- Transcript 'Moocci.CG.ELv1_2.S56...'
Transcript Model
Transcript Id
Moocci.CG.ELv1_2.S561671.g21956.01.t
Possible name(s)
RBM4; ZC3H7A; ZC3H7B
Gene model
Location
S561671 [9,657 / 35,462]
Amino acid sequence
Length: 1,453
>Moocci.CG.ELv1_2.S561671.g21956.01.p
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YELCERHMKNMCEFNFVPPEENKCCYAHSNEELEEWRQRREYVINRIKKAQEDKLISSNV
DMEGLIKESQLKM
Nucleotide sequence
Length: 5,695
>Moocci.CG.ELv1_2.S561671.g21956.01.t
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TTAGCGGATTACTTACAAACAGAATGGTGAAGATTTTTGTGGGAAGACTAGCGGAGTCTG
TGACACGAGATCAGCTCCAAAAGCTATTCGAAAAATATGGGGAAGTTTCTGACTGTGACA
TTTTACGAGATTATGGATTTGTCCACATGGCAAACGAAGAAAAGGCTCACAATGCTATTC
GAGAATTGGATAGAATGGATATTAACGGAAGTCGCATAAGTGTCGAGTTATCAACATCAC
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TAACTCAGGCTAGCGTTCCCCAAACATCTGCTTGGGGAAACACAAATTTTACAGAAAATC
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CCCCAAAGAACCCAAGTACTGAAAAACCTACCCCAGTTTTACCAGCCCCAGCACCCCCGG
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TACAATCCTCAATGCCATGGTCTGGAACGCCTGAACAATACGAGAAATTCTTAAACCAAA
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GTCTCGGATGCTCTGATTGCGTTGTCAAAACTGGACCAAAAGTTATAGAGTATAAATACG
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TGGAGGAATGGCGACAGAGGCGGGAATACGTGATTAACCGAATCAAGAAAGCCCAGGAAG
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CGTAATAATATATCGATAAATTTTGCTGCGTTTTTTTATTATAAGAAAATGCTTTTTGCT
ACGATGGGTTTACAAAAGGCGTTTAAGCCTTAATTTTCTAGCTATGTTAAAGAGCTTAAG
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TTAATTTTGCCAACCAATTTAAAGTATGCTTTTTCGTCAAATTTTTGTGCATTTGTCAAA
TGGTTTATTTCAGCTTTTAAATATGGTGATAGCGAAAAAATTTATTTTTCTAAATTTAAA
AGAATTTTCTATTTTTTTAGATGACCCAATATTCAAAAATAAAAACAAAACCTCAAAAAG
ACAAATTAAAATACTTAAATGTTGCCATAGAGCTAAAAAATCAAATATTCTTAATTTTTT
GTGTTAATATCAGGGTCTATGTAAAGTGCCTAATTGTTTTTCTAATCCGCCAGCATATAT
TATAACTAATTTTTGGATTTGACCACGAGCAAGTCGTTTTTTACATTTAAGATTCAAATT
TTAAAACCTTAAGATTAATTAGATGATTTTAATTACAAAAAAGTAAATCTTCGTCATTAA
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AAATGCACATTTTTTTACGAACTTTGAAGTTTTCGAAATGGCATAGTTTAACTGATGGCA
TTTATTTATGTCTGGTTATTGAATTATTATTATTATCGTTAACCCTTTTTGGGCAATGTT
AGTATTCTTTCGCCAATAATAATATGTATGTCTGTCTGTTTTGTACTCGTCAAATCTGTG
TGGTAAAGTCACAGCTGCGAATAAGTTCATTCCATATTTTTGAATGAAAAAAAAA
| ProSiteProfiles |
RRM_dom (IPR000504) - T[2-72] 16.756 - T[78-148] 11.998 |
| Gene3D |
Nucleotide-bd_a/b_plait_sf (IPR012677) - T[2-71] 2.7E-20 - T[72-156] 2.6E-14 |
| SMART |
RRM_dom (IPR000504) - T[3-68] 2.8E-20 - T[79-144] 1.1E-7 |
| SUPERFAMILY |
RBD_domain_sf (IPR035979) - T[3-150] 8.79E-33 |
| Pfam |
RRM_dom (IPR000504) - T[4-65] 4.7E-15 - T[80-141] 5.3E-8 |
| Gene3D |
TPR-like_helical_dom_sf (IPR011990) - T[324-462] 8.3E-11 |
| SUPERFAMILY |
TPR-like_helical_dom_sf (IPR011990) - T[334-444] 2.74E-10 |
| ProSiteProfiles |
Znf_CCCH (IPR000571) - T[1111-1138] 9.638 - T[1254-1282] 11.131 |
| SUPERFAMILY |
Znf_CCCH_sf (IPR036855) - T[1255-1286] 1.0E-5 |
| SUPERFAMILY |
Znf_C2H2_sf (IPR036236) - T[1329-1361] 4.76E-7 |
| Protein Name | Identity | Bit Score | e-value |
|---|---|---|---|
| RBM4_HUMAN | 32.589 % | 121 | 2.09E-29 |
| Z3H7B_HUMAN | 36 % | 348 | 1.16E-101 |
| Z3H7A_HUMAN | 37.112 % | 374 | 1.19E-110 |
