCACT
TTAACCGCCTGCTAGACTTGCTTTAGACTATTTTGTTTAGCTGTTTTAATACATGGTAAA
AATTATTTTTATTTCAGATATTGTAAAAAGTTCAGAATTTCTGACCATTATATTGTAGTA
TTTAAAAGTTTCATATTTTTCATAAATATACATACATATTTAGCAAAAAATTGTTAACAC
TCGTGAATTTAATTGCTGCTAAAATAGCAATCATATTGTGCCTTTCTCGTATTTTTAAAT
TTTTTTATTTGATAAACCATCCTATTTATTTCTGTAATCAATCGTACAAACACATATCTA
TATTTGCAGATTTTTTTGTAAAATAATTTAATACCATACTAGCAATATTCCAAAATGTCT
GACGAAAATAGGCCAGCAGTTGGGATCAAGATTGGCCATTATGTGTTGGGAGTGACGTTA
GGCGTTGGTACATTTGGCAAAGTAAAGATTGCAACGCACCATTTAACAGGACACAAAGTG
GCGGTTAAAATTTTGAACCGACAAAAAATAAAATCTTTGGATGTGGTCGGTAAAATTCGT
CGTGAGATTCAAAACCTGAAAATGTTCCGACATCCTCACATAATCAAGCTTTACCAAGTT
ATAAGCACCCCTACTGACATCTTCATGGTGATGGAGTATGTACCGGGTGGTGAGCTGTTT
GATTACATAGTCAAGCATGGAAAATTAAAAGAGTTTGAAGCAAGAAAGTTCTTCCAACAA
ATTATATCAGGTACTGGTACATAGAGTTTGGTATCCAAAGGTAGACTAAATAAATTGTAA
TTAGCTTTATCTGTTCACTTAAGTTTAACAGGTAATACCAGTACCGGTATGTTACCAAAA
AATATACCTATAGCAATTGGAAAATTCATGTCCATTTAGTTGCAATATTTAATTAAAGGT
CCACTAAAAGTTTAAATCAAATTAGGCTCATGTCATAGAATTAAGTATATCTTGATTTTA
AAAATATGTTTAGTTTTGAAGGTTTCCATTTGGTTAACTAGTTTCCATTTATGTTTTTTA
ACTTTATTATCAATGAAATATTTCGCTTTCGTAAGCTCCACAAAAATATAACTTAATATA
AAAGATGAAAAGTTATTCTATTTCAANNNNNNNNNNGTTTTGCAGATATTAAAATTAATC
ACAACAATTCAATAGGCTCTTTCTTTCTAAAATATTGGCTTTTAGTAATTAACTCAATCT
GAAAAACCTGCCCTTCAATACAAATTATAGTTTAAATCGCTTTTGTCTAATTATATACGG
GAAACGATTTTTGATTGTTAAAAATCAAATTTTCTCCAGGCAGGTTTGGGATGTTTATTT
TTCTTGCGNNNNNNNNNNTCAATGAAATATTTCGCTTTCGTAAGCTCCACAAAAATTAAC
TTAATATAAAAGTTGAAAAGGTATTCTATTTCATNNNNNNNNNNGCATTTTTTAAAGCAG
ATTTTGTTAAATAACTCAAAAATTACGCAAAACTGTGCAAAAATATTTTTGACCATGGTT
ATTATGGTCATTCTACATCTTTTAAGATGAAGTTGTTTTCAAATGTTAGTTGGCCATTAA
GGGACACATGCAGTGTCAGAATTACTGGTGTTTTACTATAGTTTTTCATACAATAGAATT
AGTAATGTTGTTTTTCTTGTCTTGTTTCTGTTAGTCTTTGTTTGTTTAAAGGACACTGAT
CTCTATTCAATTTTTAAATGTCTATAATTAGTATTTTTTATGGGTAATCACTCATTACAT
CACAAACTACTTGACATTAGAAACCATGTCTAAAATTGAGTGCTGAACAAGACTCAAACA
ATGAGCAGAGAAATGGTCAAAGCCAACAACACAGAATTTAACATAAACTGTTGCTTCGCA
GTAATTCTATCAAAATTTTTAGTGCTTTAATTAAATTTTGATAAAGAATTTATATATATA
CATACAATACTTTTTACATGTGGCAAATGGAGAGATTTGAAATACAATCTATTAATTTAG
TAGGTTTTAACTTTATCCAGCTCTACCTACCCGNNNNNNNNNNGTTTTGCAGATATTAAA
ATTAATCACAACAATTCAATATGAATGACAATCCAGTGAATGTCCATCGTACATTAAAAA
