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  1. Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S56...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S564034.g22054.01.t

Possible name(s)

NCAPD2; NCAPD3

Location

S564034 [2,383 / 10,653]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 1,213

>Moocci.CG.ELv1_2.S564034.g22054.01.p
MEQWNILQQGTLVPIMAQVPKLIQHLLDLKVFDLEEVVVDLITESEFTEEQEIELQLNEF
DINKIKKCVHVLQNMIVQKSSESLWSTLVEKKLSIKHLQVWIFTILLKGLKLNASYLEKT
ASILCANLYYLILAAPGFRREYFFHCIVYEKALNVFEMTSVLIKHPLKRKADNTLSQQKK
KAKHDKSVAQGDKNATTEVIEPDFSTEEIHRIMDFSQNCLYSFNFLLSIMSLREHEVSFM
HGLRVITKVISNLGRTATSAITEFNFSLDCDDINEDDNPTLLAYHALFLMISPKHGDIHK
TSLMVLKRLLGIVLMSESVVFNSVPKSYVHSSNTAFQFILAMFCKNENEKVMENVRDFLQ
NVIVQNPDRAEYRTHMAVSVGHLIYEMPISFYSNFVKWLVRFLKHVKVGYRSNVLIVIGH
LLCLPERLQEDLSEDSTSHKFLLQTIMHRVVDVAASVRSRALGVLVEIMQSKVVTPEVFT
SAANSSQVMLNLLQEVDLSETTTGNEESGGVFASILNHCASWNKSQVRKSAIVSLENALL
HEYIPLCKINIQILEERCRDPALIVRKQTVQSITNVLMKYPSSMEMCTSWAQGIFPRIID
PETTVQERVLANVQKVLFDTIQSEARETQNIAWNILDYFTGPEGNGNKVFLENLCVHWFR
QNPGNELICNVVIANLDNELRQSPAWLFIEIITRHVCNENVAKNIYNCYQEQHNSILPLP
THASMIYTMGNISKYVDDETKNIVIGELKDKINTFDWAIQLITPGIECICKLSSAKENIN
ETESNPFSEWCVNVYTECERYIFECFKNISQNHAFEDLDYDRIINYVTTAGCASLYTPKQ
VPKRLLLYMQALLTGIKMDDDVHSSQSSQLTQGVPLSQFRSTAIPNGVRAHVILNLGKMS
FFKPSLAKKLVPAMARELEMSNNEMVRSNVLIVLTDLCVLHTQLVDPYISEMSTCFRDES
AAVRNLLILTPRHAVTLLTKLLRKEFVKWRGSLLYKYLVCTCDDEKEIQDLARFGLLEQL
LINSAGDIFFRHFLELIFYLNSYEHGSYNRFLKTEREIKLFDFSSTKKTAKRMEIYKLMV
ENMADDHRVKLTTIVDGAIPLNKKTENILCDTLSILCSQEIKLKCLRASTDDDDFEDIPG
TQQRNAEKLQQEIKRGFVSQVVKRNLVENIIPIVISLKNFLVEKKSSLTREIMLFLKEIM
QAKTYILPPEFQI

