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Transcript Model

Transcript Id

Moocci.CG.ELv1_2.S562449.g21990.01.t

Possible name(s)

RNF139; RNF145; SYVN1

Gene model

Moocci.CG.ELv1_2.S562449.g21990

Location

S562449 [486 / 6,766]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 517

>Moocci.CG.ELv1_2.S562449.g21990.01.p
MEFDEENVSLKDKWIKATLRLPGLLFLELIITNTLSAELFLGNEEDNSEVLTRAVNIHFR
LLNRHIAAWPGLFTVIWIKYEFSKMFMSYWILRFCIHFYDNLTREHFWSNFFDNHDINVP
FLLKNETLNYAWLDKVFVVFVSAAQCTSSAFTLVGLSCIVSKIINLLFFILRSWLCWSFS
QHPPDTVHVGAASLVDGITMMTMSIYIGLADLEIPSRVIFLAYILLTVFSSQLPAIHTVI
DDTMMAAVASPIVSKYKHMRLFISFLLLLFTCGFISFIIFLILAIDEISSFWLIIISHNY
FVTFWLTVGSIAIYALMIMDQKLNFESINVEDISFYIRGFSRSIEYVINLVLCLYLMNVF
YSEISSLPVVILLGLYVYYCIAWKGKKAWNVLKLRRLAATKVASLKNPTQEDISIKDDVC
PICYQDLSDATNCKEMHCRHTFHFNCLKKWFYVRDQCPVCHTDFNKKVEVEKTKQNINRK
KEPKPSSDNLGYSTASDESDTEYTTTDNEATTENVQK