AACATTTAAACTCGTTAGTTTGAGGCTCTTTCTTTCTAAAATTGGCTTTTAGTAATTAAC
TCAATCTGAAAAACCTACCCTTCAATACAAATTATAGTTTAAATTGCTTTTGTCTAAATA
TATACGAGAAACGATTTTTGATTGTTAAAAATCAAATTTCTTCAGGCAGGTTTGGGATGT
TTATTTTTCTTGCACTGCAACTTATTCCTGTTCATTTAAAATTTCTCAAGTATTTAGCAT
TTTTTAAAGCGGATTTTGTTAAATAAATCAAAAATTACGCAAAACTGTGCAAAAATATTT
TGGACCATAGTTATTATGGTCATTCTACATTTTTTGAGATGAAGTTGTTTTCAAATGTTG
GTTGGCCATTAAGGGACACACATACACATACAGTACCGAAATTACTGGTGATTATTTACA
ATAGTTTTTCATACAATAGAATTACTAATGTTGTTTTTCTTGTTAGTCTTTGTCTTAACT
TTATCCAACTCTACCTACCCAAATAATATTAAACATTTTTGTAACTTAGGTGTGGACTAC
TGCCATCGGCACAAGGTTGTTCACCGTGATTTGAAACCAGAGAATCTACTATTAGACGCG
AACAGCAATGTTAGGATCGCGGATTTCGGCCTTTCTAACATGATGTCTGATGGGGAGTTT
TTAAACACAAGTTGCGGCTCACCTAATTATGCTGCTCCAGAAGTAATTTCAGGTAAATTC
TTGGTCATGAACCTGTTTATTTATTGTTATTTTGTTAACAATACTACCTTGTAATAAGCA
AAATATTTGNNNNNNNNNNTTATGCTGCTCCAGAAGTAATTTCAGGTAAATTCTTGGCCT
TGAACCTAGTTATTTATTGTTATTTTGTAAACAATACTACCTTGTAATAAACAATTTACT
TTAATAGAAAAATTAAGCTTACAAGTATGGCAATTTTTCCAATGTAAGCTTTGACTTGAT
TCAATGTTATTGAAACACTGACCATTTTCGTAAATAATTTAAATTGTTACAAATTTTTAA
GCGAAATATTTAAAATTGCATATCTATAATCTGGTATTTTTGTTTATACTTTGTACGAAA
ATAACAATCATAATATTTTAGGCAAGTTATATGCTGGACCTGAAGTAGACGTGTGGAGCA
GTGGAATTATCCTTTACGCGTTGCTATGCGGTACACTTCCGTTTGATGATGAGCACATAC
CTAGTTTGTTCCGTAAGATACGGAGCGGAATATTCGACATTCCTGCATATGTCGACAAAG
GAGCAGCTAAACTTATTCAGCATATGTTACGAGTATGTATGATATATCGTACCGTCTTCA
TTAAAACAAAAACAAACAGTCTTATTTGAACGTGGAGATATTTAAATAAATAAATTGTAT
GGGTACCGATATAGCATAGAGCAGAAAATTGCAAAAAATCATATATATTATGATCGGTAG
TAATTCAGTAATTCTATGTAAAAACAGTACGGTACTCTTAATATGAATGAATTTTGTTTT
GGAATTGCAATGCATTTGCCAATATTACCTAATTTTAGGAACTTTAGCATAAATAAATCA
TGTATAATTGTCAAATAATTGTCTATGGCTGCAATTTTTTTCATGTTACAAATTTTTTTA
GTCCAGTTGAATCACATTNNNNNNNNNNATGTAAAAACAGTACGGTACTCTTAATATGAA
TGAATTCTTTGTTTTGGAATTGCAATGCATTTGCCAATATTATCTAATTTTAGAAACTTT
AGCATAAATAAATCATGCATAATTGTCAAATAATTGTCTATGGCTGCAATTTTACTTCAT
GTTACAAATTTTTTTAGTCCAGTTGAATCACATCGTTTATAATGCAACTCTTTTTCAGGT
CGACCCAATGCGGCGTGCGACCGTCCACGACATCCGACAGTACGAGTGGTTCAAGAAAGA
TCTTCCAAAGTATTTGTTTCCTGACGAAGGGTCGCTAAACGCTGATATTATTGACGAAGA
AGCATTGGCCGAGGTGAGATATATGAACCAACAGAAATCGACAAAGTTACAAATAGTGCA