Nucleotide sequence

Length: 3,642

>Moocci.CG.ELv1_2.S564034.g22054.01.t
ATGGAACAGTGGAACATTTTGCAACAGGGTACCCTGGTACCGATAATGGCACAAGTACCA
AAGCTTATTCAGCATTTGTTGGACTTGAAAGTATTTGACCTCGAAGAAGTTGTGGTTGAC
CTTATTACTGAATCAGAATTTACAGAAGAGCAAGAGATCGAACTTCAACTCAACGAGTTT
GATATCAATAAAATAAAAAAATGTGTTCATGTACTGCAAAACATGATAGTTCAAAAATCA
TCTGAATCTCTTTGGTCTACTTTAGTAGAAAAAAAGTTATCTATAAAACACCTACAAGTT
TGGATTTTTACAATTTTATTAAAGGGACTAAAACTAAATGCTTCATATTTGGAAAAAACT
GCCTCTATTTTATGTGCGAATTTGTATTATTTAATCCTAGCAGCACCTGGATTCAGAAGA
GAATATTTTTTCCATTGTATTGTGTATGAAAAAGCATTGAATGTGTTTGAAATGACTTCC
GTTTTAATTAAACACCCACTGAAACGAAAAGCAGATAATACATTATCACAACAAAAGAAA
AAAGCCAAGCATGACAAAAGTGTTGCCCAGGGTGATAAAAATGCAACTACAGAAGTTATT
GAACCAGATTTTAGTACTGAAGAAATACACAGGATAATGGATTTTTCTCAAAATTGTTTA
TATTCATTTAACTTTCTCTTGTCTATAATGTCACTGAGAGAACACGAAGTGTCCTTTATG
CATGGTCTACGCGTTATAACAAAAGTCATTTCTAATTTAGGCCGAACAGCAACTTCAGCA
ATTACTGAGTTTAACTTTTCATTAGACTGCGATGACATTAATGAGGATGATAACCCTACT
TTATTAGCTTATCATGCTCTTTTCTTAATGATTAGTCCAAAACATGGCGACATACATAAG
ACATCTTTGATGGTATTAAAGCGATTACTAGGTATAGTTTTGATGTCAGAATCGGTTGTT
TTTAATTCGGTTCCAAAAAGCTATGTACACTCATCAAATACAGCTTTCCAATTCATTCTT
GCTATGTTCTGTAAAAATGAAAACGAAAAGGTTATGGAAAATGTTAGAGATTTTTTACAA
AATGTTATTGTCCAAAATCCTGACAGAGCGGAATACAGAACACATATGGCTGTATCTGTT
GGTCACTTAATATATGAAATGCCAATTTCATTTTATTCAAATTTTGTAAAATGGCTTGTA
CGCTTTTTAAAACATGTTAAAGTTGGTTATCGGAGTAATGTTCTTATTGTGATTGGCCAC
TTACTATGTCTACCTGAGAGGCTTCAAGAAGATTTAAGTGAGGATTCAACTTCTCATAAA
TTTTTACTCCAAACTATTATGCATAGAGTAGTGGATGTTGCTGCTTCTGTAAGATCTAGA
GCTCTTGGAGTATTGGTGGAAATAATGCAGAGTAAAGTTGTTACTCCCGAAGTTTTTACA
TCTGCAGCTAATTCGTCACAGGTTATGTTAAATCTGCTTCAGGAAGTTGATCTTTCCGAA
ACAACTACCGGTAATGAAGAATCTGGTGGGGTATTTGCATCAATATTAAATCATTGTGCA
TCATGGAATAAATCTCAAGTCCGGAAATCTGCAATTGTAAGCCTGGAAAATGCATTATTG
CACGAGTACATCCCGCTATGTAAGATTAATATACAAATACTGGAGGAACGTTGCAGAGAC
CCAGCATTGATAGTTCGAAAGCAAACTGTCCAGTCTATCACAAATGTCCTTATGAAATAT
CCGAGTTCAATGGAGATGTGTACATCATGGGCCCAAGGAATTTTCCCCAGAATAATTGAC
CCAGAAACTACAGTACAGGAAAGAGTATTAGCCAATGTGCAAAAGGTTTTGTTTGATACG
ATACAAAGTGAAGCTAGGGAAACACAAAATATAGCTTGGAATATCCTTGATTACTTTACC
GGCCCTGAAGGAAATGGGAATAAAGTGTTTTTAGAAAATCTATGTGTACATTGGTTTAGG