Nucleotide sequence

Length: 3,039

>Moocci.CG.ELv1_2.S562449.g21990.01.t
ATGGAATTTGATGAGGAAAATGTCTCCTTAAAAGATAAATGGATCAAAGCAACTTTGCGT
CTTCCTGGCTTACTGTTCTTGGAACTTATTATCACGAACACACTATCAGCTGAGCTTTTT
TTAGGAAATGAAGAGGACAATAGTGAAGTTTTAACTAGAGCTGTCAACATTCATTTCAGA
CTTTTAAATAGGCACATAGCAGCTTGGCCTGGTCTGTTCACCGTCATTTGGATAAAATAT
GAATTCAGCAAGATGTTTATGTCATACTGGATTTTACGATTTTGTATTCACTTTTATGAC
AATTTAACAAGGGAGCATTTTTGGAGTAATTTTTTTGACAACCATGACATAAATGTACCA
TTTTTACTGAAAAATGAAACCTTGAATTATGCTTGGTTGGACAAAGTTTTTGTTGTATTT
GTATCAGCAGCACAATGTACTTCTTCTGCATTTACTTTGGTCGGATTGAGTTGCATTGTT
TCAAAAATAATTAATTTGCTCTTTTTTATATTAAGATCATGGTTATGCTGGTCGTTTTCT
CAACATCCACCTGACACTGTTCATGTTGGTGCCGCCAGTTTGGTTGACGGTATAACGATG
ATGACAATGTCAATATACATTGGCTTGGCCGATTTAGAGATACCAAGTCGCGTTATCTTT
CTTGCTTATATATTGCTGACTGTATTTTCATCTCAGTTGCCGGCGATACATACTGTAATA
GACGATACAATGATGGCAGCCGTGGCATCACCTATTGTCAGCAAATACAAACACATGCGC
TTGTTCATCTCTTTTTTGTTATTGCTGTTCACCTGTGGATTTATATCATTTATCATTTTT
CTTATTCTTGCAATAGACGAAATTTCATCTTTTTGGTTGATTATTATTTCTCATAACTAT
TTTGTGACCTTTTGGTTAACTGTTGGTTCTATTGCAATTTATGCGCTTATGATCATGGAC
CAAAAACTGAACTTTGAATCTATAAATGTTGAAGATATATCATTTTATATTCGTGGATTT
TCAAGAAGCATCGAATACGTCATAAACTTGGTTCTATGCTTGTATTTAATGAACGTTTTT
TACTCAGAAATATCTAGTTTACCAGTTGTTATATTGCTTGGATTATACGTCTATTACTGC
ATTGCATGGAAGGGCAAAAAAGCATGGAATGTTTTAAAATTGCGACGGCTTGCTGCTACT
AAAGTCGCCTCACTGAAAAACCCTACGCAAGAAGACATTTCTATTAAAGACGATGTTTGT
CCAATTTGCTATCAGGATCTAAGTGATGCCACCAACTGTAAGGAAATGCATTGCCGTCAT
ACTTTTCATTTCAATTGCTTAAAGAAGTGGTTTTATGTGAGAGACCAATGTCCTGTATGC
CATACTGATTTCAATAAAAAGGTTGAAGTGGAGAAAACGAAACAGAATATTAATAGAAAA
AAAGAGCCAAAACCGTCTTCCGATAACTTAGGATATTCTACTGCTTCTGATGAGAGTGAT
ACTGAATATACAACTACTGACAATGAAGCTACTACAGAAAATGTGCAGAAATAAATGCTT
TCTAAAGTTTAAATTTTCTTTTCACTGTTCGTGATCACACCAAGGCGTGATACTAGTGTC
GCAATACAACTCCACATTATAAATATCAACTGGAGCATCACCAATACGCATTTCAGTTTT
CAGTTGGACTTCGTACTTAACAGTATCATAACCAGTTTCTCTATCACGCTGAAATTGTGC
CTATATGAATTATGCATTATTACCGGTACTACATTTTATTTAACGATTTTATTAGACTTA
CTTTCTTTTGAGTGCCATAGCGTTTATAATCTCTGGGTCGTTTTACTTTATCGTGTATGT
GTTTAAAGGTCTCGTACCCAGTTGTTATTCCAGAAGGTCTAAATAACTAAAAGGAAAAAT
TGTGTTCATGGTTGTGATGAGTACTACATATTTAAATTACTGTTAAATCGTTTTCTTTCA
TTCTAACGTAAAACTCATCATCTTCTCTTCCCCAACCCCAAAATTTGTTAGACAATCCAC
GACACTAAATATTTTGGAAGATTATGTAATCTTATATATCTTATTTATTTATTAAAATCT
TTTATTTAAATATGACTGTAACCAACCAGTGATTTTCAAGCTTTGAGGCTTTGAATTGAG
TGTGAAAATAGATGTTTGCGGCGGCATAGGCCTTTTAATAATTTGTATTAGCGTTATTTT
GGCAAAACTGTATTGATTGTTGATATAAAAAACTCTCACCAATTTAAAATGTTCAGTTGT
TAACATTAAAATTCCGCCAACATATTTTGGATAATGATACAAAGGATGCAGTTCCGGTGA
TGCCAAATGAATTACATTACTTTATCCGGATAGGAGTATTTTAGTTCAGGATTATTAGGT
AATAAGTCTACATCATGCATAGCAACATAGTCCACTTCTTTTTCTGCCATTAAAAACCCG
ATGTTGATCAAGGATGCTCTGTTGAACCTGTGGGTGTCAACTTGATTTACAACTATTATT
TTATGTTTCACTTTTTGATTATTTAAAAATTTATGTATCCAAGGTGCAAATTCCAAAAGC
TCCTCAAATCTGTCCCGGAATGGCACGATTATTGCTAGAGTATGCGAACCCCAATCTTGA
TTTGACTCATCACTTTTTATTGTTTCTTTTTGAATGTGCAAAGGTGTTTCTGTTTCCTTG
AGGATAATCTTAGGATTTTGGTAATTTTTAATAGTTTTTTCTCTTGTTTCTGTGCCATTT
TCGCTGCATTGCATGAATAGATATGTTCCATAAAATAATATTAATGTCAGGCATATTATT
GCCAATTTTATCGTAGACAGTCGACGGCATAGCATTTCATTTTACAAAACCAGGGGTGAA
AGGTGAAATTAAAAATTTTATATCTTCACAGATAATCACTTCGAAATGGCACTTAAGTTT
ACTGGTCTATCAATAATCTTCCATTTCAATAATGTACTTAATGTAATCTTATTATTATCA
TTTAATATTTACAGGCTGGGTAATTTCGTGGCATGACTT

InterProScan

Pfam
TRC8_N_dom (IPR025754) - T[68-389] 2.7E-24
Gene3D
Znf_RING/FYVE/PHD (IPR013083) - T[393-474] 5.0E-15
Pfam
Znf_RING (IPR001841) - T[419-460] 5.2E-10
ProSiteProfiles
Znf_RING (IPR001841) - T[420-461] 12.194
SMART
Znf_RING (IPR001841) - T[420-460] 1.1E-6

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RN139_HUMAN 24.855 % 105 5.28E-24
RN145_HUMAN 25.499 % 145 3.27E-37