CCAATTTAAAACAACAAATTTATTATGTATATTTTAAATGAAATATTGGTATATATACTG
CTATTCTGTACACATGTACAGCTAAGCCTGCATAAAATGTGGAAGTGCTTGAGCGGAGAG
GGACAGGATAATATACATTAGACTTTACAGATTTTTTGTTTTAAATACGTAACTGGTACA
TCCCAGGCTTCATTTCATTACCGTTAGCAATAGTTCCTGCATAATTTTAAAACCTGAACA
AGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNTGGAAGTGCTTGAGCGGAGAGGGACAGGATAATATACAATAGACTTTACAGATTTT
TTCTTTTAAATAGGTAACTGGTACATCCCAGACTTCATTTCATTACCGTTAGCAATAGTT
CCTGCGTAATTTTAAAACCTGAACAAACAAACATTTATAATATAATATACGTTATCTGAA
TTAGTTTTTTAAAGTTATGTTTTGTTTTAAATCCACCGCAATAGTAATAATGATTTATAA
TTTCTTGCTTTACCTCCAGGTCTGCTCGAAATTCCAGGTGAGCGAAGAGGACGTTTATCA
TGCACTAACACACAACGGACCGCATGACCCTCTCAATGTGGCGTACCATCTCATCATTGA
TAATAAGGTATGGTATGATTAAGTTTATGTTTTTTGATTGAGTCCTTGTACGCTTATTAT
TTTTATATCTTCAAAACCTAGTTACTCATTTTAAGGCAAAGGCATCCTATGCCACTGGAA
TGAAAAGCTGATTATTTTTCTCAGGTTTATTTTATGACTCAATCAAATGAACTGTTTTTA
ATAATAATTTATTTGAACTGTTTAAAAAATGCTCAAACTTGATTTTAAAATGTAAAATTC
CTTTACAAGATATTTGGCTTTAGATAGTTAATCTAATTTTACTAGTACTATTATTATGAG
TCGATAAAAATAGGCTTTTTTATTTTGCAATCTCCCCCCATTTTTAGATCATCTACAACC
AAGCTCAAGATTTCTTCCTGGCACAAAGCCCCCCTCCCCCAAACCTGACAGGGTTTAGTC
TTTACCACAGCGCCCCCAGTAACAATACCACAAGACCCCCTATTTCACACCCTGAAAGAA
TCGCCCCCTTACTGGACATGCAAGACAATGAGGGCAATGATGCGCGAAATAAACGGCCGT
TACCGGTTAAGCGTGCAAAATGGCATCTTGGAATAAGATCACAAAGCAAGCCGAGGGATA
TCATGTTTGAGGTAAATTATTCCATGATTTATTGTAATTTTATGCAAGAAGAACTGAATA
TTGACNNNNNNNNNNTCAAAACCTAGTTACTCATTTTAAGGCAAAGGCATCCTGTGCCAC
TGAAATGAAAAACTGATTATTTTTCTCAGGTTATTTTACGACTCAATCAAATGAACTGTT
TTTAATAATAATTTATTTGAACTGTTTAAAAAAGGCTTAAACTTGATTTTAAAAGTGTAA
AATACCTTTAAAAGATATTTGGCTTTAGATAGTTAATCTAATTTTACTGTTACTATTATT
ATGAGTATAAAAATAGGCTTTTTTATTATGCAATCTCCCCCCATCNNNNNNNNNNCAAGC
ATAGAGCTTTTCAAAATGCTTTAAGTTGAAATTGATGTTGGCATGGCTTCAACAACTGTA
AGACATATTCAACTTGTAGTAAACAGGGCTTCAGTTATATTTCTGGTGCATAAGTTGCAA
AATGTAATTTCTGAAAACTTTTATTGAACCTTAGTATGATTTAATCTTTAGGTATTCAAA
GCAATGAAGAAGCTAAACTTTGAATGGAAAGTTGCATCCCCCTACCACGTCCGAGTGAGG
CGGGTAAACAGCACAACTGGGCATATTAACAAGATCAATCTGCAGGTGGGTGATGGGTAT
AGTATTACTTTCAAGTGATGTTGCTTATTACAAGACAACAATTTGAGGATTTTATTTATT
TTCAAGAATTATTTGCAATTAGACAATGCAGCGTTGTTCTATTCGCTAATGTTATTANNN
NNNNNNNCAAGCATAGAGCTTTTCAAAATGCTTTAAGTTGAAATTAATGTTGGCATGGCT