CAAAACCCTGGAAATGAACTTATTTGCAACGTTGTGATAGCTAACTTAGATAATGAACTC
AGACAGTCACCTGCTTGGTTATTTATTGAAATTATTACTCGTCATGTGTGCAATGAAAAT
GTTGCAAAGAATATATATAATTGCTATCAAGAGCAGCACAATTCCATTTTACCTTTGCCA
ACACATGCAAGTATGATTTATACTATGGGAAATATATCTAAATATGTTGATGATGAGACC
AAGAATATTGTTATAGGTGAACTGAAGGATAAAATTAATACATTTGATTGGGCAATACAA
TTAATTACCCCTGGAATTGAGTGCATTTGTAAATTGTCTTCTGCAAAGGAAAATATAAAT
GAAACAGAGTCAAATCCTTTTTCAGAATGGTGTGTTAATGTATATACTGAATGTGAACGT
TACATATTTGAATGCTTTAAAAACATTTCACAGAATCATGCTTTTGAAGATTTAGATTAT
GATAGAATAATCAATTATGTTACTACTGCCGGATGTGCTAGTTTATACACTCCAAAACAA
GTGCCAAAGCGACTGTTACTGTATATGCAAGCTTTGCTTACTGGTATTAAAATGGACGAT
GATGTACATAGCAGTCAAAGTAGTCAGCTGACCCAAGGTGTACCATTATCTCAATTCCGG
TCAACTGCTATTCCAAATGGTGTCCGAGCCCATGTTATATTGAATCTTGGAAAAATGAGC
TTTTTTAAGCCAAGTTTAGCAAAGAAACTGGTTCCTGCCATGGCAAGAGAATTGGAAATG
AGTAATAATGAAATGGTTCGTAGCAATGTGTTGATAGTATTGACAGATTTATGTGTACTT
CATACTCAACTTGTCGATCCCTACATTAGCGAGATGTCAACTTGTTTTCGGGATGAATCT
GCTGCTGTTAGAAATTTATTAATATTAACACCTAGACATGCAGTGACACTTTTAACCAAG
CTATTACGAAAAGAGTTTGTCAAATGGAGGGGAAGTTTATTATATAAATATCTTGTGTGC
ACTTGTGATGATGAAAAGGAAATTCAAGACCTGGCAAGATTTGGACTTCTGGAACAACTT
CTAATTAATTCAGCTGGGGATATATTCTTCCGACACTTTCTTGAGCTAATATTTTATCTG
AATTCGTATGAACATGGAAGTTACAACCGGTTTCTTAAAACAGAACGAGAGATAAAGTTG
TTTGATTTTTCATCGACTAAGAAGACCGCAAAACGAATGGAGATCTATAAACTAATGGTT
GAAAATATGGCTGATGATCATAGAGTAAAGTTGACAACCATTGTTGATGGGGCTATTCCA
CTGAACAAGAAAACTGAGAACATTCTGTGTGATACTTTGAGTATTCTTTGCAGTCAGGAG
ATAAAGTTAAAATGTCTTCGAGCATCGACTGATGATGATGACTTTGAAGATATACCCGGA
ACCCAACAAAGAAACGCAGAAAAATTGCAACAGGAGATAAAAAGAGGTTTCGTTTCTCAG
GTTGTGAAACGTAACTTGGTAGAAAATATTATTCCGATCGTGATATCGTTGAAAAACTTT
CTTGTTGAAAAGAAAAGTTCGCTAACAAGGGAAATCATGCTCTTTTTAAAAGAGATAATG
CAGGCAAAAACTTACATTTTGCCTCCAGAATTTCAAATTTAA

InterProScan

PANTHER
CND1/NCAPD3 (IPR026971) - T[43-1201] 3.2E-202
SUPERFAMILY
ARM-type_fold (IPR016024) - T[223-618] 7.32E-9 - T[524-842] 8.06E-20 - T[882-1046] 8.06E-20
Gene3D
ARM-like (IPR011989) - T[323-640] 8.7E-7
Pfam
Cnd1_C (IPR032682) - T[925-1088] 9.6E-16

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CNDD3_HUMAN 29.177 % 446 1.81E-134