TCAACAACTGTAAGACATATTTAACATGTAGTAAATGGGGCTTCAGCCTCATATTTCTGA
GCCTAAGTTGCAAGATTCAATTTATGAAAACTTTTATTGAACCTTAGTATGATTTCATCT
TTAGGTATTCAAAGCAATGAAGAAGTTGAACTTTGAATGGAAAGTTGCATCCCCGTACCA
CGTACGCGTGAGACGGGTAAACAGCACAACCGGGCACATTAACAAGATCAATCTGCAGGT
GGGTTAAGTATAGTGTTAGATTAGTTCCATAGCGTTTAAGGGATGTGGCAAGACAACAAT
TTTAAGATTTTTTTTTTCAGGAATTACTTGCAATTAGACAATGCAGCGTTGCTCTTAATT
ACTGATGTTATTATGATTAGGGATGTACATTATATAATAATTGGATATTCTGGAATTCTA
AAATAAAATTGCCAAGTAAAATCAAAACATCGACAAAACATTTTGAAATTGGCAAACAAA
TGTAAAAAATACTTTATCTGATTGAATTTTAAAACTTAAAAAGGGTTCAATTTATTAAAT
TAAATTGCAGCTTTGAGTAGTTTGACAACATTTTAAAAGCAATTAATTAAATGGGATTAT
TTAAAACAACATTATTTATTTTCATATTTTATTATTCTATTTACCAAAATGTATTCCAAG
TCTCTCAGATATTCAAATCTCTGGATTCTAAATTCATAACGTACATCCCTAATCATGATG
AAAGACTAAAAAATTTTAAATGTCAGGTAAAAAGTAAAGCTAAAAACACAATCGAATAAA
CCTTAACAATGGATCAATTTTTTCATGTTGATTCAACTCTTAAACAAGGACGCGCAGGTT
CACATGTATTTCGACTTTGCTAAAAGTTCAATCAATTGGCTTGCAAACATTATTTGTTAA
CCTTGATTTATCTGGGGCTATTGTTAATTATCAATCTCTGAAATTAATTTTAAAATACAA
TTTAACAGTTTGTTTATAGCAGCCTTTGCTTTAAGCTACTAATTACTAATTCATTAAAGC
TTAATTATACACAACCAGGTATGATTATTTATTAATTAAACCTTTTTACTTACTTTTACT
GTTTTAGGGTACTAAACCTGACAATCTAATCCCAGTATACTAGGGCATGTCACAGTAAGA
TTTTGATATCGTTAAACCGCACAGAAAAATCATGCAAATATGTTATGGTAATTATTATCA
TATGGGAAATAATTGCGTCTCTAATGTCATCGTAACCAATGCCCATTTTAAAGCACTGTA
AAGAAATCTTGACCTTGTTTCAGTGCCAGGGGTTGGTCTGTCGTGATAACAGCAGTGATT
AAGAACAATGCTGCATTGTAAATAATACCAGTGCAAATTGTAGGATTTGTATTTGGGGGA
AGTTGATATAGGTACTTATTCCGCACATAGCAGAGTAAATTTGGGTATTATGGTCCATTT
TGTAGATGATTTAGGGCCAATTTGACATTTTAATTTGATTTTTGGGAAGTGATATATACG
ATACTATACTATGACACACCGCTTTAGTAGGCCTATTTTATACTTCTAATTAAAAAAGAT
TTTATATTGTTGCTTCGTAATGTCAGTAGTTAAACCTTTCCATGTTCTCTGATGTAGATC
GTATACGGTTTTATTAGTGTGGATATTACAAGTAATATTGTACAGAANNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT
CCAGCTGTACCAGGTGGACTACAAGAGCTACTTACTCGACTTCAGTAGTTTGACTGACGA
AGCTCCGCTAGAATCCAGCGCTAGTTTCGGTAATCTGAGTTAA

InterProScan

PANTHER
RIP (IPR028156) - T[9-230] 1.1E-48
Pfam
RPA_interact_N_dom (IPR028158) - T[15-50] 3.9E-10
Pfam
RPA_interact_C_dom (IPR028159) - T[148-226] 4.2E-20

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RIP_HUMAN 29.694 % 103 2.18E-27